Datasets:

Denis641

/

AdvTestNegatives

like 0

[ "def", "_handle_run", "(", "self", ",", "relpath", ",", "params", ")", ":", "args", "=", "self", ".", "_default_template_args", "(", "'run.html'", ")", "run_id", "=", "relpath", "run_info", "=", "self", ".", "_get_run_info_dict", "(", "run_id", ")", "if", "run_info", "is", "None", ":", "args", "[", "'no_such_run'", "]", "=", "relpath", "if", "run_id", "==", "'latest'", ":", "args", "[", "'is_latest'", "]", "=", "'none'", "else", ":", "report_abspath", "=", "run_info", "[", "'default_report'", "]", "report_relpath", "=", "os", ".", "path", ".", "relpath", "(", "report_abspath", ",", "self", ".", "_root", ")", "report_dir", "=", "os", ".", "path", ".", "dirname", "(", "report_relpath", ")", "self_timings_path", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "report_dir", ",", "'self_timings'", ")", "cumulative_timings_path", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "report_dir", ",", "'cumulative_timings'", ")", "artifact_cache_stats_path", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "report_dir", ",", "'artifact_cache_stats'", ")", "run_info", "[", "'timestamp_text'", "]", "=", "datetime", ".", "fromtimestamp", "(", "float", "(", "run_info", "[", "'timestamp'", "]", ")", ")", ".", "strftime", "(", "'%H:%M:%S on %A, %B %d %Y'", ")", "timings_and_stats", "=", "'\\n'", ".", "join", "(", "[", "self", ".", "_collapsible_fmt_string", ".", "format", "(", "id", "=", "'cumulative-timings-collapsible'", ",", "title", "=", "'Cumulative timings'", ",", "class_prefix", "=", "'aggregated-timings'", ")", ",", "self", ".", "_collapsible_fmt_string", ".", "format", "(", "id", "=", "'self-timings-collapsible'", ",", "title", "=", "'Self timings'", ",", "class_prefix", "=", "'aggregated-timings'", ")", ",", "self", ".", "_collapsible_fmt_string", ".", "format", "(", "id", "=", "'artifact-cache-stats-collapsible'", ",", "title", "=", "'Artifact cache stats'", ",", "class_prefix", "=", "'artifact-cache-stats'", ")", "]", ")", "args", ".", "update", "(", "{", "'run_info'", ":", "run_info", ",", "'report_path'", ":", "report_relpath", ",", "'self_timings_path'", ":", "self_timings_path", ",", "'cumulative_timings_path'", ":", "cumulative_timings_path", ",", "'artifact_cache_stats_path'", ":", "artifact_cache_stats_path", ",", "'timings_and_stats'", ":", "timings_and_stats", "}", ")", "if", "run_id", "==", "'latest'", ":", "args", "[", "'is_latest'", "]", "=", "run_info", "[", "'id'", "]", "content", "=", "self", ".", "_renderer", ".", "render_name", "(", "'base.html'", ",", "args", ")", ".", "encode", "(", "\"utf-8\"", ")", "self", ".", "_send_content", "(", "content", ",", "'text/html'", ")" ]

[ "def", "_update_simulation_end_from_lsm", "(", "self", ")", ":", "te", "=", "self", ".", "l2g", ".", "xd", ".", "lsm", ".", "datetime", "[", "-", "1", "]", "simulation_end", "=", "te", ".", "replace", "(", "tzinfo", "=", "utc", ")", ".", "astimezone", "(", "tz", "=", "self", ".", "tz", ")", ".", "replace", "(", "tzinfo", "=", "None", ")", "if", "self", ".", "simulation_end", "is", "None", ":", "self", ".", "simulation_end", "=", "simulation_end", "elif", "self", ".", "simulation_end", ">", "simulation_end", ":", "self", ".", "simulation_end", "=", "simulation_end", "self", ".", "_update_card", "(", "\"END_TIME\"", ",", "self", ".", "simulation_end", ".", "strftime", "(", "\"%Y %m %d %H %M\"", ")", ")" ]

[ "def", "_generate_noise_system", "(", "dimensions_tr", ",", "spatial_sd", ",", "temporal_sd", ",", "spatial_noise_type", "=", "'gaussian'", ",", "temporal_noise_type", "=", "'gaussian'", ",", ")", ":", "def", "noise_volume", "(", "dimensions", ",", "noise_type", ",", ")", ":", "if", "noise_type", "==", "'rician'", ":", "# Generate the Rician noise (has an SD of 1)", "noise", "=", "stats", ".", "rice", ".", "rvs", "(", "b", "=", "0", ",", "loc", "=", "0", ",", "scale", "=", "1.527", ",", "size", "=", "dimensions", ")", "elif", "noise_type", "==", "'exponential'", ":", "# Make an exponential distribution (has an SD of 1)", "noise", "=", "stats", ".", "expon", ".", "rvs", "(", "0", ",", "scale", "=", "1", ",", "size", "=", "dimensions", ")", "elif", "noise_type", "==", "'gaussian'", ":", "noise", "=", "np", ".", "random", ".", "randn", "(", "np", ".", "prod", "(", "dimensions", ")", ")", ".", "reshape", "(", "dimensions", ")", "# Return the noise", "return", "noise", "# Get just the xyz coordinates", "dimensions", "=", "np", ".", "asarray", "(", "[", "dimensions_tr", "[", "0", "]", ",", "dimensions_tr", "[", "1", "]", ",", "dimensions_tr", "[", "2", "]", ",", "1", "]", ")", "# Generate noise", "spatial_noise", "=", "noise_volume", "(", "dimensions", ",", "spatial_noise_type", ")", "temporal_noise", "=", "noise_volume", "(", "dimensions_tr", ",", "temporal_noise_type", ")", "# Make the system noise have a specific spatial variability", "spatial_noise", "*=", "spatial_sd", "# Set the size of the noise", "temporal_noise", "*=", "temporal_sd", "# The mean in time of system noise needs to be zero, so subtract the", "# means of the temporal noise in time", "temporal_noise_mean", "=", "np", ".", "mean", "(", "temporal_noise", ",", "3", ")", ".", "reshape", "(", "dimensions", "[", "0", "]", ",", "dimensions", "[", "1", "]", ",", "dimensions", "[", "2", "]", ",", "1", ")", "temporal_noise", "=", "temporal_noise", "-", "temporal_noise_mean", "# Save the combination", "system_noise", "=", "spatial_noise", "+", "temporal_noise", "return", "system_noise" ]

[ "def", "NewFromContent", "(", "cls", ",", "content", ",", "urn", ",", "chunk_size", "=", "1024", ",", "token", "=", "None", ",", "private_key", "=", "None", ",", "public_key", "=", "None", ")", ":", "aff4", ".", "FACTORY", ".", "Delete", "(", "urn", ",", "token", "=", "token", ")", "with", "data_store", ".", "DB", ".", "GetMutationPool", "(", ")", "as", "pool", ":", "with", "aff4", ".", "FACTORY", ".", "Create", "(", "urn", ",", "cls", ",", "mode", "=", "\"w\"", ",", "mutation_pool", "=", "pool", ",", "token", "=", "token", ")", "as", "fd", ":", "for", "start_of_chunk", "in", "range", "(", "0", ",", "len", "(", "content", ")", ",", "chunk_size", ")", ":", "chunk", "=", "content", "[", "start_of_chunk", ":", "start_of_chunk", "+", "chunk_size", "]", "blob_rdf", "=", "rdf_crypto", ".", "SignedBlob", "(", ")", "blob_rdf", ".", "Sign", "(", "chunk", ",", "private_key", ",", "public_key", ")", "fd", ".", "Add", "(", "blob_rdf", ",", "mutation_pool", "=", "pool", ")", "return", "urn" ]

[ "def", "_proc_accept_header", "(", "self", ",", "request", ",", "result", ")", ":", "if", "result", ":", "# Result has already been fully determined", "return", "try", ":", "accept", "=", "request", ".", "headers", "[", "'accept'", "]", "except", "KeyError", ":", "# No Accept header to examine", "return", "# Obtain the best-match content type and its parameters", "ctype", ",", "params", "=", "best_match", "(", "accept", ",", "self", ".", "types", ".", "keys", "(", ")", ")", "# Is it a recognized content type?", "if", "ctype", "not", "in", "self", ".", "types", ":", "return", "# Get the mapped ctype and version", "mapped_ctype", ",", "mapped_version", "=", "self", ".", "types", "[", "ctype", "]", "(", "params", ")", "# Set the content type and version", "if", "mapped_ctype", ":", "result", ".", "set_ctype", "(", "mapped_ctype", ",", "ctype", ")", "if", "mapped_version", ":", "result", ".", "set_version", "(", "mapped_version", ")" ]

[ "def", "unbind", "(", "self", ")", ":", "for", "variable", "in", "self", ".", "variables", ":", "self", ".", "__unbind_variable", "(", "variable", ")", "for", "result", "in", "self", ".", "results", ":", "self", ".", "__unbind_result", "(", "result", ")" ]

[ "def", "online_merge_medium", "(", "self", ",", "medium_attachment", ",", "source_idx", ",", "target_idx", ",", "progress", ")", ":", "if", "not", "isinstance", "(", "medium_attachment", ",", "IMediumAttachment", ")", ":", "raise", "TypeError", "(", "\"medium_attachment can only be an instance of type IMediumAttachment\"", ")", "if", "not", "isinstance", "(", "source_idx", ",", "baseinteger", ")", ":", "raise", "TypeError", "(", "\"source_idx can only be an instance of type baseinteger\"", ")", "if", "not", "isinstance", "(", "target_idx", ",", "baseinteger", ")", ":", "raise", "TypeError", "(", "\"target_idx can only be an instance of type baseinteger\"", ")", "if", "not", "isinstance", "(", "progress", ",", "IProgress", ")", ":", "raise", "TypeError", "(", "\"progress can only be an instance of type IProgress\"", ")", "self", ".", "_call", "(", "\"onlineMergeMedium\"", ",", "in_p", "=", "[", "medium_attachment", ",", "source_idx", ",", "target_idx", ",", "progress", "]", ")" ]

[ "def", "update", "(", "self", ",", "data", ")", ":", "self", ".", "_md", ".", "update", "(", "data", ")", "bufpos", "=", "self", ".", "_nbytes", "&", "63", "self", ".", "_nbytes", "+=", "len", "(", "data", ")", "if", "self", ".", "_rarbug", "and", "len", "(", "data", ")", ">", "64", ":", "dpos", "=", "self", ".", "block_size", "-", "bufpos", "while", "dpos", "+", "self", ".", "block_size", "<=", "len", "(", "data", ")", ":", "self", ".", "_corrupt", "(", "data", ",", "dpos", ")", "dpos", "+=", "self", ".", "block_size" ]

[ "def", "get_params", "(", "self", ")", ":", "return", "self", ".", "timeout", ",", "self", ".", "xonxoff", ",", "self", ".", "rtscts", ",", "self", ".", "baudrate" ]

[ "def", "get_time_to_merge_request_response", "(", "self", ",", "item", ")", ":", "review_dates", "=", "[", "str_to_datetime", "(", "review", "[", "'created_at'", "]", ")", "for", "review", "in", "item", "[", "'review_comments_data'", "]", "if", "item", "[", "'user'", "]", "[", "'login'", "]", "!=", "review", "[", "'user'", "]", "[", "'login'", "]", "]", "if", "review_dates", ":", "return", "min", "(", "review_dates", ")", "return", "None" ]

[ "def", "set_default_headers", "(", "self", ")", ":", "mod_opts", "=", "self", ".", "application", ".", "mod_opts", "if", "mod_opts", ".", "get", "(", "'cors_origin'", ")", ":", "origin", "=", "self", ".", "request", ".", "headers", ".", "get", "(", "'Origin'", ")", "allowed_origin", "=", "_check_cors_origin", "(", "origin", ",", "mod_opts", "[", "'cors_origin'", "]", ")", "if", "allowed_origin", ":", "self", ".", "set_header", "(", "\"Access-Control-Allow-Origin\"", ",", "allowed_origin", ")" ]

