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jurgiraud

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eval

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{ "en": "We applied a new MDS technique which projects supplementary sequences onto a sequence space of reference and allows comparison of sequences from different species.", "fr": "Nous avons appliqué une nouvelle technique MDS qui projette des séquences supplémentaires sur un espace de référence et permet ainsi la comparaison des séquences de différentes espèces." }

{ "en": "However, the signaling pathways involved in its overexpression and its role in this disease remains unclear.", "fr": "Cependant, les voies de signalisation impliquées dans sa surexpression et le rôle qu'il joue au sein de cette maladie demeurent méconnus." }

{ "en": "The DNA chips technology was used to detect changes at the gene expression level of the cell line used in this study after incubation with grape extracts, and to reveal certain pathways implicated in cellular response to phenolic compounds.", "fr": "La technologie des puces à ADN a été utilisée pour détecter des changements au niveau de l'expression des gènes dans les cellules HT-29 et pour révéler les voies de signalisation impliquées dans la réponse cellulaire aux composés phénoliques." }

{ "en": "New technologies allow mass sequencing of new species genomes and of environmental samples metagenomes.", "fr": "Les nouvelles technologies permettent le séquençage massif des génomes de nouvelles espèces et des métagénomes d'échantillons environnementaux." }

{ "en": "We present a new approach that combines high specificity of the probes with good sensitivity.", "fr": "Nous présentons une nouvelle approche qui combine une forte spécificité des sondes avec une bonne sensibilité." }

{ "en": "However, the analytical (concentration of viral particles, extraction method, random amplifications, sequencing method) and bioinformatics (for the production of contigs representing a virome) approaches introduce biases such as an over-representation of certain genomes and the formation of chimeric sequences composed of different organisms.", "fr": "Les démarches analytiques (concentration en particules virales, méthode extraction, amplifications aléatoires, méthode de séquençage) et bioinformatiques (pour la production de contigs qui représentent un virome), introduisent des biais comme une sur-représentation de certains génomes ainsi que la formation de séquences chimériques composées de différents organismes." }

{ "en": "The first introductive part highlights the properties of the genetic code and its usage bias but also the caracteristics of previous published codons models.", "fr": "La première partie introductive décrit la mise en évidence et les propriétés du code génétique, son biais d'usage et les diverses caractéristiques de précédents modèles de codons." }

{ "en": "Third, we model the diversity of VH CDR3 repertoires from Ig RNA sequencingdata in a fish vaccination model.", "fr": "Enfin, nous nous intéressons à la modélisation de la diversité des répertoiresde chaîne lourde des Igs, à partir de données de séquençage de CDR3, dans unmodèle de vaccin chez le poisson." }

{ "en": "Sequence data, in particular those referring to whole pathogen genomes, are very relevant not only in the epidemiological context but also in improving the understanding of disease pathogenesis and host responses.", "fr": "Les données sur les séquences, en particulier celles se référant au génome entier des agents pathogènes, s'avèrent très pertinentes tant dans le contexte épidémiologique que dans l'amélioration de la compréhension de la pathogenèse des maladies et des réponses de l'hôte." }

{ "en": "Before that, it was necessary to manually analyse these metabolic networks in order to extract each logic gate.", "fr": "Auparavant, il était nécessaire d'analyser manuellement ces réseaux métaboliques pour extraire chaque porte." }

{ "en": "In conclusion, this work provides a novel tool and original analytical methodologies thus contributing to the emerging field of integrative biology and indispensable for a better understanding of complex pathophysiological processes.", "fr": "En conclusion, ces travaux s'intègrent totalement à l'actuel développement de la biologie intégrative, indispensable à la résolution des mécanismes physiopathologiques. Un objectif central en biologie est de comprendre la relation entre le génotype et le phénotype." }

{ "en": "Even those proteins that participate in a well-studied biological process e.g., the Krebs cycle may have unexpected interaction partners or functions which are unrelated to that process.", "fr": "Même les protéines participant à des mécanismes connus comme le cycle de Krebs peuvent avoir des partenaires d'interaction inattendus et des fonctions sans rapport avec ce mécanisme." }

{ "en": "If we consider a \"fixed\" gene, the mechanical constraints induced by this \"fixed\" gene are very important and the overlapping gene has very little flexibility.", "fr": "Si on considère un gène \" fixe \", les contraintes mécaniques induites par ce gène sont très importantes et le gène chevauchant dispose de très peu de flexibilité." }

{ "en": "Furthermore, in opposition to what was widely believed in the neuroscience community, our model directly indicates that the endocannabinoid system supports bidirectional changes of the synaptic weight (increase and decrease).", "fr": "En outre, contrairement à ce qui était largement admis dans la communauté des neurosciences, notre modèle indique directement que le système endocannabinoïde contrôle les changements du poids synaptique de façon bi-directionnelle (augmentation et diminution)." }

{ "en": "The phylogenetic tree indicated two distinct clusters corresponding to two parallel outbreaks.", "fr": "L'arbre phylogénétique a mis en évidence deux clusters distincts indiquant la présence de deux épidémies parallèles." }

{ "en": "The deduced model is then used to build a controller that stabilizes the quadrotor and guarantees adequate trajectory tracking.", "fr": "Le modèle déduit est ensuite utilisé pour construire un contrôleur qui stabilise le quadrotor et garantit un suivi de trajectoire adéquat." }

{ "en": "The objective of this thesis work was therefore to explore the specificities of clouds as particular microbial habitats, like oases in a desert atmosphere.", "fr": "L'objectif de ce travail de thèse était donc d'explorer les spécificités des nuages comme habitats microbiens particuliers, comme des oasis dans une atmosphère désertique." }

{ "en": "Comparative genomics is an important tool to better understand the different between species.", "fr": "La génomique comparative est une discipline importante pour la compréhension de l'évolution du vivant." }

{ "en": "OMICS is the term used to designate new biological sciences investigating a large group of molecules in biological samples.", "fr": "Introduction Les OMICS désignent les nouvelles sciences biologiques explorant un grand groupe de molécules dans des échantillons biologiques." }

{ "en": "These proposed methods require a simple combination of sensors and take into account realistic assumption like the longitudinal speed variation.", "fr": "Les méthodes proposées nécessitent une combinaison simple de capteurs et prennent en compte des hypothèses réalistes telles que la variation de vitesse longitudinale." }

{ "en": "We grouped closely related sequences and by measuring the correlation between different parameters of mutations, we have shown that most of the errors were introduced during PCR amplification.", "fr": "En mesurant les corrélations entre les différents paramètres des erreurs, nous avons observé que la plupart des erreurs sont produites pendant l'amplification par PCR." }

{ "en": "The VapC7 and VapC10 toxine, cleave respectively tRNAfMet et two tARNSer in E. coli, therefore allowing, a global o partial inhibition of translation.", "fr": "Les toxines VapC7 et VapC10, clivent respectivement l'ARNtfMet et deux ARNtSer d'E. coli permettant ainsi, une inhibition globale ou partielle de la traduction." }

{ "en": "Finally, a third part will be focused on the conservation genomics of the dwarf sloth (Bradypus pygmaeus), which is endemic to the island of Escudo de Veraguas in the Bocas del Toro archipelago of Panama. We will study the genetic structure and evolutionary forces driving morphological differentiation between this island species and the mainland three-toed sloths of its sister-species (Bradypus variegatus).", "fr": "Enfin, dans une troisième partie axée sur la génomique de la conservation du paresseux nain (Bradypus pygmaeus) endémique de l'île d'Escudo de Veraguas dans l'archipel de Bocas del Toro au Panama, nous étudierons la structure génétique et les forces évolutives à l'origine de la différenciation morphologique entre cette espèce insulaire et les paresseux à trois doigts continentaux de son espèce soeur (Bradypus variegatus)." }

{ "en": "In a collection of 130 field isolates, we were able to identify 20 MT that are grouped into 4 distinct MALDI-groups.", "fr": "Dans une collection de 130 isolats de terrain, nous avons ainsi pu identifier 20 MT qui se regroupent en 4 MALDI-groupes distincts." }

{ "en": "A first work in the field of modelisation of biological systems, proposes to find simple regulatory networks which have the ability to optimise their response when they are submitted to a periodic stimulation.", "fr": "Un premier travail théorique qui s'inscrit dans le cadre de la modélisation des systèmes biologiques se propose de trouver des réseaux de régulation simples qui puissent répondre de manière optimale lorsqu'ils sont soumis à une stimulation périodique." }

{ "en": "Breast and ovarian cancers appear in 5 to 10% of cases in a context of genetic predisposition, of which only a small proportion is explained by the presence of a pathogenic variant on the BRCA1, BRCA2 and PALB2 genes.", "fr": "Les cancers du sein et de l'ovaire apparaissent dans 5 à 10% dans un contexte de prédisposition génétique, dont seule une faible part est expliquée par la présence d'un variant pathogène sur les gènes BRCA1, BRCA2 et PALB2." }