[ "def", "archive", "(", "base_dir", ":", "str", ")", "->", "int", ":", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'archive >>> base_dir: %s'", ",", "base_dir", ")", "rv", "=", "int", "(", "time", "(", ")", ")", "timestamp_dir", "=", "join", "(", "base_dir", ",", "str", "(", "rv", ")", ")", "makedirs", "(", "timestamp_dir", ",", "exist_ok", "=", "True", ")", "with", "SCHEMA_CACHE", ".", "lock", ":", "with", "open", "(", "join", "(", "timestamp_dir", ",", "'schema'", ")", ",", "'w'", ")", "as", "archive", ":", "print", "(", "json", ".", "dumps", "(", "SCHEMA_CACHE", ".", "schemata", "(", ")", ")", ",", "file", "=", "archive", ")", "with", "CRED_DEF_CACHE", ".", "lock", ":", "with", "open", "(", "join", "(", "timestamp_dir", ",", "'cred_def'", ")", ",", "'w'", ")", "as", "archive", ":", "print", "(", "json", ".", "dumps", "(", "CRED_DEF_CACHE", ")", ",", "file", "=", "archive", ")", "with", "REVO_CACHE", ".", "lock", ":", "with", "open", "(", "join", "(", "timestamp_dir", ",", "'revocation'", ")", ",", "'w'", ")", "as", "archive", ":", "revo_cache_dict", "=", "{", "}", "for", "rr_id", "in", "REVO_CACHE", ":", "revo_cache_dict", "[", "rr_id", "]", "=", "{", "'rev_reg_def'", ":", "REVO_CACHE", "[", "rr_id", "]", ".", "rev_reg_def", ",", "'rr_delta_frames'", ":", "[", "vars", "(", "f", ")", "for", "f", "in", "REVO_CACHE", "[", "rr_id", "]", ".", "rr_delta_frames", "]", ",", "'rr_state_frames'", ":", "[", "vars", "(", "f", ")", "for", "f", "in", "REVO_CACHE", "[", "rr_id", "]", ".", "rr_state_frames", "]", "}", "print", "(", "json", ".", "dumps", "(", "revo_cache_dict", ")", ",", "file", "=", "archive", ")", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'archive <<< %s'", ",", "rv", ")", "return", "rv" ]

[ "def", "query_cat_random", "(", "catid", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "num", "=", "kwargs", ".", "get", "(", "'limit'", ",", "8", ")", "if", "catid", "==", "''", ":", "rand_recs", "=", "TabPost", ".", "select", "(", ")", ".", "order_by", "(", "peewee", ".", "fn", ".", "Random", "(", ")", ")", ".", "limit", "(", "num", ")", "else", ":", "rand_recs", "=", "TabPost", ".", "select", "(", ")", ".", "join", "(", "TabPost2Tag", ",", "on", "=", "(", "TabPost", ".", "uid", "==", "TabPost2Tag", ".", "post_id", ")", ")", ".", "where", "(", "(", "TabPost", ".", "valid", "==", "1", ")", "&", "(", "TabPost2Tag", ".", "tag_id", "==", "catid", ")", ")", ".", "order_by", "(", "peewee", ".", "fn", ".", "Random", "(", ")", ")", ".", "limit", "(", "num", ")", "return", "rand_recs" ]

[ "def", "color_group", "(", "self", ",", "checked", "=", "False", ",", "test_color", "=", "None", ")", ":", "group", "=", "self", ".", "tabs", ".", "currentWidget", "(", ")", "if", "test_color", "is", "None", ":", "newcolor", "=", "QColorDialog", ".", "getColor", "(", "group", ".", "idx_color", ")", "else", ":", "newcolor", "=", "test_color", "group", ".", "idx_color", "=", "newcolor", "self", ".", "apply", "(", ")" ]

[ "def", "client_connected", "(", "self", ",", "reader", ":", "asyncio", ".", "StreamReader", ",", "writer", ":", "asyncio", ".", "StreamWriter", ")", "->", "None", ":", "self", ".", "reader", "=", "reader", "self", ".", "writer", "=", "writer" ]

[ "def", "main", "(", "api_endpoint", ",", "credentials", ",", "device_model_id", ",", "device_id", ",", "lang", ",", "verbose", ",", "input_audio_file", ",", "output_audio_file", ",", "block_size", ",", "grpc_deadline", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "# Setup logging.", "logging", ".", "basicConfig", "(", "level", "=", "logging", ".", "DEBUG", "if", "verbose", "else", "logging", ".", "INFO", ")", "# Load OAuth 2.0 credentials.", "try", ":", "with", "open", "(", "credentials", ",", "'r'", ")", "as", "f", ":", "credentials", "=", "google", ".", "oauth2", ".", "credentials", ".", "Credentials", "(", "token", "=", "None", ",", "*", "*", "json", ".", "load", "(", "f", ")", ")", "http_request", "=", "google", ".", "auth", ".", "transport", ".", "requests", ".", "Request", "(", ")", "credentials", ".", "refresh", "(", "http_request", ")", "except", "Exception", "as", "e", ":", "logging", ".", "error", "(", "'Error loading credentials: %s'", ",", "e", ")", "logging", ".", "error", "(", "'Run google-oauthlib-tool to initialize '", "'new OAuth 2.0 credentials.'", ")", "sys", ".", "exit", "(", "-", "1", ")", "# Create an authorized gRPC channel.", "grpc_channel", "=", "google", ".", "auth", ".", "transport", ".", "grpc", ".", "secure_authorized_channel", "(", "credentials", ",", "http_request", ",", "api_endpoint", ")", "logging", ".", "info", "(", "'Connecting to %s'", ",", "api_endpoint", ")", "# Create gRPC stubs", "assistant", "=", "embedded_assistant_pb2_grpc", ".", "EmbeddedAssistantStub", "(", "grpc_channel", ")", "# Generate gRPC requests.", "def", "gen_assist_requests", "(", "input_stream", ")", ":", "dialog_state_in", "=", "embedded_assistant_pb2", ".", "DialogStateIn", "(", "language_code", "=", "lang", ",", "conversation_state", "=", "b''", ")", "config", "=", "embedded_assistant_pb2", ".", "AssistConfig", "(", "audio_in_config", "=", "embedded_assistant_pb2", ".", "AudioInConfig", "(", "encoding", "=", "'LINEAR16'", ",", "sample_rate_hertz", "=", "16000", ",", ")", ",", "audio_out_config", "=", "embedded_assistant_pb2", ".", "AudioOutConfig", "(", "encoding", "=", "'LINEAR16'", ",", "sample_rate_hertz", "=", "16000", ",", "volume_percentage", "=", "100", ",", ")", ",", "dialog_state_in", "=", "dialog_state_in", ",", "device_config", "=", "embedded_assistant_pb2", ".", "DeviceConfig", "(", "device_id", "=", "device_id", ",", "device_model_id", "=", "device_model_id", ",", ")", ")", "# Send first AssistRequest message with configuration.", "yield", "embedded_assistant_pb2", ".", "AssistRequest", "(", "config", "=", "config", ")", "while", "True", ":", "# Read user request from file.", "data", "=", "input_stream", ".", "read", "(", "block_size", ")", "if", "not", "data", ":", "break", "# Send following AssitRequest message with audio chunks.", "yield", "embedded_assistant_pb2", ".", "AssistRequest", "(", "audio_in", "=", "data", ")", "for", "resp", "in", "assistant", ".", "Assist", "(", "gen_assist_requests", "(", "input_audio_file", ")", ",", "grpc_deadline", ")", ":", "# Iterate on AssistResponse messages.", "if", "resp", ".", "event_type", "==", "END_OF_UTTERANCE", ":", "logging", ".", "info", "(", "'End of audio request detected'", ")", "if", "resp", ".", "speech_results", ":", "logging", ".", "info", "(", "'Transcript of user request: \"%s\".'", ",", "' '", ".", "join", "(", "r", ".", "transcript", "for", "r", "in", "resp", ".", "speech_results", ")", ")", "if", "len", "(", "resp", ".", "audio_out", ".", "audio_data", ")", ">", "0", ":", "# Write assistant response to supplied file.", "output_audio_file", ".", "write", "(", "resp", ".", "audio_out", ".", "audio_data", ")", "if", "resp", ".", "dialog_state_out", ".", "supplemental_display_text", ":", "logging", ".", "info", "(", "'Assistant display text: \"%s\"'", ",", "resp", ".", "dialog_state_out", ".", "supplemental_display_text", ")", "if", "resp", ".", "device_action", ".", "device_request_json", ":", "device_request", "=", "json", ".", "loads", "(", "resp", ".", "device_action", ".", "device_request_json", ")", "logging", ".", "info", "(", "'Device request: %s'", ",", "device_request", ")" ]

[ "async", "def", "issuer_create_credential", "(", "wallet_handle", ":", "int", ",", "cred_offer_json", ":", "str", ",", "cred_req_json", ":", "str", ",", "cred_values_json", ":", "str", ",", "rev_reg_id", ":", "Optional", "[", "str", "]", ",", "blob_storage_reader_handle", ":", "Optional", "[", "int", "]", ")", "->", "(", "str", ",", "Optional", "[", "str", "]", ",", "Optional", "[", "str", "]", ")", ":", "logger", "=", "logging", ".", "getLogger", "(", "__name__", ")", "logger", ".", "debug", "(", "\"issuer_create_credential: >>> wallet_handle: %r, cred_offer_json: %r, cred_req_json: %r,\"", "\" cred_values_json: %r, rev_reg_id: %r, blob_storage_reader_handle: %r\"", ",", "wallet_handle", ",", "cred_offer_json", ",", "cred_req_json", ",", "cred_values_json", ",", "rev_reg_id", ",", "blob_storage_reader_handle", ")", "if", "not", "hasattr", "(", "issuer_create_credential", ",", "\"cb\"", ")", ":", "logger", ".", "debug", "(", "\"issuer_create_credential: Creating callback\"", ")", "issuer_create_credential", ".", "cb", "=", "create_cb", "(", "CFUNCTYPE", "(", "None", ",", "c_int32", ",", "c_int32", ",", "c_char_p", ",", "c_char_p", ",", "c_char_p", ")", ")", "c_wallet_handle", "=", "c_int32", "(", "wallet_handle", ")", "c_cred_offer_json", "=", "c_char_p", "(", "cred_offer_json", ".", "encode", "(", "'utf-8'", ")", ")", "c_cred_req_json", "=", "c_char_p", "(", "cred_req_json", ".", "encode", "(", "'utf-8'", ")", ")", "c_cred_values_json", "=", "c_char_p", "(", "cred_values_json", ".", "encode", "(", "'utf-8'", ")", ")", "c_rev_reg_id", "=", "c_char_p", "(", "rev_reg_id", ".", "encode", "(", "'utf-8'", ")", ")", "if", "rev_reg_id", "is", "not", "None", "else", "None", "c_blob_storage_reader_handle", "=", "c_int32", "(", "blob_storage_reader_handle", ")", "if", "blob_storage_reader_handle", "else", "-", "1", "(", "cred_json", ",", "cred_revoc_id", ",", "revoc_reg_delta_json", ")", "=", "await", "do_call", "(", "'indy_issuer_create_credential'", ",", "c_wallet_handle", ",", "c_cred_offer_json", ",", "c_cred_req_json", ",", "c_cred_values_json", ",", "c_rev_reg_id", ",", "c_blob_storage_reader_handle", ",", "issuer_create_credential", ".", "cb", ")", "cred_json", "=", "cred_json", ".", "decode", "(", ")", "cred_revoc_id", "=", "cred_revoc_id", ".", "decode", "(", ")", "if", "cred_revoc_id", "else", "None", "revoc_reg_delta_json", "=", "revoc_reg_delta_json", ".", "decode", "(", ")", "if", "revoc_reg_delta_json", "else", "None", "res", "=", "(", "cred_json", ",", "cred_revoc_id", ",", "revoc_reg_delta_json", ")", "logger", ".", "debug", "(", "\"issuer_create_credential: <<< res: %r\"", ",", "res", ")", "return", "res" ]

[ "def", "monitor", "(", "self", ",", "name", ",", "handler", ",", "request", "=", "None", ",", "*", "*", "kws", ")", ":", "chan", "=", "self", ".", "_channel", "(", "name", ")", "return", "Subscription", "(", "context", "=", "self", ",", "nt", "=", "self", ".", "_nt", ",", "channel", "=", "chan", ",", "handler", "=", "monHandler", "(", "handler", ")", ",", "pvRequest", "=", "wrapRequest", "(", "request", ")", ",", "*", "*", "kws", ")" ]