{ "en": "The ultimate goal is to apply these methods to the indexing of rice genomes in order to facilitate the analysis of all the studies and activities of the GenomeHarvest project.", "fr": "Le but ultime est d'appliquer ces méthodes à l'indexation des génomes du riz afin de faciliter l'analyse de l'ensemble des études et activités du projet GenomeHarvest." }

{ "en": "The Portal Pilot is promoted by the German Ministry for Science and Education.", "fr": "Le portail pilote de neuro-informatique est promu par le Ministère allemand de la science et l'éducation." }

{ "en": "Our method is based on the construction of a linear model to establish scores of differences between samples before and after treatment.", "fr": "Notre méthode repose sur la construction d'un modèle linéaire permettant d'établir des scores de différences entre les échantillons avant et après traitement." }

{ "en": "Transposable elements (TE) are DNA sequences able to move in all genomes depending on conditions.", "fr": "Les éléments génétiques transposables (ET) sont des séquences d'ADN capables de se déplacer dans tous lesgénomes sous certaines conditions." }

{ "en": "The traditional analytical methods are declined either from a global point of view (holistic) where the complexity is separated into distinct elements to represent the behaviour of only by only one entity (reductionism).", "fr": "Les méthodes analytiques traditionnelles se posent soit d'un point de vue global (holiste) soit découpent la complexité en éléments distincts pour représenter le comportement du système par une seule entité (réductionniste)." }

{ "en": "In this thesis, we study magnetic or superconducting phases of various models representative of strongly correlated systems.", "fr": "Dans cette thèse, nous traitons des phases magnétiques ou supraconductrices de différents modèles représentatifs de systèmes fortement corrélés." }

{ "en": "Using the OVA immunization model, we have shown that IL-1R1 is important for the activation of Tfh cells but also Tfr cells while IL-1R2 and IL-1Ra prevent the activation of Tfr cells.", "fr": "En utilisant le modèle d'immunisation à l'OVA, nous avons montré que l'IL-1R1 est important pour l'activation des cellules Tfh mais aussi des cellules Tfr alors que l'IL-1R2 et l'IL-1Ra empêchent l'activation des cellules Tfr." }

{ "en": "The approach is logical and learning is considered as a search problem in a partially ordered space. The hidden structure of the data relates the statements of the representation language and their extension in the universe of instances, in an intension/extension lattice. I first discuss how using the hidden structure allows to reduce the search in supervised concentp learning problems.", "fr": "On se place ici dans le cas où un problème d'apprentissage passe par l'exploration d'un \"Espace de Recherche\", constitué de représentations formées dans un certain langage d'énoncés. La structure cachée liant \"énoncés\" et sous-ensembles d'\"objets\", représentable dans un treillis intension/extension, permet en particulier de réduire l'espace de recherche dans les problèmes d'apprentissage supervisé." }

{ "en": "Therefore, an appropriate outgroup must be unambiguously outside the clade of interest in the phylogenetic study.", "fr": "Par conséquent, un groupe externe approprié doit être en dehors du clade d'intérêt de l'étude phylogénétique." }

{ "en": "Besides, to our knowledge, no tool was able to do all key steps of any comparative genomics study.", "fr": "De plus, à notre connaissance, aucun logiciel ne permettait d'effectuer toutes les étapes clés d'une étude de génomique comparative." }

{ "en": "This method is based on two steps. First, the recruitment and assembly of reads by mapping metagenomic reads on a distant reference genome, and second, the de novo assembly of the missing regions, allowed by the development of an improved version of the software MindTheGap.", "fr": "Cette méthode se déroule en deux temps : le recrutement et l'assemblage de lectures par alignement sur un génome de référence distant, puis l'assemblage de novo ciblé des régions manquantes, permis par des développements complémentaires apportés au logiciel MindTheGap." }

{ "en": "This thesis assessed the potential bias of ancient DNA by 1) evaluating of the effect of removing short DNA fragments, and 2) comparing communities revealed by co-extracted DNA and RNA in five deep-sea sites.", "fr": "Dans un second temps, nous avons donc estimé le biais de l'ADN ancien en 1) évaluant l'effet de l'élimination de courts fragments d'ADN, et 2) en comparant les communautés révélées par l'ADN et l'ARN co-extraits." }

{ "en": "The unregulated cell division that marks cancer development requires increased protein synthesis for cancer cell function and survival.", "fr": "La division cellulaire non régulée qui marque le développement du cancer nécessite une synthèse protéique accrue pour la fonction et la survie des cellules cancéreuses." }