[ "def", "memory_allocation", "(", "library", ",", "session", ",", "size", ",", "extended", "=", "False", ")", ":", "offset", "=", "ViBusAddress", "(", ")", "if", "extended", ":", "ret", "=", "library", ".", "viMemAllocEx", "(", "session", ",", "size", ",", "byref", "(", "offset", ")", ")", "else", ":", "ret", "=", "library", ".", "viMemAlloc", "(", "session", ",", "size", ",", "byref", "(", "offset", ")", ")", "return", "offset", ",", "ret" ]

[ "def", "write", "(", "self", ",", "symbol", ",", "data", ")", ":", "# get the full set of date ranges that we have", "cursor", "=", "self", ".", "_collection", ".", "find", "(", ")", "for", "res", "in", "cursor", ":", "library", "=", "self", ".", "_arctic_lib", ".", "arctic", "[", "res", "[", "'library_name'", "]", "]", "dslice", "=", "self", ".", "_slice", "(", "data", ",", "to_dt", "(", "res", "[", "'start'", "]", ",", "mktz", "(", "'UTC'", ")", ")", ",", "to_dt", "(", "res", "[", "'end'", "]", ",", "mktz", "(", "'UTC'", ")", ")", ")", "if", "len", "(", "dslice", ")", "!=", "0", ":", "library", ".", "write", "(", "symbol", ",", "dslice", ")" ]

[ "def", "is_vimball", "(", "fd", ")", ":", "fd", ".", "seek", "(", "0", ")", "try", ":", "header", "=", "fd", ".", "readline", "(", ")", "except", "UnicodeDecodeError", ":", "# binary files will raise exceptions when trying to decode raw bytes to", "# str objects in our readline() wrapper", "return", "False", "if", "re", ".", "match", "(", "'^\" Vimball Archiver'", ",", "header", ")", "is", "not", "None", ":", "return", "True", "return", "False" ]

[ "def", "keep_sources", "(", "self", ",", "keep", ")", ":", "if", "self", ".", "unmixing_", "is", "None", "or", "self", ".", "mixing_", "is", "None", ":", "raise", "RuntimeError", "(", "\"No sources available (run do_mvarica first)\"", ")", "n_sources", "=", "self", ".", "mixing_", ".", "shape", "[", "0", "]", "self", ".", "remove_sources", "(", "np", ".", "setdiff1d", "(", "np", ".", "arange", "(", "n_sources", ")", ",", "np", ".", "array", "(", "keep", ")", ")", ")", "return", "self" ]

[ "def", "clear_intersection", "(", "self", ",", "other_dict", ")", ":", "for", "key", ",", "value", "in", "other_dict", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "key", "in", "self", ".", "globals", "and", "self", ".", "globals", "[", "key", "]", "is", "value", ":", "del", "self", ".", "globals", "[", "key", "]", "if", "key", "in", "self", ".", "locals", "and", "self", ".", "locals", "[", "key", "]", "is", "value", ":", "del", "self", ".", "locals", "[", "key", "]", "return", "self" ]

[ "def", "ParseFileObject", "(", "self", ",", "parser_mediator", ",", "file_object", ")", ":", "regf_file", "=", "pyregf", ".", "file", "(", ")", "# pylint: disable=no-member", "try", ":", "regf_file", ".", "open_file_object", "(", "file_object", ")", "except", "IOError", ":", "# The error is currently ignored -> see TODO above related to the", "# fixing of handling multiple parsers for the same file format.", "return", "root_key", "=", "regf_file", ".", "get_root_key", "(", ")", "if", "root_key", "is", "None", ":", "regf_file", ".", "close", "(", ")", "return", "root_file_key", "=", "root_key", ".", "get_sub_key_by_path", "(", "self", ".", "_AMCACHE_ROOT_FILE_KEY", ")", "if", "root_file_key", "is", "None", ":", "regf_file", ".", "close", "(", ")", "return", "for", "volume_key", "in", "root_file_key", ".", "sub_keys", ":", "for", "am_entry", "in", "volume_key", ".", "sub_keys", ":", "self", ".", "_ProcessAMCacheFileKey", "(", "am_entry", ",", "parser_mediator", ")", "root_program_key", "=", "root_key", ".", "get_sub_key_by_path", "(", "self", ".", "_AMCACHE_ROOT_PROGRAM_KEY", ")", "if", "root_program_key", "is", "None", ":", "regf_file", ".", "close", "(", ")", "return", "for", "am_entry", "in", "root_program_key", ".", "sub_keys", ":", "self", ".", "_ProcessAMCacheProgramKey", "(", "am_entry", ",", "parser_mediator", ")", "regf_file", ".", "close", "(", ")" ]

[ "def", "_read_footer", "(", "file_obj", ")", ":", "footer_size", "=", "_get_footer_size", "(", "file_obj", ")", "if", "logger", ".", "isEnabledFor", "(", "logging", ".", "DEBUG", ")", ":", "logger", ".", "debug", "(", "\"Footer size in bytes: %s\"", ",", "footer_size", ")", "file_obj", ".", "seek", "(", "-", "(", "8", "+", "footer_size", ")", ",", "2", ")", "# seek to beginning of footer", "tin", "=", "TFileTransport", "(", "file_obj", ")", "pin", "=", "TCompactProtocolFactory", "(", ")", ".", "get_protocol", "(", "tin", ")", "fmd", "=", "parquet_thrift", ".", "FileMetaData", "(", ")", "fmd", ".", "read", "(", "pin", ")", "return", "fmd" ]

[ "def", "_read_footer", "(", "file_obj", ")", ":", "footer_size", "=", "_get_footer_size", "(", "file_obj", ")", "if", "logger", ".", "isEnabledFor", "(", "logging", ".", "DEBUG", ")", ":", "logger", ".", "debug", "(", "\"Footer size in bytes: %s\"", ",", "footer_size", ")", "file_obj", ".", "seek", "(", "-", "(", "8", "+", "footer_size", ")", ",", "2", ")", "# seek to beginning of footer", "tin", "=", "TFileTransport", "(", "file_obj", ")", "pin", "=", "TCompactProtocolFactory", "(", ")", ".", "get_protocol", "(", "tin", ")", "fmd", "=", "parquet_thrift", ".", "FileMetaData", "(", ")", "fmd", ".", "read", "(", "pin", ")", "return", "fmd" ]

[ "async", "def", "get_checkpoint_async", "(", "self", ",", "partition_id", ")", ":", "lease", "=", "await", "self", ".", "get_lease_async", "(", "partition_id", ")", "checkpoint", "=", "None", "if", "lease", ":", "if", "lease", ".", "offset", ":", "checkpoint", "=", "Checkpoint", "(", "partition_id", ",", "lease", ".", "offset", ",", "lease", ".", "sequence_number", ")", "return", "checkpoint" ]

[ "def", "delete", "(", "self", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "hosted_zone", "=", "route53_backend", ".", "get_hosted_zone_by_name", "(", "self", ".", "hosted_zone_name", ")", "if", "not", "hosted_zone", ":", "hosted_zone", "=", "route53_backend", ".", "get_hosted_zone", "(", "self", ".", "hosted_zone_id", ")", "hosted_zone", ".", "delete_rrset_by_name", "(", "self", ".", "name", ")" ]

[ "def", "_bsecurate_cli_compare_basis_files", "(", "args", ")", ":", "ret", "=", "curate", ".", "compare_basis_files", "(", "args", ".", "file1", ",", "args", ".", "file2", ",", "args", ".", "readfmt1", ",", "args", ".", "readfmt2", ",", "args", ".", "uncontract_general", ")", "if", "ret", ":", "return", "\"No difference found\"", "else", ":", "return", "\"DIFFERENCES FOUND. SEE ABOVE\"" ]

[ "def", "update_thumbnail", "(", "api_key", ",", "api_secret", ",", "video_key", ",", "position", "=", "7.0", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "jwplatform_client", "=", "jwplatform", ".", "Client", "(", "api_key", ",", "api_secret", ")", "logging", ".", "info", "(", "\"Updating video thumbnail.\"", ")", "try", ":", "response", "=", "jwplatform_client", ".", "videos", ".", "thumbnails", ".", "update", "(", "video_key", "=", "video_key", ",", "position", "=", "position", ",", "# Parameter which specifies seconds into video to extract thumbnail from.", "*", "*", "kwargs", ")", "except", "jwplatform", ".", "errors", ".", "JWPlatformError", "as", "e", ":", "logging", ".", "error", "(", "\"Encountered an error updating thumbnail.\\n{}\"", ".", "format", "(", "e", ")", ")", "sys", ".", "exit", "(", "e", ".", "message", ")", "return", "response" ]

[ "def", "block", "(", "seed", ")", ":", "num", "=", "SAMPLE_RATE", "*", "BLOCK_SIZE", "rng", "=", "RandomState", "(", "seed", "%", "2", "**", "32", ")", "variance", "=", "SAMPLE_RATE", "/", "2", "return", "rng", ".", "normal", "(", "size", "=", "num", ",", "scale", "=", "variance", "**", "0.5", ")" ]

[ "def", "pop", "(", "self", ",", "symbol", ")", ":", "last_metadata", "=", "self", ".", "find_one", "(", "{", "'symbol'", ":", "symbol", "}", ",", "sort", "=", "[", "(", "'start_time'", ",", "pymongo", ".", "DESCENDING", ")", "]", ")", "if", "last_metadata", "is", "None", ":", "raise", "NoDataFoundException", "(", "'No metadata found for symbol {}'", ".", "format", "(", "symbol", ")", ")", "self", ".", "find_one_and_delete", "(", "{", "'symbol'", ":", "symbol", "}", ",", "sort", "=", "[", "(", "'start_time'", ",", "pymongo", ".", "DESCENDING", ")", "]", ")", "mongo_retry", "(", "self", ".", "find_one_and_update", ")", "(", "{", "'symbol'", ":", "symbol", "}", ",", "{", "'$unset'", ":", "{", "'end_time'", ":", "''", "}", "}", ",", "sort", "=", "[", "(", "'start_time'", ",", "pymongo", ".", "DESCENDING", ")", "]", ")", "return", "last_metadata" ]

[ "def", "connect", "(", "self", ",", "port", "=", "None", ",", "options", "=", "None", ")", ":", "self", ".", "_driver", ".", "connect", "(", "port", "=", "port", ")", "self", ".", "fw_version", "=", "self", ".", "_driver", ".", "get_fw_version", "(", ")", "# the below call to `cache_instrument_models` is relied upon by", "# `Session._simulate()`, which calls `robot.connect()` after exec'ing a", "# protocol. That protocol could very well have different pipettes than", "# what are physically attached to the robot", "self", ".", "cache_instrument_models", "(", ")" ]

[ "def", "remove", "(", "self", ")", ":", "for", "cgroup", "in", "self", ".", "paths", ":", "remove_cgroup", "(", "cgroup", ")", "del", "self", ".", "paths", "del", "self", ".", "per_subsystem" ]

[ "def", "output_best_scores", "(", "self", ",", "best_epoch_str", ":", "str", ")", "->", "None", ":", "BEST_SCORES_FILENAME", "=", "\"best_scores.txt\"", "with", "open", "(", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "self", ".", "exp_dir", ",", "BEST_SCORES_FILENAME", ")", ",", "\"w\"", ",", "encoding", "=", "ENCODING", ")", "as", "best_f", ":", "print", "(", "best_epoch_str", ",", "file", "=", "best_f", ",", "flush", "=", "True", ")" ]

[ "def", "unbind", "(", "self", ",", "devices_to_unbind", ")", ":", "if", "self", ".", "entity_api_key", "==", "\"\"", ":", "return", "{", "'status'", ":", "'failure'", ",", "'response'", ":", "'No API key found in request'", "}", "url", "=", "self", ".", "base_url", "+", "\"api/0.1.0/subscribe/unbind\"", "headers", "=", "{", "\"apikey\"", ":", "self", ".", "entity_api_key", "}", "data", "=", "{", "\"exchange\"", ":", "\"amq.topic\"", ",", "\"keys\"", ":", "devices_to_unbind", ",", "\"queue\"", ":", "self", ".", "entity_id", "}", "with", "self", ".", "no_ssl_verification", "(", ")", ":", "r", "=", "requests", ".", "delete", "(", "url", ",", "json", "=", "data", ",", "headers", "=", "headers", ")", "print", "(", "r", ")", "response", "=", "dict", "(", ")", "if", "\"No API key\"", "in", "str", "(", "r", ".", "content", ".", "decode", "(", "\"utf-8\"", ")", ")", ":", "response", "[", "\"status\"", "]", "=", "\"failure\"", "r", "=", "json", ".", "loads", "(", "r", ".", "content", ".", "decode", "(", "\"utf-8\"", ")", ")", "[", "'message'", "]", "elif", "'unbind'", "in", "str", "(", "r", ".", "content", ".", "decode", "(", "\"utf-8\"", ")", ")", ":", "response", "[", "\"status\"", "]", "=", "\"success\"", "r", "=", "r", ".", "content", ".", "decode", "(", "\"utf-8\"", ")", "else", ":", "response", "[", "\"status\"", "]", "=", "\"failure\"", "r", "=", "r", ".", "content", ".", "decode", "(", "\"utf-8\"", ")", "response", "[", "\"response\"", "]", "=", "str", "(", "r", ")", "return", "response" ]

[ "def", "_augment_exception", "(", "exc", ",", "version", ",", "arch", "=", "''", ")", ":", "# Error if MSVC++ directory not found or environment not set", "message", "=", "exc", ".", "args", "[", "0", "]", "if", "\"vcvarsall\"", "in", "message", ".", "lower", "(", ")", "or", "\"visual c\"", "in", "message", ".", "lower", "(", ")", ":", "# Special error message if MSVC++ not installed", "tmpl", "=", "'Microsoft Visual C++ {version:0.1f} is required.'", "message", "=", "tmpl", ".", "format", "(", "*", "*", "locals", "(", ")", ")", "msdownload", "=", "'www.microsoft.com/download/details.aspx?id=%d'", "if", "version", "==", "9.0", ":", "if", "arch", ".", "lower", "(", ")", ".", "find", "(", "'ia64'", ")", ">", "-", "1", ":", "# For VC++ 9.0, if IA64 support is needed, redirect user", "# to Windows SDK 7.0", "message", "+=", "' Get it with \"Microsoft Windows SDK 7.0\": '", "message", "+=", "msdownload", "%", "3138", "else", ":", "# For VC++ 9.0 redirect user to Vc++ for Python 2.7 :", "# This redirection link is maintained by Microsoft.", "# Contact [email protected] if it needs updating.", "message", "+=", "' Get it from http://aka.ms/vcpython27'", "elif", "version", "==", "10.0", ":", "# For VC++ 10.0 Redirect user to Windows SDK 7.1", "message", "+=", "' Get it with \"Microsoft Windows SDK 7.1\": '", "message", "+=", "msdownload", "%", "8279", "elif", "version", ">=", "14.0", ":", "# For VC++ 14.0 Redirect user to Visual C++ Build Tools", "message", "+=", "(", "' Get it with \"Microsoft Visual C++ Build Tools\": '", "r'https://visualstudio.microsoft.com/downloads/'", ")", "exc", ".", "args", "=", "(", "message", ",", ")" ]

[ "def", "Find", "(", "cls", ",", "setting_matcher", ",", "port_path", "=", "None", ",", "serial", "=", "None", ",", "timeout_ms", "=", "None", ")", ":", "if", "port_path", ":", "device_matcher", "=", "cls", ".", "PortPathMatcher", "(", "port_path", ")", "usb_info", "=", "port_path", "elif", "serial", ":", "device_matcher", "=", "cls", ".", "SerialMatcher", "(", "serial", ")", "usb_info", "=", "serial", "else", ":", "device_matcher", "=", "None", "usb_info", "=", "'first'", "return", "cls", ".", "FindFirst", "(", "setting_matcher", ",", "device_matcher", ",", "usb_info", "=", "usb_info", ",", "timeout_ms", "=", "timeout_ms", ")" ]

[ "def", "_count_devices", "(", "self", ")", ":", "number_of_devices", "=", "ctypes", ".", "c_uint", "(", ")", "if", "ctypes", ".", "windll", ".", "user32", ".", "GetRawInputDeviceList", "(", "ctypes", ".", "POINTER", "(", "ctypes", ".", "c_int", ")", "(", ")", ",", "ctypes", ".", "byref", "(", "number_of_devices", ")", ",", "ctypes", ".", "sizeof", "(", "RawInputDeviceList", ")", ")", "==", "-", "1", ":", "warn", "(", "\"Call to GetRawInputDeviceList was unsuccessful.\"", "\"We have no idea if a mouse or keyboard is attached.\"", ",", "RuntimeWarning", ")", "return", "devices_found", "=", "(", "RawInputDeviceList", "*", "number_of_devices", ".", "value", ")", "(", ")", "if", "ctypes", ".", "windll", ".", "user32", ".", "GetRawInputDeviceList", "(", "devices_found", ",", "ctypes", ".", "byref", "(", "number_of_devices", ")", ",", "ctypes", ".", "sizeof", "(", "RawInputDeviceList", ")", ")", "==", "-", "1", ":", "warn", "(", "\"Call to GetRawInputDeviceList was unsuccessful.\"", "\"We have no idea if a mouse or keyboard is attached.\"", ",", "RuntimeWarning", ")", "return", "for", "device", "in", "devices_found", ":", "if", "device", ".", "dwType", "==", "0", ":", "self", ".", "_raw_device_counts", "[", "'mice'", "]", "+=", "1", "elif", "device", ".", "dwType", "==", "1", ":", "self", ".", "_raw_device_counts", "[", "'keyboards'", "]", "+=", "1", "elif", "device", ".", "dwType", "==", "2", ":", "self", ".", "_raw_device_counts", "[", "'otherhid'", "]", "+=", "1", "else", ":", "self", ".", "_raw_device_counts", "[", "'unknown'", "]", "+=", "1" ]

[ "def", "_validate_slices_form_uniform_grid", "(", "slice_datasets", ")", ":", "invariant_properties", "=", "[", "'Modality'", ",", "'SOPClassUID'", ",", "'SeriesInstanceUID'", ",", "'Rows'", ",", "'Columns'", ",", "'PixelSpacing'", ",", "'PixelRepresentation'", ",", "'BitsAllocated'", ",", "'BitsStored'", ",", "'HighBit'", ",", "]", "for", "property_name", "in", "invariant_properties", ":", "_slice_attribute_equal", "(", "slice_datasets", ",", "property_name", ")", "_validate_image_orientation", "(", "slice_datasets", "[", "0", "]", ".", "ImageOrientationPatient", ")", "_slice_ndarray_attribute_almost_equal", "(", "slice_datasets", ",", "'ImageOrientationPatient'", ",", "1e-5", ")", "slice_positions", "=", "_slice_positions", "(", "slice_datasets", ")", "_check_for_missing_slices", "(", "slice_positions", ")" ]

[ "def", "start", "(", "self", ",", "driver", "=", "None", ",", "device", "=", "None", ",", "midi_driver", "=", "None", ")", ":", "if", "driver", "is", "not", "None", ":", "assert", "(", "driver", "in", "[", "'alsa'", ",", "'oss'", ",", "'jack'", ",", "'portaudio'", ",", "'sndmgr'", ",", "'coreaudio'", ",", "'Direct Sound'", ",", "'pulseaudio'", "]", ")", "fluid_settings_setstr", "(", "self", ".", "settings", ",", "b'audio.driver'", ",", "driver", ".", "encode", "(", ")", ")", "if", "device", "is", "not", "None", ":", "fluid_settings_setstr", "(", "self", ".", "settings", ",", "str", "(", "'audio.%s.device'", "%", "(", "driver", ")", ")", ".", "encode", "(", ")", ",", "device", ".", "encode", "(", ")", ")", "self", ".", "audio_driver", "=", "new_fluid_audio_driver", "(", "self", ".", "settings", ",", "self", ".", "synth", ")", "if", "midi_driver", "is", "not", "None", ":", "assert", "(", "midi_driver", "in", "[", "'alsa_seq'", ",", "'alsa_raw'", ",", "'oss'", ",", "'winmidi'", ",", "'midishare'", ",", "'coremidi'", "]", ")", "fluid_settings_setstr", "(", "self", ".", "settings", ",", "b'midi.driver'", ",", "midi_driver", ".", "encode", "(", ")", ")", "self", ".", "router", "=", "new_fluid_midi_router", "(", "self", ".", "settings", ",", "fluid_synth_handle_midi_event", ",", "self", ".", "synth", ")", "fluid_synth_set_midi_router", "(", "self", ".", "synth", ",", "self", ".", "router", ")", "self", ".", "midi_driver", "=", "new_fluid_midi_driver", "(", "self", ".", "settings", ",", "fluid_midi_router_handle_midi_event", ",", "self", ".", "router", ")" ]

[ "def", "geo_max_distance", "(", "left", ",", "right", ")", ":", "op", "=", "ops", ".", "GeoMaxDistance", "(", "left", ",", "right", ")", "return", "op", ".", "to_expr", "(", ")" ]

[ "def", "wave_infochunk", "(", "path", ")", ":", "with", "open", "(", "path", ",", "'rb'", ")", "as", "file", ":", "if", "file", ".", "read", "(", "4", ")", "!=", "b\"RIFF\"", ":", "return", "None", "data_size", "=", "file", ".", "read", "(", "4", ")", "# container size", "if", "file", ".", "read", "(", "4", ")", "!=", "b\"WAVE\"", ":", "return", "None", "while", "True", ":", "chunkid", "=", "file", ".", "read", "(", "4", ")", "sizebuf", "=", "file", ".", "read", "(", "4", ")", "if", "len", "(", "sizebuf", ")", "<", "4", "or", "len", "(", "chunkid", ")", "<", "4", ":", "return", "None", "size", "=", "struct", ".", "unpack", "(", "b'<L'", ",", "sizebuf", ")", "[", "0", "]", "if", "chunkid", "[", "0", ":", "3", "]", "!=", "b\"fmt\"", ":", "if", "size", "%", "2", "==", "1", ":", "seek", "=", "size", "+", "1", "else", ":", "seek", "=", "size", "file", ".", "seek", "(", "size", ",", "1", ")", "else", ":", "return", "bytearray", "(", "b\"RIFF\"", "+", "data_size", "+", "b\"WAVE\"", "+", "chunkid", "+", "sizebuf", "+", "file", ".", "read", "(", "size", ")", ")" ]

[ "def", "Nu_vertical_cylinder", "(", "Pr", ",", "Gr", ",", "L", "=", "None", ",", "D", "=", "None", ",", "Method", "=", "None", ",", "AvailableMethods", "=", "False", ")", ":", "def", "list_methods", "(", ")", ":", "methods", "=", "[", "]", "for", "key", ",", "values", "in", "vertical_cylinder_correlations", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "values", "[", "4", "]", "or", "all", "(", "(", "L", ",", "D", ")", ")", ":", "methods", ".", "append", "(", "key", ")", "if", "'Popiel & Churchill'", "in", "methods", ":", "methods", ".", "remove", "(", "'Popiel & Churchill'", ")", "methods", ".", "insert", "(", "0", ",", "'Popiel & Churchill'", ")", "elif", "'McAdams, Weiss & Saunders'", "in", "methods", ":", "methods", ".", "remove", "(", "'McAdams, Weiss & Saunders'", ")", "methods", ".", "insert", "(", "0", ",", "'McAdams, Weiss & Saunders'", ")", "return", "methods", "if", "AvailableMethods", ":", "return", "list_methods", "(", ")", "if", "not", "Method", ":", "Method", "=", "list_methods", "(", ")", "[", "0", "]", "if", "Method", "in", "vertical_cylinder_correlations", ":", "if", "vertical_cylinder_correlations", "[", "Method", "]", "[", "4", "]", ":", "return", "vertical_cylinder_correlations", "[", "Method", "]", "[", "0", "]", "(", "Pr", "=", "Pr", ",", "Gr", "=", "Gr", ")", "else", ":", "return", "vertical_cylinder_correlations", "[", "Method", "]", "[", "0", "]", "(", "Pr", "=", "Pr", ",", "Gr", "=", "Gr", ",", "L", "=", "L", ",", "D", "=", "D", ")", "else", ":", "raise", "Exception", "(", "\"Correlation name not recognized; see the \"", "\"documentation for the available options.\"", ")" ]