{ "en": "In this document, we study both problems focusing on three aspects.", "fr": "Dans ce document, nous ferons l'étude de ces deux problèmes en se concentrant sur trois axes." }

{ "en": "During my thesis, I explored various aspects of piRNA cluster biology, usingthe flamenco locus as a model.", "fr": "Durant ma thèse, j'ai exploré différents aspects de la biologie des clusters de piRNAs, en prenant comme modèle d'étude le locus flamenco." }

{ "en": "More than 30% of new commercialized drugs target GPCRs.", "fr": "Plus de 30% des nouveaux médicaments mis sur le marché ciblent des RCPG." }

{ "en": "Firstly, SOX8 gene was found mutated in a cohort of 20 patients with disorder of sex development and male or female infertility. Similarly, to NR5A1, SOX8 appears to be a novel regulator of gonadal development and function.", "fr": "Nous avons découvert 20 mutations dans le gène SOX8, chez des patients atteints de trouble du développement sexuel ou d'infertilité masculine ou féminine, qui apparaît comme un régulateur du développement et de la fonction gonadique." }

{ "en": "Specific localization patterns have been observed and such asymmetric distributions are of functional importance for the spatial regulation of gene expression.", "fr": "Pour certains gènes, une distribution asymétrique et localisée des transcripts peut être observée. Ce phénomène participe à la régulation de l'expression génétique." }

{ "en": "By comparing the genetic and phenotypic diversity of the strains, we found that more than two-thirds of the total genes coding for secreted proteins, potentially contributing to pathogenicity, were consistently present in a core secretome, unrelated to the different levels of strain aggressiveness.", "fr": "En comparant la diversité génétique et phénotypique des souches, nous avons trouvé que plus des deux tiers du total des gènes codant pour des protéines sécrétées, contribuant potentiellement à la pathogénicité, étaient systématiquement présents dans un core sécrétome, sans relation avec les différents niveaux d'agressivités des souches." }

{ "en": "P. gingivalis comparative genomics showed a correlation between the number of contigs in draft genomes and genomic repeats, mainly insertion sequences.", "fr": "La génomique comparative de P. gingivalis a démontré une corrélation entre le nombre de contigs dans les génomes draft de cette espèce et les répétitions génomiques, notamment des séquences d'insertion." }

{ "en": "Sequences are then classified without alignment, a new method of analysing the results of a BLAST search makes it possible to directly compute a distance matrix then used by a partitioning algorithm.", "fr": "Les séquences rapatriées ont alors été réparties en classes, sans alignement préalable. En effet, l'analyse des résultats de BLAST permet de créer une matrice de distances directement utilisable par un algorithme de partitionnement." }

{ "en": "To facilitate this step, bio-informaticians annotate these data with knowledge from various data sources chosen by geneticists.", "fr": "Pour faciliter cette étape, les bioinformaticien annotent ces données avec du savoir provenant de sources de données variées choisies par les généticiens." }

{ "en": "Anatomical and molecular pathologists play a key role in the process.", "fr": "Les anatomopathologistes jouent un rôle clé dans l'initiation de cette démarche." }

{ "en": "In this context we developed the architecture GeCo, a solution supported by a computerized database and its web portal, and whose power lies in its ability to determine the statistical values of genes and genome.", "fr": "Dans cette optique nous avons développé l'architecture GeCo, solution soutenue par une base de données automatisée et son portail web, et dont la puissance repose sur son aptitude à déterminer les valeurs statistiques des gènes et du génome complet." }

{ "en": "However, its role in high content screening is only beginning to be realised.", "fr": "Cependant, son rôle dans le criblage à haut contenu ne fait que commencer à être réalisé." }

{ "en": "It is therefore essential to improve detection tools based on short read sequencing technologies used in a medical context.", "fr": "Il est donc essentiel d'améliorer les outils de détection basés sur les technologies de séquençage de courtes lectures utilisées dans un contexte médical." }

{ "en": "Primary neurons were less capable than MEFs to control the viral replication due to a delayed IFN response.", "fr": "Cette étude a montré que la capacité des neurones primaires à limiter la réplication virale est moindre que celle des MEFs en raison d'un retard à l'induction de la réponse IFN." }

{ "en": "As a result, most biological evolving objects (genes, genomes, communities) can be composed of parts from different phylogenetic origins and can be described as composites.", "fr": "Ainsi, la plupart des objets biologiques évoluant peuvent être composés de parties d'origines phylogénétiques différentes et décrits comme composites." }