[ "def", "revoke_session", "(", "self", ",", "sid", "=", "''", ",", "token", "=", "''", ")", ":", "if", "not", "sid", ":", "if", "token", ":", "sid", "=", "self", ".", "handler", ".", "sid", "(", "token", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Need one of \"sid\" or \"token\"'", ")", "for", "typ", "in", "[", "'access_token'", ",", "'refresh_token'", ",", "'code'", "]", ":", "try", ":", "self", ".", "revoke_token", "(", "self", "[", "sid", "]", "[", "typ", "]", ",", "typ", ")", "except", "KeyError", ":", "# If no such token has been issued", "pass", "self", ".", "update", "(", "sid", ",", "revoked", "=", "True", ")" ]

[ "def", "revoke_session", "(", "self", ",", "sid", "=", "''", ",", "token", "=", "''", ")", ":", "if", "not", "sid", ":", "if", "token", ":", "sid", "=", "self", ".", "handler", ".", "sid", "(", "token", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Need one of \"sid\" or \"token\"'", ")", "for", "typ", "in", "[", "'access_token'", ",", "'refresh_token'", ",", "'code'", "]", ":", "try", ":", "self", ".", "revoke_token", "(", "self", "[", "sid", "]", "[", "typ", "]", ",", "typ", ")", "except", "KeyError", ":", "# If no such token has been issued", "pass", "self", ".", "update", "(", "sid", ",", "revoked", "=", "True", ")" ]

[ "def", "namedtuple_storable", "(", "namedtuple", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "return", "default_storable", "(", "namedtuple", ",", "namedtuple", ".", "_fields", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")" ]

[ "def", "user_deleted_from_site_event", "(", "event", ")", ":", "userid", "=", "event", ".", "principal", "catalog", "=", "api", ".", "portal", ".", "get_tool", "(", "'portal_catalog'", ")", "query", "=", "{", "'object_provides'", ":", "WORKSPACE_INTERFACE", "}", "query", "[", "'workspace_members'", "]", "=", "userid", "workspaces", "=", "[", "IWorkspace", "(", "b", ".", "_unrestrictedGetObject", "(", ")", ")", "for", "b", "in", "catalog", ".", "unrestrictedSearchResults", "(", "query", ")", "]", "for", "workspace", "in", "workspaces", ":", "workspace", ".", "remove_from_team", "(", "userid", ")" ]

[ "def", "readKerningElement", "(", "self", ",", "kerningElement", ",", "instanceObject", ")", ":", "kerningLocation", "=", "self", ".", "locationFromElement", "(", "kerningElement", ")", "instanceObject", ".", "addKerning", "(", "kerningLocation", ")" ]

[ "def", "revoke_session", "(", "self", ",", "sid", "=", "''", ",", "token", "=", "''", ")", ":", "if", "not", "sid", ":", "if", "token", ":", "sid", "=", "self", ".", "handler", ".", "sid", "(", "token", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Need one of \"sid\" or \"token\"'", ")", "for", "typ", "in", "[", "'access_token'", ",", "'refresh_token'", ",", "'code'", "]", ":", "try", ":", "self", ".", "revoke_token", "(", "self", "[", "sid", "]", "[", "typ", "]", ",", "typ", ")", "except", "KeyError", ":", "# If no such token has been issued", "pass", "self", ".", "update", "(", "sid", ",", "revoked", "=", "True", ")" ]

[ "def", "revoke_session", "(", "self", ",", "sid", "=", "''", ",", "token", "=", "''", ")", ":", "if", "not", "sid", ":", "if", "token", ":", "sid", "=", "self", ".", "handler", ".", "sid", "(", "token", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Need one of \"sid\" or \"token\"'", ")", "for", "typ", "in", "[", "'access_token'", ",", "'refresh_token'", ",", "'code'", "]", ":", "try", ":", "self", ".", "revoke_token", "(", "self", "[", "sid", "]", "[", "typ", "]", ",", "typ", ")", "except", "KeyError", ":", "# If no such token has been issued", "pass", "self", ".", "update", "(", "sid", ",", "revoked", "=", "True", ")" ]

[ "def", "revoke_session", "(", "self", ",", "sid", "=", "''", ",", "token", "=", "''", ")", ":", "if", "not", "sid", ":", "if", "token", ":", "sid", "=", "self", ".", "handler", ".", "sid", "(", "token", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Need one of \"sid\" or \"token\"'", ")", "for", "typ", "in", "[", "'access_token'", ",", "'refresh_token'", ",", "'code'", "]", ":", "try", ":", "self", ".", "revoke_token", "(", "self", "[", "sid", "]", "[", "typ", "]", ",", "typ", ")", "except", "KeyError", ":", "# If no such token has been issued", "pass", "self", ".", "update", "(", "sid", ",", "revoked", "=", "True", ")" ]

[ "def", "arcball_constrain_to_axis", "(", "point", ",", "axis", ")", ":", "v", "=", "np", ".", "array", "(", "point", ",", "dtype", "=", "np", ".", "float64", ",", "copy", "=", "True", ")", "a", "=", "np", ".", "array", "(", "axis", ",", "dtype", "=", "np", ".", "float64", ",", "copy", "=", "True", ")", "v", "-=", "a", "*", "np", ".", "dot", "(", "a", ",", "v", ")", "# on plane", "n", "=", "vector_norm", "(", "v", ")", "if", "n", ">", "_EPS", ":", "if", "v", "[", "2", "]", "<", "0.0", ":", "np", ".", "negative", "(", "v", ",", "v", ")", "v", "/=", "n", "return", "v", "if", "a", "[", "2", "]", "==", "1.0", ":", "return", "np", ".", "array", "(", "[", "1.0", ",", "0.0", ",", "0.0", "]", ")", "return", "unit_vector", "(", "[", "-", "a", "[", "1", "]", ",", "a", "[", "0", "]", ",", "0.0", "]", ")" ]

[ "def", "fetch_result", "(", "self", ")", ":", "results", "=", "self", ".", "soup", ".", "find_all", "(", "'div'", ",", "{", "'class'", ":", "'container container-small'", "}", ")", "href", "=", "None", "is_match", "=", "False", "i", "=", "0", "while", "i", "<", "len", "(", "results", ")", "and", "not", "is_match", ":", "result", "=", "results", "[", "i", "]", "anchor", "=", "result", ".", "find", "(", "'a'", ",", "{", "'rel'", ":", "'bookmark'", "}", ")", "is_match", "=", "self", ".", "_filter_results", "(", "result", ",", "anchor", ")", "href", "=", "anchor", "[", "'href'", "]", "i", "+=", "1", "try", ":", "page", "=", "get_soup", "(", "href", ")", "except", "(", "Exception", ")", ":", "page", "=", "None", "# Return page if search is successful", "if", "href", "and", "page", ":", "return", "page", "else", ":", "raise", "PageNotFoundError", "(", "PAGE_ERROR", ")" ]

[ "def", "Max", "(", "a", ",", "axis", ",", "keep_dims", ")", ":", "return", "np", ".", "amax", "(", "a", ",", "axis", "=", "axis", "if", "not", "isinstance", "(", "axis", ",", "np", ".", "ndarray", ")", "else", "tuple", "(", "axis", ")", ",", "keepdims", "=", "keep_dims", ")", "," ]

[ "def", "delete_atom", "(", "self", ",", "*", "atom_numbers", ")", ":", "for", "atom_number", "in", "atom_numbers", ":", "deletion_atom", "=", "self", ".", "atom_by_number", "(", "atom_number", "=", "atom_number", ")", "# update atom numbers", "for", "atom", "in", "self", ".", "atoms", ":", "if", "int", "(", "atom", ".", "atom_number", ")", ">", "int", "(", "atom_number", ")", ":", "atom", ".", "atom_number", "=", "str", "(", "int", "(", "atom", ".", "atom_number", ")", "-", "1", ")", "# find index of a bond to remove and update ctab data dict with new atom numbers", "for", "index", ",", "bond", "in", "enumerate", "(", "self", ".", "bonds", ")", ":", "bond", ".", "update_atom_numbers", "(", ")", "if", "atom_number", "in", "{", "bond", ".", "first_atom_number", ",", "bond", ".", "second_atom_number", "}", ":", "self", ".", "bonds", ".", "remove", "(", "bond", ")", "# remove atom from neighbors list", "for", "atom", "in", "self", ".", "atoms", ":", "if", "deletion_atom", "in", "atom", ".", "neighbors", ":", "atom", ".", "neighbors", ".", "remove", "(", "deletion_atom", ")", "self", ".", "atoms", ".", "remove", "(", "deletion_atom", ")" ]

[ "def", "_compute_enlarge_labels", "(", "self", ",", "locator", ",", "base_index", ")", ":", "# base_index_type can be pd.Index or pd.DatetimeIndex", "# depending on user input and pandas behavior", "# See issue #2264", "base_index_type", "=", "type", "(", "base_index", ")", "locator_as_index", "=", "base_index_type", "(", "locator", ")", "nan_labels", "=", "locator_as_index", ".", "difference", "(", "base_index", ")", "common_labels", "=", "locator_as_index", ".", "intersection", "(", "base_index", ")", "if", "len", "(", "common_labels", ")", "==", "0", ":", "raise", "KeyError", "(", "\"None of [{labels}] are in the [{base_index_name}]\"", ".", "format", "(", "labels", "=", "list", "(", "locator_as_index", ")", ",", "base_index_name", "=", "base_index", ")", ")", "return", "nan_labels" ]

[ "def", "data", "(", "self", ",", "data", ")", ":", "self", ".", "_data", "=", "self", ".", "_enforceDataType", "(", "data", ")", "# Enforce self._data to be a QFont", "self", ".", "familyCti", ".", "data", "=", "fontFamilyIndex", "(", "self", ".", "data", ",", "list", "(", "self", ".", "familyCti", ".", "iterConfigValues", ")", ")", "self", ".", "pointSizeCti", ".", "data", "=", "self", ".", "data", ".", "pointSize", "(", ")", "self", ".", "weightCti", ".", "data", "=", "fontWeightIndex", "(", "self", ".", "data", ",", "list", "(", "self", ".", "weightCti", ".", "iterConfigValues", ")", ")", "self", ".", "italicCti", ".", "data", "=", "self", ".", "data", ".", "italic", "(", ")" ]

[ "def", "download_next_song", "(", "self", ",", "song", ")", ":", "dl_ydl_opts", "=", "dict", "(", "ydl_opts", ")", "dl_ydl_opts", "[", "\"progress_hooks\"", "]", "=", "[", "self", ".", "ytdl_progress_hook", "]", "dl_ydl_opts", "[", "\"outtmpl\"", "]", "=", "self", ".", "output_format", "# Move the songs from the next cache to the current cache", "self", ".", "move_next_cache", "(", ")", "self", ".", "state", "=", "'ready'", "self", ".", "play_empty", "(", ")", "# Download the file and create the stream", "with", "youtube_dl", ".", "YoutubeDL", "(", "dl_ydl_opts", ")", "as", "ydl", ":", "try", ":", "ydl", ".", "download", "(", "[", "song", "]", ")", "except", "DownloadStreamException", ":", "# This is a livestream, use the appropriate player", "future", "=", "asyncio", ".", "run_coroutine_threadsafe", "(", "self", ".", "create_stream_player", "(", "song", ",", "dl_ydl_opts", ")", ",", "client", ".", "loop", ")", "try", ":", "future", ".", "result", "(", ")", "except", "Exception", "as", "e", ":", "logger", ".", "exception", "(", "e", ")", "self", ".", "vafter_ts", "(", ")", "return", "except", "PermissionError", ":", "# File is still in use, it'll get cleared next time", "pass", "except", "youtube_dl", ".", "utils", ".", "DownloadError", "as", "e", ":", "self", ".", "logger", ".", "exception", "(", "e", ")", "self", ".", "statuslog", ".", "error", "(", "e", ")", "self", ".", "vafter_ts", "(", ")", "return", "except", "Exception", "as", "e", ":", "self", ".", "logger", ".", "exception", "(", "e", ")", "self", ".", "vafter_ts", "(", ")", "return" ]