{ "en": "A subset of the original OBO ontologies has started the OBO Foundry, which leads the OBO efforts since 2007.", "fr": "Un sous-ensemble des ontologies OBO originales a démarré la fonderie OBO, qui dirige les efforts OBO depuis 2007." }

{ "en": "More precisely, we are interested in nucleic sequence analysis.", "fr": "Nous nous intéressons plus particulièrement à l'analyse de séquences nucléiques." }

{ "en": "This pathologic arterial remodelling is characterized by the accumulation of SMC showing synthetic phenotype associated with an endothelial dysfunction.", "fr": "Ce remodelage pathologique induit par l'HCY est dominé par l'accumulation de CML présentant un phénotype synthétique associée à une dysfonction endothéliale." }

{ "en": "Finally, we propose a data-annotation approach to enforce our access control model, and show that our solution incurs reasonable overhead with respect to the optimal solution which consists in materializing the user's accessible subgraph to enforce our access control model, and show that our solution incurs reasonable overhead with respect to the optimal solution which consists in materializing the user's accessible subgraph The main goal of this thesis is the development, improvement and evaluation of methods to process massively sequenced data, mainly short and long RNA-sequencing reads, to eventually help the community to answer some biological questions, especially in the transcriptomic and alternative splicing contexts.", "fr": "Enfin, nous proposons une approche d'annotation de données pour appliquer notre modèle de contrôle d'accès, et nous montrons que notre implémentation entraîne un surcoût raisonnable durant l'exécution L'objectif principal de cette thèse est le développement, l'amélioration et l'évaluation de méthodes de traitement de données massives de séquençage, principalement des lectures de séquençage d'ARN courtes et longues, pour éventuellement aider la communauté à répondre à certaines questions biologiques, en particulier dans les contextes de transcriptomique et d'épissage alternatif." }

{ "en": "In particular, BrumiR-core is a de novo algorithm based on a de Bruijn graph approach that is able to identify miRNAs directly and exclusively from sRNA-seq data.", "fr": "En particulier, BrumiR-core est un algorithme de novo basé sur une approche de graphe de de Bruijn qui est capable d'identifier les miARNs directement et exclusivement à partir de données de sARN-seq." }

{ "en": "Together with the prevalent white matter lesions reported in patients, the abnormalities in mouse myelin proteins suggest the implication of oligodendrocytes (OL) in DM1 neuropathology.", "fr": "Cette dérégulation protéique dans les DMSXL, associée aux lésions de la substance blanche décrites chez les malades, suggère l'implication des OL dans la neuropathologie de la DM1." }

{ "en": "From 2007 to 2013, many companies have offered services assesing associated risk with human public health in the world especially in the United States.", "fr": "De 2007 à 2013, de nombreuses sociétés se sont développées afin de proposer des services évaluant les risques associés à la santé humaine dans le monde et plus particulièrement aux États-Unis." }

{ "en": "The flux values indicate that, major part of serine derived phosphatidylethanolamine (PE) is formed via serine decarboxylation, whereas the phosphatidylserine (PS) is mainly predominated by base-exchange reactions.", "fr": "Les valeurs des flux indiquent que plus grande partie de la PE dérivée de la sérine est formée par décarboxylation, alors que la synthèse de PS est majoritairement effectuée par des réactions d'échange de base." }

{ "en": "For example, this deeper understanding of sequence-structure relationships will enable us to anticipate structural perturbations exerted by sequence mutations, and subsequently, the rational design of IDPs with tailored properties for biotechnological applications.", "fr": "En effet, ceci nous permettra, par exemple, d'anticiper les perturbations structurales dues aux mutations et, in fine, à la conception rationnelle d'IDPs spécifiques pour des applications biotechnologiques." }

{ "en": "These networks enable to study without a priori the adaptative and evolutionary processes shaping the taxonomical and functional diversity of protists in the environment This work relates to the pharmacological valorization of medicinal plants from Reunion island.", "fr": "Ces réseaux nous permettent d'étudier sans a priori les processus adaptatifs et évolutifs qui façonnent la diversité taxonomique et fonctionnelle des protistes dans l'environnement. Ces travaux de thèse portent sur la valorisation pharmacologique de plantes médicinales de La Réunion." }

{ "en": "They are clearly monophyletic, and divided into two superfamilies.", "fr": "Il est clairement monophylétique, et est divisé en deux super-familles." }

{ "en": "This response can be maintained for many years, especially if patients use intermittent catheterization, with excellent tolerance.", "fr": "Cette réponse peut se maintenir pendant de nombreuses années, notamment si les patients utilisent le cathétérisme intermittent, et cela avec une excellente tolérance." }

{ "en": "In the present work, we characterized a third death inducing amyloid signaling pathway involving a NLR, PNT1, and an effector, HELLP, based on the PP amyloid motif previously identified in Chaetomium globosum.", "fr": "Dans ce travail nous avons caractérisé une troisième voie de signalisation amyloïde induisant la mort impliquant un NLR, PNT1, et un effecteur, HELLP, basé sur le motif amyloïde PP précédemment identifié chez Chaetomium globosum." }

{ "en": "The predictive criteria were subsequently used to search for potentially polymorphic coding minisatellites in the human genome.", "fr": "Les critères prédictifs ont également été appliqués à l'identification de minisatellites codants potentiellement polymorphes dans le génome humain." }

{ "en": "Whereas a purely geometric approach is suitable for planning motions of other types of systems that are more easily controllable, aerial robots require to consider dynamics in order to ensure the feasibility of the planned trajectory.", "fr": "Considérant qu'une approche purement géométrique est adapté pour les motions de planification d'autres types de systèmes qui sont plus facilement contrôlables, robots aériennes exigent de considérer la dynamique afin d'assurer la faisabilité de la trajectoire prévue." }

{ "en": "Moreover, for those biologists who wish to learn programming, such an environment provides an appropriate support with domain examples as well as incremental programming features.", "fr": "Pour les biologistes désirant apprendre la programmation, un tel environnement constitue un support d'apprentissage adapté comportant des exemples centrés sur leur domaine." }

{ "en": "From differential analysis to identify biomarkers, to functional analysis for finding new therapeutic targets, proteomics bring new comprehensive information for a better understanding of the molecular basis of oncology and new perspectives for the clinic.", "fr": "De l'approche différentielle destiné à l'identification de marqueurs à l'analyse fonctionnelle pour la mise en évidence de cibles thérapeutiques, la protéomique apporte de nouvelles données fondamentales pour la compréhension des mécanismes de la cancérogenèse mammaire et des perspectives pour la clinique." }

{ "en": "The goal of RCPred is to find the best combination among these inputs.", "fr": "L'objectif de RCPred est de trouver les meilleures combinaisons possibles parmi ces entrées." }

{ "en": "Understanding the mechanisms that drove the evolution of this receptor family should allow a better knowledge of sequence-structure-function relationships of the different sub-families.", "fr": "Comprendre les mécanismes évolutifs qui ont conduit à la diversité de cette famille de récepteurs pourrait permettre une meilleure connaissance des relations séquence-structure-fonction des différentes sous-familles." }

{ "en": "Previously, a growth defect in thermosensitive mutants of the FACT complex had been observed.", "fr": "Jusqu'alors, un défaut de croissance chez les mutants thermosensibles du complexe FACT avait pu être observé." }

{ "en": "The aim of this study was to investigate for bacteriocins producing bacteria and types of bacteriocins they can produce.", "fr": "Le but de cette étude est de rechercher les bactéries productrices de bactériocines et les types de bactériocines qu'elles peuvent produire." }

{ "en": "Modelling the geometrical structure of high-dimensional datasets is a fundamental problem for many fields of science that increasingly produce large-scale data with thousands of variables.", "fr": "Modéliser la structure géométrique des données de grande dimension est un problème fondamental pour de nombreux domaines scientifiques qui produisent de plus en plus de données à grande échelle avec des milliers de variables." }

{ "en": "Using a transcriptomic analysis, derived from a PC3c prostate tumour cells line model over expressing TMPRSS2:ERG fusion, we have identified two genes regulated by the fusion:Plexin A2 (PLXNA2), already described in the literature by the team (Tian et al. Oncogene.2014), and also Fascin-1 (FSCN1) coding for a protein that groups actin filaments together and isinvolved in migration and tumour invasion phenomena through invadopods formation.", "fr": "Par une analyse transcriptomique, à partir d'un modèle de surexpression de la fusionTMPRSS2:ERG dans une lignée de cellules tumorales prostatiques humaines (PC3c) capablesd'induire des lésions osseuses in vivo, nous avons identifié deux gènes régulés par la fusionparmi lesquels Plexine A2 (PLXNA2), déjà décrit par l'équipe (Tian et al. Oncogene.2014), etégalement Fascine-1 (FSCN1) codant pour une protéine qui permet de regrouper les filamentsd'actine et impliqué dans les phénomènes de migration et invasion tumorale grâce à laformation d'invadopodes." }