[ "def", "update_counts", "(", "self", ",", "prior_counts", ",", "subtype_counts", ")", ":", "for", "source", ",", "(", "pos", ",", "neg", ")", "in", "prior_counts", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "source", "not", "in", "self", ".", "prior_counts", ":", "self", ".", "prior_counts", "[", "source", "]", "=", "[", "0", ",", "0", "]", "self", ".", "prior_counts", "[", "source", "]", "[", "0", "]", "+=", "pos", "self", ".", "prior_counts", "[", "source", "]", "[", "1", "]", "+=", "neg", "for", "source", ",", "subtype_dict", "in", "subtype_counts", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "source", "not", "in", "self", ".", "subtype_counts", ":", "self", ".", "subtype_counts", "[", "source", "]", "=", "{", "}", "for", "subtype", ",", "(", "pos", ",", "neg", ")", "in", "subtype_dict", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "subtype", "not", "in", "self", ".", "subtype_counts", "[", "source", "]", ":", "self", ".", "subtype_counts", "[", "source", "]", "[", "subtype", "]", "=", "[", "0", ",", "0", "]", "self", ".", "subtype_counts", "[", "source", "]", "[", "subtype", "]", "[", "0", "]", "+=", "pos", "self", ".", "subtype_counts", "[", "source", "]", "[", "subtype", "]", "[", "1", "]", "+=", "neg", "self", ".", "update_probs", "(", ")" ]

[ "def", "delete_binding", "(", "self", ",", "vhost", ",", "exchange", ",", "queue", ",", "rt_key", ")", ":", "vhost", "=", "quote", "(", "vhost", ",", "''", ")", "exchange", "=", "quote", "(", "exchange", ",", "''", ")", "queue", "=", "quote", "(", "queue", ",", "''", ")", "body", "=", "''", "path", "=", "Client", ".", "urls", "[", "'rt_bindings_between_exch_queue'", "]", "%", "(", "vhost", ",", "exchange", ",", "queue", ",", "rt_key", ")", "return", "self", ".", "_call", "(", "path", ",", "'DELETE'", ",", "headers", "=", "Client", ".", "json_headers", ")" ]

[ "def", "update", "(", "self", ",", "E", "=", "None", ",", "*", "*", "F", ")", ":", "def", "_update", "(", "D", ")", ":", "for", "k", ",", "v", "in", "D", ".", "items", "(", ")", ":", "if", "super", "(", "ConfigDict", ",", "self", ")", ".", "__contains__", "(", "k", ")", ":", "if", "isinstance", "(", "self", "[", "k", "]", ",", "ConfigDict", ")", ":", "self", "[", "k", "]", ".", "update", "(", "v", ")", "else", ":", "self", "[", "k", "]", "=", "self", ".", "assimilate", "(", "v", ")", "else", ":", "self", "[", "k", "]", "=", "self", ".", "assimilate", "(", "v", ")", "if", "E", "is", "not", "None", ":", "if", "not", "hasattr", "(", "E", ",", "'keys'", ")", ":", "E", "=", "self", ".", "assimilate", "(", "dict", "(", "E", ")", ")", "_update", "(", "E", ")", "_update", "(", "F", ")", "return", "self" ]

[ "def", "replace_non_data_file", "(", "self", ",", "dataset_identifier", ",", "params", ",", "file_data", ")", ":", "resource", "=", "_format_old_api_request", "(", "dataid", "=", "dataset_identifier", ",", "content_type", "=", "\"txt\"", ")", "if", "not", "params", ".", "get", "(", "'method'", ",", "None", ")", ":", "params", "[", "'method'", "]", "=", "'replaceBlob'", "params", "[", "'id'", "]", "=", "dataset_identifier", "return", "self", ".", "_perform_request", "(", "\"post\"", ",", "resource", ",", "params", "=", "params", ",", "files", "=", "file_data", ")" ]

[ "def", "catalogFactory", "(", "name", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "fn", "=", "lambda", "member", ":", "inspect", ".", "isclass", "(", "member", ")", "and", "member", ".", "__module__", "==", "__name__", "catalogs", "=", "odict", "(", "inspect", ".", "getmembers", "(", "sys", ".", "modules", "[", "__name__", "]", ",", "fn", ")", ")", "if", "name", "not", "in", "list", "(", "catalogs", ".", "keys", "(", ")", ")", ":", "msg", "=", "\"%s not found in catalogs:\\n %s\"", "%", "(", "name", ",", "list", "(", "kernels", ".", "keys", "(", ")", ")", ")", "logger", ".", "error", "(", "msg", ")", "msg", "=", "\"Unrecognized catalog: %s\"", "%", "name", "raise", "Exception", "(", "msg", ")", "return", "catalogs", "[", "name", "]", "(", "*", "*", "kwargs", ")" ]

[ "def", "populate", "(", "dataset_name", ",", "data_web_service_url", "=", "DATA_WEB_SERVICE", "+", "\"CFHT\"", ")", ":", "data_dest", "=", "get_uri", "(", "dataset_name", ",", "version", "=", "'o'", ",", "ext", "=", "FITS_EXT", ")", "data_source", "=", "\"%s/%so.{}\"", "%", "(", "data_web_service_url", ",", "dataset_name", ",", "FITS_EXT", ")", "mkdir", "(", "os", ".", "path", ".", "dirname", "(", "data_dest", ")", ")", "try", ":", "client", ".", "link", "(", "data_source", ",", "data_dest", ")", "except", "IOError", "as", "e", ":", "if", "e", ".", "errno", "==", "errno", ".", "EEXIST", ":", "pass", "else", ":", "raise", "e", "header_dest", "=", "get_uri", "(", "dataset_name", ",", "version", "=", "'o'", ",", "ext", "=", "'head'", ")", "header_source", "=", "\"%s/%so.fits.fz?cutout=[0]\"", "%", "(", "data_web_service_url", ",", "dataset_name", ")", "try", ":", "client", ".", "link", "(", "header_source", ",", "header_dest", ")", "except", "IOError", "as", "e", ":", "if", "e", ".", "errno", "==", "errno", ".", "EEXIST", ":", "pass", "else", ":", "raise", "e", "header_dest", "=", "get_uri", "(", "dataset_name", ",", "version", "=", "'p'", ",", "ext", "=", "'head'", ")", "header_source", "=", "\"%s/%s/%sp.head\"", "%", "(", "'http://www.cadc-ccda.hia-iha.nrc-cnrc.gc.ca/data/pub'", ",", "'CFHTSG'", ",", "dataset_name", ")", "try", ":", "client", ".", "link", "(", "header_source", ",", "header_dest", ")", "except", "IOError", "as", "e", ":", "if", "e", ".", "errno", "==", "errno", ".", "EEXIST", ":", "pass", "else", ":", "raise", "e", "return", "True" ]

[ "def", "add_classes", "(", "self", ",", "classes", ")", ":", "if", "not", "isinstance", "(", "classes", ",", "dict", ")", ":", "raise", "TypeError", "(", "'Input classes is not a dict!'", ")", "if", "not", "len", "(", "classes", ")", "==", "self", ".", "num_samples", ":", "raise", "ValueError", "(", "'Too few items - need {} keys'", ".", "format", "(", "self", ".", "num_samples", ")", ")", "if", "not", "all", "(", "[", "key", "in", "self", ".", "keys", "for", "key", "in", "classes", "]", ")", ":", "raise", "ValueError", "(", "'One or more unrecognized keys!'", ")", "self", ".", "__classes", "=", "classes" ]

[ "def", "setOverlayTextureColorSpace", "(", "self", ",", "ulOverlayHandle", ",", "eTextureColorSpace", ")", ":", "fn", "=", "self", ".", "function_table", ".", "setOverlayTextureColorSpace", "result", "=", "fn", "(", "ulOverlayHandle", ",", "eTextureColorSpace", ")", "return", "result" ]

[ "def", "crl_distribution_points", "(", "self", ")", ":", "if", "self", ".", "_crl_distribution_points", "is", "None", ":", "self", ".", "_crl_distribution_points", "=", "self", ".", "_get_http_crl_distribution_points", "(", "self", ".", "crl_distribution_points_value", ")", "return", "self", ".", "_crl_distribution_points" ]

[ "def", "bulk_delete", "(", "self", ",", "container", ",", "object_names", ",", "async_", "=", "False", ")", ":", "deleter", "=", "BulkDeleter", "(", "self", ",", "container", ",", "object_names", ")", "deleter", ".", "start", "(", ")", "if", "async_", ":", "return", "deleter", "while", "not", "deleter", ".", "completed", ":", "time", ".", "sleep", "(", "self", ".", "bulk_delete_interval", ")", "return", "deleter", ".", "results" ]

[ "def", "is_expired", "(", "self", ",", "max_idle_seconds", ")", ":", "now", "=", "current_time", "(", ")", "return", "(", "self", ".", "expiration_time", "is", "not", "None", "and", "self", ".", "expiration_time", "<", "now", ")", "or", "(", "max_idle_seconds", "is", "not", "None", "and", "self", ".", "last_access_time", "+", "max_idle_seconds", "<", "now", ")" ]

[ "def", "mock_xray_client", "(", "f", ")", ":", "@", "wraps", "(", "f", ")", "def", "_wrapped", "(", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "print", "(", "\"Starting X-Ray Patch\"", ")", "old_xray_context_var", "=", "os", ".", "environ", ".", "get", "(", "'AWS_XRAY_CONTEXT_MISSING'", ")", "os", ".", "environ", "[", "'AWS_XRAY_CONTEXT_MISSING'", "]", "=", "'LOG_ERROR'", "old_xray_context", "=", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_context", "old_xray_emitter", "=", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_emitter", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_context", "=", "AWSContext", "(", ")", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_emitter", "=", "MockEmitter", "(", ")", "try", ":", "return", "f", "(", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", "finally", ":", "if", "old_xray_context_var", "is", "None", ":", "del", "os", ".", "environ", "[", "'AWS_XRAY_CONTEXT_MISSING'", "]", "else", ":", "os", ".", "environ", "[", "'AWS_XRAY_CONTEXT_MISSING'", "]", "=", "old_xray_context_var", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_emitter", "=", "old_xray_emitter", "aws_xray_sdk", ".", "core", ".", "xray_recorder", ".", "_context", "=", "old_xray_context", "return", "_wrapped" ]

[ "def", "truncate_schema", "(", "self", ")", ":", "assert", "self", ".", "server", "==", "'localhost'", "con", "=", "self", ".", "connection", "or", "self", ".", "_connect", "(", ")", "self", ".", "_initialize", "(", "con", ")", "cur", "=", "con", ".", "cursor", "(", ")", "cur", ".", "execute", "(", "'DELETE FROM publication;'", ")", "cur", ".", "execute", "(", "'TRUNCATE systems CASCADE;'", ")", "con", ".", "commit", "(", ")", "con", ".", "close", "(", ")", "return" ]

[ "def", "delete_table", "(", "self", ",", "table", ")", ":", "table", "=", "table", ".", "get_soap_object", "(", "self", ".", "client", ")", "return", "self", ".", "call", "(", "'deleteTable'", ",", "table", ")" ]

[ "def", "read_data", "(", "self", ",", "blocksize", "=", "4096", ")", ":", "frames", "=", "ctypes", ".", "c_uint", "(", "blocksize", "//", "self", ".", "_client_fmt", ".", "mBytesPerFrame", ")", "buf", "=", "ctypes", ".", "create_string_buffer", "(", "blocksize", ")", "buflist", "=", "AudioBufferList", "(", ")", "buflist", ".", "mNumberBuffers", "=", "1", "buflist", ".", "mBuffers", "[", "0", "]", ".", "mNumberChannels", "=", "self", ".", "_client_fmt", ".", "mChannelsPerFrame", "buflist", ".", "mBuffers", "[", "0", "]", ".", "mDataByteSize", "=", "blocksize", "buflist", ".", "mBuffers", "[", "0", "]", ".", "mData", "=", "ctypes", ".", "cast", "(", "buf", ",", "ctypes", ".", "c_void_p", ")", "while", "True", ":", "check", "(", "_coreaudio", ".", "ExtAudioFileRead", "(", "self", ".", "_obj", ",", "ctypes", ".", "byref", "(", "frames", ")", ",", "ctypes", ".", "byref", "(", "buflist", ")", ")", ")", "assert", "buflist", ".", "mNumberBuffers", "==", "1", "size", "=", "buflist", ".", "mBuffers", "[", "0", "]", ".", "mDataByteSize", "if", "not", "size", ":", "break", "data", "=", "ctypes", ".", "cast", "(", "buflist", ".", "mBuffers", "[", "0", "]", ".", "mData", ",", "ctypes", ".", "POINTER", "(", "ctypes", ".", "c_char", ")", ")", "blob", "=", "data", "[", ":", "size", "]", "yield", "blob" ]