{ "en": "Such a partitioning technique allows a balanced computational loads over the distributed collection of machines and replace the default arbitrary partitioning technique of MapReduce.", "fr": "Une telle technique de partitionnement permet un équilibrage des charges de calcul sur une collection de machine distribuée et de remplacer la technique de partitionnement par défaut de MapReduce." }

{ "en": "The study of cDCs-deficient mice allowed me to demonstrate the existence of a DCs-mediated control of the NK cells homeostasis.", "fr": "L'étude de souris déficientes en cDCs m'a également permis de démontrer l'existence d'un contrôle de l'homéostasie des NK par les DCs." }

{ "en": "Genome-wide association (GWA) studies consist in testing up to one million (or more) single nucleotide polymorphisms (SNPs) for their association with cancer risk in thousands of individuals, without requiring any prior knowledge on the functional significance of these variants.", "fr": "Les études d'association à grande échelle consistent à étudier la corrélation de plusieurs millions de polymorphismes nucléotidiques avec un risque de cancer chez des milliers d'individus, sans avoir besoin de connaissances préalables sur la fonction biologique de ces variants." }

{ "en": "It is important to beable to identify exact positions and types of these variants to be able totrack cancer development or select the most appropriate treatment for thepatient.", "fr": "Il est important d'identifier les positions exactes etles types de ces variantes pour pouvoir suivre l'évolution du cancer etchoisir le traitement le plus approprié pour le malade." }

{ "en": "In the GIC EGR1 expression is abnormally elevated.", "fr": "Dans les CIG l'expression d'EGR1 est anormalement élevée." }

{ "en": "An in silico approach using MCPcouter on the TCGA data sets revealed that cDC1 represented the only DC subset associated with a prolonged overall survival in the majority of solid tumors.", "fr": "Une approche de bio-informatique a permis de révéler que les cDC1 représentent l'unique population de DC associée à une meilleure survie des patients dans la majorité des cancers du TCGA." }

{ "en": "These results show that Staf regulates the transcription of genes involved in various cellular pathways and via promoters harboring various architectures Knowledge Discovery in Databases is a recent field aiming at discovering new knowledge.", "fr": "Ces résultats mettent en évidence que Staf régule l'activité de gènes impliqués dans des processus cellulaires divers via des promoteurs à architectures variées. L'extraction de connaissances dans les bases de données est une discipline récente visant à la découverte de nouvelles connaissances." }

{ "en": "Based on the total transcriptome, we showed that parasites were younger in CM children suggesting a reduced circulation time of these isolates, as a consequence of greater adhesion to endothelial receptors.", "fr": "Basé sur le transcriptome total, nous avons montré que les parasites étaient plus jeunes chez les enfants CM suggérant un temps de circulation réduit de ces isolats, en conséquence à une adhérence plus grande aux récepteurs endothéliaux." }

{ "en": "The prevention of these errors is based on passive measures such as using specific small-bore connectors, and active measures such as reading Specific labelling which must be systematically affixed to the routes.", "fr": "La prévention de ces erreurs repose sur des mesures passives, telles que l'utilisation de connectiques spécifiques, ainsi que sur des mesures actives telle que la lecture de l'étiquetage qui doit être systématiquement apposé sur les voies." }

{ "en": "Rearrangement of TCR and Ig result of the juxtaposition by deletion of DNA segments separated on the germinal DNA.", "fr": "Les remaniements du TCR et des IG résultent de la juxtaposition par délétion de segments d'ADN séparés sur l'ADN germinal." }

{ "en": "These strategies were applied to the study of cysteine oxidation within the contexts of oxidative stress and redox homeostasis.", "fr": "Ces stratégies ont été appliquées à l'étude de l'oxydation des cystéines dans le cadre du stress oxydatif et de l'homéostasie redox." }

{ "en": "Then, we combined our gene order conservation approach with targetted sequence alignments on the dog genome to identify new canine protein coding genes.", "fr": "Dans un second projet, nous avons combiné notre approche de conservation de l'ordre des gènes entre deux génomes avec des alignements de séquences ciblés afin d'identifier des nouvelles structures de gènes canins codant pour des protéines." }

{ "en": "In 2006 the INCF was created and its central office established and set into operation at the Karolinska Institute, Stockholm, Sweden under the leadership of Sten Grillner.", "fr": "En 2006, le INCF a été créé et son bureau central établi et mis en service à l'Institut Karolinska à Stockholm en Suède sous la direction de Sten Grillner." }

{ "en": "All biological samples and some omics data required for this project have already been generated.", "fr": "Tous les échantillons biologiques et certaines données omics nécessaires à ce projet ont déjà été générés." }

{ "en": "In an intramacrophage context, esxU and esxT absence does not influence the intracellular behaviour of the ΔesxUT mutated strain, but prevents the disruption of the phagosomal membrane, keeping M. abscessus ΔesxUT in an unacidified phagosome.", "fr": "Dans les macrophages, leur absence n'influence pas le comportement intracellulaire de la souche mutée ΔesxUT, mais empêche la rupture de la membrane phagosomale, maintenant M. abscessus ΔesxUT dans un phagosome non acidifié." }

{ "en": "For example, it was used to show that: (1) nearly 70% of protein domain families have just one binding site and the remaining families have a small number of binding sites which suggests that DDIs often re-use the same binding sites; (2) over 80% of DFBSs interact with just one other type of protein domain family, and very few DFBSs interact with more than three different Pfam domain families, which indicates that most DFBSs are primarily monogamous in their structural relationships with other domains; (3) Pfam families often have secondary structure pairing preferences, which might be useful for the prediction of unknown DDIs; (4) when DFBSs are in fact re-used, focused docking improves significantly the docking predictions.", "fr": "Par exemple, KBDOCK a été utilisé pour montrer que: (1) après de 70% de familles de domaines protéiques n'ont qu'un seul DFBS et les autres familles en ont un petit nombre seulement, ce qui suggère que les DDIs re-utilisent souvent les mêmes sites de liaison; (2) plus de 80% de DFBSs interagissent avec une seule famille de domaines protéiques et les autres DFBSs interagissent avec un petit nombre de familles, ce qui indique que la plupart des DFBSs sont principalement monogames dans leur interactions avec les autres domaines protéiques; (3) les DFBSs impliqués dans des interactions présentent des régularités en terme de structure secondaire, ce qui pourrait servir comme un descripteur complémentaire dans la prédiction d'interaction; (4) lorsque les domaines re-utilisent leur DFBS, le docking orienté vient améliorer les prédictions." }

{ "en": "For this, we developed a program, Swelfe, that looks for repeats in genes, amino acid sequences and three dimensional structures of proteins.", "fr": "Pour cela, nous avons développé un programme, Swelfe, qui cherche les répétitions à la fois dans les gènes, les séquences d'acides aminés et les structures tridimensionnelles des protéines." }

{ "en": "Nevertheless, the role of the different DCs subtypes in the tumoral development stays poorly known.", "fr": "Malgré tout, le rôle des différents sous-types de DCs dans le développement tumoral reste mal connu." }

{ "en": "Analysis of the metabolic fingerprints generated was first performed on male mussels to rule out gender-related biological variability (which could hide the response to exposure).", "fr": "L'analyse des empreintes métaboliques générées a d'abord été effectuée sur les moules mâles afin d'écarter la variabilité biologique liée au sexe (susceptible de masquer la réponse à l'exposition)." }

{ "en": "Based on instantiation techniques used for instance in computer graphics and the repetitiveness of biological structures, we present a compression method which reduces the memory space required for plant architecture storage.", "fr": "Dans un second temps, en nous basant sur des techniques d'instanciations utilisées, par exemple, en infographie et sur la connaissance des propriétés de redondances au sein des structures biologiques, nous présentons une méthode de compression permettant de réduire l'espace mémoire nécessaire pour le stockage d'arborescences non-ordonnées." }

{ "en": "Three OCP families co-exist (OCPX, OCP1 and OCP2) in modern cyanobacteria.", "fr": "Trois familles d'OCP coexistent (OCPX, OCP1 et OCP2) dans les cyanobactéries modernes." }

{ "en": "Based on transcriptome analysis, we discovered non-reference events with high replicability.", "fr": "Sur la base de l'analyse du transcriptome, nous avons découvert des événements de non-référence avec une haute réplicabilité." }

{ "en": "A developed by a few teams in the world is to use the active immunisation against immunogens derived from cytokines, allowing the patient to develop by himself the neutralising anti-cytokine antibodies.", "fr": "Une idée originale développée par quelques équipes dans le monde, dont la nôtre, est d'utiliser l'immunisation active contre des immunogènes dérivés des cytokines, afin que les anticorps anti-cytokine soient produits par l'organisme du patient lui-même." }