[ "def", "write_manifest", "(", "self", ")", ":", "self", ".", "filelist", ".", "_repair", "(", ")", "# Now _repairs should encodability, but not unicode", "files", "=", "[", "self", ".", "_manifest_normalize", "(", "f", ")", "for", "f", "in", "self", ".", "filelist", ".", "files", "]", "msg", "=", "\"writing manifest file '%s'\"", "%", "self", ".", "manifest", "self", ".", "execute", "(", "write_file", ",", "(", "self", ".", "manifest", ",", "files", ")", ",", "msg", ")" ]

[ "def", "viewbox", "(", "self", ")", ":", "return", "self", ".", "left", ",", "self", ".", "top", ",", "self", ".", "right", ",", "self", ".", "bottom" ]

[ "def", "cluster_types", "(", "types", ",", "max_clust", "=", "12", ")", ":", "if", "len", "(", "types", ")", "<", "max_clust", ":", "max_clust", "=", "len", "(", "types", ")", "# Do actual clustering", "cluster_dict", "=", "do_clustering", "(", "types", ",", "max_clust", ")", "cluster_ranks", "=", "rank_clusters", "(", "cluster_dict", ")", "# Create a dictionary mapping binary numbers to indices", "ranks", "=", "{", "}", "for", "key", "in", "cluster_dict", ":", "for", "typ", "in", "cluster_dict", "[", "key", "]", ":", "ranks", "[", "typ", "]", "=", "cluster_ranks", "[", "key", "]", "return", "ranks" ]

[ "def", "checkIsConsistent", "(", "self", ")", ":", "if", "is_an_array", "(", "self", ".", "mask", ")", "and", "self", ".", "mask", ".", "shape", "!=", "self", ".", "data", ".", "shape", ":", "raise", "ConsistencyError", "(", "\"Shape mismatch mask={}, data={}\"", ".", "format", "(", "self", ".", "mask", ".", "shape", "!=", "self", ".", "data", ".", "shape", ")", ")" ]

[ "def", "check_origin", "(", "self", ",", "origin", ")", ":", "mod_opts", "=", "self", ".", "application", ".", "mod_opts", "if", "mod_opts", ".", "get", "(", "'cors_origin'", ")", ":", "return", "bool", "(", "_check_cors_origin", "(", "origin", ",", "mod_opts", "[", "'cors_origin'", "]", ")", ")", "else", ":", "return", "super", "(", "AllEventsHandler", ",", "self", ")", ".", "check_origin", "(", "origin", ")" ]

[ "def", "edit_miz", "(", "# noqa: C901", "infile", ":", "str", ",", "outfile", ":", "str", "=", "None", ",", "metar", ":", "typing", ".", "Union", "[", "str", ",", "Metar", "]", "=", "None", ",", "time", ":", "str", "=", "None", ",", "min_wind", ":", "int", "=", "0", ",", "max_wind", ":", "int", "=", "40", ")", "->", "str", ":", "# noinspection SpellCheckingInspection", "if", "outfile", "is", "None", ":", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'editing in place: %s'", ",", "infile", ")", "outfile", "=", "infile", "else", ":", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'editing miz file: %s -> %s'", ",", "infile", ",", "outfile", ")", "mission_weather", "=", "mission_time", "=", "None", "if", "metar", ":", "error", ",", "metar", "=", "emiz", ".", "weather", ".", "custom_metar", ".", "CustomMetar", ".", "get_metar", "(", "metar", ")", "if", "error", ":", "return", "error", "mission_weather", "=", "emiz", ".", "weather", ".", "mission_weather", ".", "MissionWeather", "(", "metar", ",", "min_wind", "=", "min_wind", ",", "max_wind", "=", "max_wind", ")", "if", "time", ":", "try", ":", "mission_time", "=", "MissionTime", ".", "from_string", "(", "time", ")", "except", "ValueError", ":", "return", "f'badly formatted time string: {time}'", "if", "not", "mission_weather", "and", "not", "mission_time", ":", "return", "'nothing to do!'", "with", "Miz", "(", "infile", ")", "as", "miz", ":", "if", "mission_weather", ":", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'applying MissionWeather'", ")", "if", "not", "mission_weather", ".", "apply_to_miz", "(", "miz", ")", ":", "return", "'error while applying METAR to mission'", "if", "mission_time", ":", "LOGGER", ".", "debug", "(", "'applying MissionTime'", ")", "if", "not", "mission_time", ".", "apply_to_miz", "(", "miz", ")", ":", "return", "'error while setting time on mission'", "try", ":", "miz", ".", "zip", "(", "outfile", ")", "return", "''", "except", "OSError", ":", "return", "f'permission error: cannot edit \"{outfile}\"; maybe it is in use ?'" ]

[ "def", "connect", "(", "image", ")", ":", "if", "not", "os", ".", "path", ".", "isfile", "(", "image", ")", ":", "log", ".", "warning", "(", "'Could not connect image: %s does not exist'", ",", "image", ")", "return", "''", "if", "salt", ".", "utils", ".", "path", ".", "which", "(", "'sfdisk'", ")", ":", "fdisk", "=", "'sfdisk -d'", "else", ":", "fdisk", "=", "'fdisk -l'", "__salt__", "[", "'cmd.run'", "]", "(", "'modprobe nbd max_part=63'", ")", "for", "nbd", "in", "glob", ".", "glob", "(", "'/dev/nbd?'", ")", ":", "if", "__salt__", "[", "'cmd.retcode'", "]", "(", "'{0} {1}'", ".", "format", "(", "fdisk", ",", "nbd", ")", ")", ":", "while", "True", ":", "# Sometimes nbd does not \"take hold\", loop until we can verify", "__salt__", "[", "'cmd.run'", "]", "(", "'qemu-nbd -c {0} {1}'", ".", "format", "(", "nbd", ",", "image", ")", ",", "python_shell", "=", "False", ",", ")", "if", "not", "__salt__", "[", "'cmd.retcode'", "]", "(", "'{0} {1}'", ".", "format", "(", "fdisk", ",", "nbd", ")", ")", ":", "break", "return", "nbd", "log", ".", "warning", "(", "'Could not connect image: %s'", ",", "image", ")", "return", "''" ]

[ "def", "parse", "(", "cls", ",", "ss", ")", ":", "up", "=", "urlparse", "(", "ss", ")", "path", "=", "up", ".", "path", "query", "=", "up", ".", "query", "if", "'?'", "in", "path", ":", "path", ",", "_", "=", "up", ".", "path", ".", "split", "(", "'?'", ")", "if", "path", ".", "startswith", "(", "'/'", ")", ":", "path", "=", "path", "[", "1", ":", "]", "bucket", "=", "path", "options", "=", "parse_qs", "(", "query", ")", "scheme", "=", "up", ".", "scheme", "hosts", "=", "up", ".", "netloc", ".", "split", "(", "','", ")", "return", "cls", "(", "bucket", "=", "bucket", ",", "options", "=", "options", ",", "hosts", "=", "hosts", ",", "scheme", "=", "scheme", ")" ]

[ "def", "load_from_package", "(", ")", ":", "try", ":", "import", "pkg_resources", "f", "=", "pkg_resources", ".", "resource_stream", "(", "meta", ".", "__app__", ",", "'cache/unicategories.cache'", ")", "dversion", ",", "mversion", ",", "data", "=", "pickle", ".", "load", "(", "f", ")", "if", "dversion", "==", "data_version", "and", "mversion", "==", "module_version", ":", "return", "data", "warnings", ".", "warn", "(", "'Unicode unicategories database is outdated. '", "'Please reinstall unicategories module to regenerate it.'", "if", "dversion", "<", "data_version", "else", "'Incompatible unicategories database. '", "'Please reinstall unicategories module to regenerate it.'", ")", "except", "(", "ValueError", ",", "EOFError", ")", ":", "warnings", ".", "warn", "(", "'Incompatible unicategories database. '", "'Please reinstall unicategories module to regenerate it.'", ")", "except", "(", "ImportError", ",", "FileNotFoundError", ")", ":", "pass" ]

[ "def", "cachedir_index_del", "(", "minion_id", ",", "base", "=", "None", ")", ":", "base", "=", "init_cachedir", "(", "base", ")", "index_file", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "base", ",", "'index.p'", ")", "lock_file", "(", "index_file", ")", "if", "os", ".", "path", ".", "exists", "(", "index_file", ")", ":", "mode", "=", "'rb'", "if", "six", ".", "PY3", "else", "'r'", "with", "salt", ".", "utils", ".", "files", ".", "fopen", "(", "index_file", ",", "mode", ")", "as", "fh_", ":", "index", "=", "salt", ".", "utils", ".", "data", ".", "decode", "(", "salt", ".", "utils", ".", "msgpack", ".", "load", "(", "fh_", ",", "encoding", "=", "MSGPACK_ENCODING", ")", ")", "else", ":", "return", "if", "minion_id", "in", "index", ":", "del", "index", "[", "minion_id", "]", "mode", "=", "'wb'", "if", "six", ".", "PY3", "else", "'w'", "with", "salt", ".", "utils", ".", "files", ".", "fopen", "(", "index_file", ",", "mode", ")", "as", "fh_", ":", "salt", ".", "utils", ".", "msgpack", ".", "dump", "(", "index", ",", "fh_", ",", "encoding", "=", "MSGPACK_ENCODING", ")", "unlock_file", "(", "index_file", ")" ]

[ "def", "send_message", "(", "self", ",", "message", ")", ":", "if", "self", ".", "_state", "==", "STATE_DISCONNECTED", ":", "raise", "Exception", "(", "\"WAMP is currently disconnected!\"", ")", "message", "=", "message", ".", "as_str", "(", ")", "logger", ".", "debug", "(", "\"SND>: {}\"", ".", "format", "(", "message", ")", ")", "if", "not", "self", ".", "ws", ":", "raise", "Exception", "(", "\"WAMP is currently disconnected!\"", ")", "self", ".", "ws", ".", "send", "(", "message", ")" ]

[ "def", "from_parameter", "(", "cls", ":", "Type", "[", "UnlockParameterType", "]", ",", "parameter", ":", "str", ")", "->", "Optional", "[", "Union", "[", "SIGParameter", ",", "XHXParameter", "]", "]", ":", "sig_param", "=", "SIGParameter", ".", "from_parameter", "(", "parameter", ")", "if", "sig_param", ":", "return", "sig_param", "else", ":", "xhx_param", "=", "XHXParameter", ".", "from_parameter", "(", "parameter", ")", "if", "xhx_param", ":", "return", "xhx_param", "return", "None" ]

[ "def", "OnAdjustVolume", "(", "self", ",", "event", ")", ":", "self", ".", "volume", "=", "self", ".", "player", ".", "audio_get_volume", "(", ")", "if", "event", ".", "GetWheelRotation", "(", ")", "<", "0", ":", "self", ".", "volume", "=", "max", "(", "0", ",", "self", ".", "volume", "-", "10", ")", "elif", "event", ".", "GetWheelRotation", "(", ")", ">", "0", ":", "self", ".", "volume", "=", "min", "(", "200", ",", "self", ".", "volume", "+", "10", ")", "self", ".", "player", ".", "audio_set_volume", "(", "self", ".", "volume", ")" ]

[ "def", "save", "(", "self", ",", "create_multiple_renditions", "=", "True", ",", "preserve_source_rendition", "=", "True", ",", "encode_to", "=", "enums", ".", "EncodeToEnum", ".", "FLV", ")", ":", "if", "is_ftp_connection", "(", "self", ".", "connection", ")", "and", "len", "(", "self", ".", "assets", ")", ">", "0", ":", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "xml", "=", "self", ".", "to_xml", "(", ")", ",", "assets", "=", "self", ".", "assets", ")", "elif", "not", "self", ".", "id", "and", "self", ".", "_filename", ":", "self", ".", "id", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'create_video'", ",", "self", ".", "_filename", ",", "create_multiple_renditions", "=", "create_multiple_renditions", ",", "preserve_source_rendition", "=", "preserve_source_rendition", ",", "encode_to", "=", "encode_to", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "elif", "not", "self", ".", "id", "and", "len", "(", "self", ".", "renditions", ")", ">", "0", ":", "self", ".", "id", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'create_video'", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "elif", "self", ".", "id", ":", "data", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'update_video'", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "if", "data", ":", "self", ".", "_load", "(", "data", ")" ]

[ "def", "_update_dPxy", "(", "self", ")", ":", "if", "'kappa'", "in", "self", ".", "freeparams", ":", "scipy", ".", "copyto", "(", "self", ".", "dPxy", "[", "'kappa'", "]", ",", "self", ".", "Pxy", "/", "self", ".", "kappa", ",", "where", "=", "CODON_TRANSITION", ")", "_fill_diagonals", "(", "self", ".", "dPxy", "[", "'kappa'", "]", ",", "self", ".", "_diag_indices", ")", "if", "'omega'", "in", "self", ".", "freeparams", ":", "scipy", ".", "copyto", "(", "self", ".", "dPxy", "[", "'omega'", "]", ",", "self", ".", "Pxy_no_omega", ",", "where", "=", "CODON_NONSYN", ")", "_fill_diagonals", "(", "self", ".", "dPxy", "[", "'omega'", "]", ",", "self", ".", "_diag_indices", ")" ]

[ "def", "remove_binary_support", "(", "self", ",", "api_id", ",", "cors", "=", "False", ")", ":", "response", "=", "self", ".", "apigateway_client", ".", "get_rest_api", "(", "restApiId", "=", "api_id", ")", "if", "\"binaryMediaTypes\"", "in", "response", "and", "\"*/*\"", "in", "response", "[", "\"binaryMediaTypes\"", "]", ":", "self", ".", "apigateway_client", ".", "update_rest_api", "(", "restApiId", "=", "api_id", ",", "patchOperations", "=", "[", "{", "'op'", ":", "'remove'", ",", "'path'", ":", "'/binaryMediaTypes/*~1*'", "}", "]", ")", "if", "cors", ":", "# go through each resource and change the contentHandling type", "response", "=", "self", ".", "apigateway_client", ".", "get_resources", "(", "restApiId", "=", "api_id", ")", "resource_ids", "=", "[", "item", "[", "'id'", "]", "for", "item", "in", "response", "[", "'items'", "]", "if", "'OPTIONS'", "in", "item", ".", "get", "(", "'resourceMethods'", ",", "{", "}", ")", "]", "for", "resource_id", "in", "resource_ids", ":", "self", ".", "apigateway_client", ".", "update_integration", "(", "restApiId", "=", "api_id", ",", "resourceId", "=", "resource_id", ",", "httpMethod", "=", "'OPTIONS'", ",", "patchOperations", "=", "[", "{", "\"op\"", ":", "\"replace\"", ",", "\"path\"", ":", "\"/contentHandling\"", ",", "\"value\"", ":", "\"\"", "}", "]", ")" ]

[ "def", "save", "(", "self", ",", "create_multiple_renditions", "=", "True", ",", "preserve_source_rendition", "=", "True", ",", "encode_to", "=", "enums", ".", "EncodeToEnum", ".", "FLV", ")", ":", "if", "is_ftp_connection", "(", "self", ".", "connection", ")", "and", "len", "(", "self", ".", "assets", ")", ">", "0", ":", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "xml", "=", "self", ".", "to_xml", "(", ")", ",", "assets", "=", "self", ".", "assets", ")", "elif", "not", "self", ".", "id", "and", "self", ".", "_filename", ":", "self", ".", "id", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'create_video'", ",", "self", ".", "_filename", ",", "create_multiple_renditions", "=", "create_multiple_renditions", ",", "preserve_source_rendition", "=", "preserve_source_rendition", ",", "encode_to", "=", "encode_to", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "elif", "not", "self", ".", "id", "and", "len", "(", "self", ".", "renditions", ")", ">", "0", ":", "self", ".", "id", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'create_video'", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "elif", "self", ".", "id", ":", "data", "=", "self", ".", "connection", ".", "post", "(", "'update_video'", ",", "video", "=", "self", ".", "_to_dict", "(", ")", ")", "if", "data", ":", "self", ".", "_load", "(", "data", ")" ]

[ "def", "preprocess", "(", "msg_body", ",", "delimiter", ",", "content_type", "=", "'text/plain'", ")", ":", "msg_body", "=", "_replace_link_brackets", "(", "msg_body", ")", "msg_body", "=", "_wrap_splitter_with_newline", "(", "msg_body", ",", "delimiter", ",", "content_type", ")", "return", "msg_body" ]

[ "def", "preprocess", "(", "msg_body", ",", "delimiter", ",", "content_type", "=", "'text/plain'", ")", ":", "msg_body", "=", "_replace_link_brackets", "(", "msg_body", ")", "msg_body", "=", "_wrap_splitter_with_newline", "(", "msg_body", ",", "delimiter", ",", "content_type", ")", "return", "msg_body" ]

[ "def", "get_word", "(", "self", ",", "word", "=", "None", ")", ":", "word", "=", "word", "if", "not", "word", "==", "None", "else", "self", ".", "initial", "if", "not", "self", ".", "terminal", "in", "word", ":", "if", "len", "(", "word", ")", ">", "self", ".", "average_word_length", "and", "self", ".", "terminal", "in", "self", ".", "links", "[", "word", "[", "-", "self", ".", "chunk_size", ":", "]", "]", "and", "random", ".", "randint", "(", "0", ",", "1", ")", ":", "addon", "=", "self", ".", "terminal", "else", ":", "options", "=", "self", ".", "links", "[", "word", "[", "-", "self", ".", "chunk_size", ":", "]", "]", "addon", "=", "random", ".", "choice", "(", "options", ")", "word", "=", "word", "+", "addon", "return", "self", ".", "get_word", "(", "word", ")", "return", "word", "[", "1", ":", "-", "1", "]" ]

[ "def", "tile_metadata", "(", "tile", ",", "product", ",", "geometry_check", "=", "None", ")", ":", "grid", "=", "'T{0}{1}{2}'", ".", "format", "(", "pad", "(", "tile", "[", "'utmZone'", "]", ",", "2", ")", ",", "tile", "[", "'latitudeBand'", "]", ",", "tile", "[", "'gridSquare'", "]", ")", "meta", "=", "OrderedDict", "(", "{", "'tile_name'", ":", "product", "[", "'tiles'", "]", "[", "grid", "]", "}", ")", "logger", ".", "info", "(", "'%s Processing tile %s'", "%", "(", "threading", ".", "current_thread", "(", ")", ".", "name", ",", "tile", "[", "'path'", "]", ")", ")", "meta", "[", "'date'", "]", "=", "tile", "[", "'timestamp'", "]", ".", "split", "(", "'T'", ")", "[", "0", "]", "meta", "[", "'thumbnail'", "]", "=", "'{1}/{0}/preview.jp2'", ".", "format", "(", "tile", "[", "'path'", "]", ",", "s3_url", ")", "# remove unnecessary keys", "product", ".", "pop", "(", "'tiles'", ")", "tile", ".", "pop", "(", "'datastrip'", ")", "bands", "=", "product", ".", "pop", "(", "'band_list'", ")", "for", "k", ",", "v", "in", "iteritems", "(", "tile", ")", ":", "meta", "[", "camelcase_underscore", "(", "k", ")", "]", "=", "v", "meta", ".", "update", "(", "product", ")", "# construct download links", "links", "=", "[", "'{2}/{0}/{1}.jp2'", ".", "format", "(", "meta", "[", "'path'", "]", ",", "b", ",", "s3_url", ")", "for", "b", "in", "bands", "]", "meta", "[", "'download_links'", "]", "=", "{", "'aws_s3'", ":", "links", "}", "meta", "[", "'original_tile_meta'", "]", "=", "'{0}/{1}/tileInfo.json'", ".", "format", "(", "s3_url", ",", "meta", "[", "'path'", "]", ")", "def", "internal_latlon", "(", "meta", ")", ":", "keys", "=", "[", "'tile_origin'", ",", "'tile_geometry'", ",", "'tile_data_geometry'", "]", "for", "key", "in", "keys", ":", "if", "key", "in", "meta", ":", "meta", "[", "key", "]", "=", "to_latlon", "(", "meta", "[", "key", "]", ")", "return", "meta", "# change coordinates to wsg4 degrees", "if", "geometry_check", ":", "if", "geometry_check", "(", "meta", ")", ":", "meta", "=", "get_tile_geometry_from_s3", "(", "meta", ")", "else", ":", "meta", "=", "internal_latlon", "(", "meta", ")", "else", ":", "meta", "=", "internal_latlon", "(", "meta", ")", "# rename path key to aws_path", "meta", "[", "'aws_path'", "]", "=", "meta", ".", "pop", "(", "'path'", ")", "return", "meta" ]

[ "def", "on_startup_error", "(", "self", ",", "error", ")", ":", "LOGGER", ".", "critical", "(", "'Could not start %s: %s'", ",", "self", ".", "consumer_name", ",", "error", ")", "self", ".", "set_state", "(", "self", ".", "STATE_STOPPED", ")" ]

[ "def", "match_published_date", "(", "self", ",", "start", ",", "end", ",", "match", ")", ":", "self", ".", "_match_minimum_date_time", "(", "'publishedDate'", ",", "start", ",", "match", ")", "self", ".", "_match_maximum_date_time", "(", "'publishedDate'", ",", "end", ",", "match", ")" ]

[ "def", "namedtuple_storable", "(", "namedtuple", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")", ":", "return", "default_storable", "(", "namedtuple", ",", "namedtuple", ".", "_fields", ",", "*", "args", ",", "*", "*", "kwargs", ")" ]

[ "def", "get_midpoint", "(", "file", ",", "file_start", ",", "file_end", ")", ":", "filehandle", "=", "open", "(", "file", ",", "'r'", ")", "mid_point", "=", "(", "file_start", "+", "file_end", ")", "/", "2", "assert", "mid_point", ">=", "file_start", "filehandle", ".", "seek", "(", "mid_point", ")", "line", "=", "filehandle", ".", "readline", "(", ")", "assert", "len", "(", "line", ")", ">=", "1", "if", "len", "(", "line", ")", "+", "mid_point", "<", "file_end", ":", "return", "mid_point", "+", "len", "(", "line", ")", "-", "1", "filehandle", ".", "seek", "(", "file_start", ")", "line", "=", "filehandle", ".", "readline", "(", ")", "assert", "len", "(", "line", ")", ">=", "1", "assert", "len", "(", "line", ")", "+", "file_start", "<=", "file_end", "return", "len", "(", "line", ")", "+", "file_start", "-", "1" ]

[ "def", "check_etag_header", "(", "self", ")", "->", "bool", ":", "computed_etag", "=", "utf8", "(", "self", ".", "_headers", ".", "get", "(", "\"Etag\"", ",", "\"\"", ")", ")", "# Find all weak and strong etag values from If-None-Match header", "# because RFC 7232 allows multiple etag values in a single header.", "etags", "=", "re", ".", "findall", "(", "br'\\*|(?:W/)?\"[^\"]*\"'", ",", "utf8", "(", "self", ".", "request", ".", "headers", ".", "get", "(", "\"If-None-Match\"", ",", "\"\"", ")", ")", ")", "if", "not", "computed_etag", "or", "not", "etags", ":", "return", "False", "match", "=", "False", "if", "etags", "[", "0", "]", "==", "b\"*\"", ":", "match", "=", "True", "else", ":", "# Use a weak comparison when comparing entity-tags.", "def", "val", "(", "x", ":", "bytes", ")", "->", "bytes", ":", "return", "x", "[", "2", ":", "]", "if", "x", ".", "startswith", "(", "b\"W/\"", ")", "else", "x", "for", "etag", "in", "etags", ":", "if", "val", "(", "etag", ")", "==", "val", "(", "computed_etag", ")", ":", "match", "=", "True", "break", "return", "match" ]