Datasets:
Thomas Lemberger
commited on
Commit
·
63f14b6
1
Parent(s):
062c584
[WIP] files and dummy
Browse files- README.md +13 -4
- dummy/BORING/0.0.1/eval.jsonl +1 -2
- dummy/BORING/0.0.1/test.jsonl +1 -2
- dummy/BORING/0.0.1/train.jsonl +1 -2
- dummy/NER/0.0.1/eval.jsonl +1 -2
- dummy/NER/0.0.1/tes.jsonl +0 -2
- dummy/NER/0.0.1/test.jsonl +1 -0
- dummy/NER/0.0.1/train.jsonl +1 -2
- dummy/PANELIZATION/0.1.1/eval.jsonl +1 -0
- dummy/PANELIZATION/0.1.1/test.jsonl +1 -0
- dummy/PANELIZATION/0.1.1/train.jsonl +1 -0
- dummy/PANELIZATION/eval.jsonl +0 -2
- dummy/PANELIZATION/test.jsonl +0 -2
- dummy/PANELIZATION/train.jsonl +0 -2
- dummy/ROLES/0.0.1/eval.jsonl +1 -2
- dummy/ROLES/0.0.1/test.jsonl +1 -2
- dummy/ROLES/0.0.1/train.jsonl +1 -2
- sd_figs.zip +2 -2
- sd_panels.zip +2 -2
README.md
CHANGED
@@ -77,7 +77,7 @@ The text in the dataset is English.
|
|
77 |
|
78 |
### Data Instances
|
79 |
|
80 |
-
|
81 |
|
82 |
### Data Fields
|
83 |
|
@@ -91,7 +91,16 @@ The text in the dataset is English.
|
|
91 |
|
92 |
### Data Splits
|
93 |
|
94 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
95 |
|
96 |
## Dataset Creation
|
97 |
|
@@ -145,7 +154,7 @@ The text in the dataset is English.
|
|
145 |
|
146 |
### Licensing Information
|
147 |
|
148 |
-
|
149 |
|
150 |
### Citation Information
|
151 |
|
@@ -153,4 +162,4 @@ The text in the dataset is English.
|
|
153 |
|
154 |
### Contributions
|
155 |
|
156 |
-
Thanks to [@
|
|
|
77 |
|
78 |
### Data Instances
|
79 |
|
80 |
+
|
81 |
|
82 |
### Data Fields
|
83 |
|
|
|
91 |
|
92 |
### Data Splits
|
93 |
|
94 |
+
- train:
|
95 |
+
- features: ['input_ids', 'labels', 'tag_mask'],
|
96 |
+
- num_rows: 31410
|
97 |
+
- test:
|
98 |
+
- features: ['input_ids', 'labels', 'tag_mask'],
|
99 |
+
- num_rows: 4224
|
100 |
+
- validation:
|
101 |
+
- features: ['input_ids', 'labels', 'tag_mask'],
|
102 |
+
- num_rows: 8861
|
103 |
+
|
104 |
|
105 |
## Dataset Creation
|
106 |
|
|
|
154 |
|
155 |
### Licensing Information
|
156 |
|
157 |
+
CC BY 4.0
|
158 |
|
159 |
### Citation Information
|
160 |
|
|
|
162 |
|
163 |
### Contributions
|
164 |
|
165 |
+
Thanks to [@tlemberger](https://github.com/tlemberger>) for adding this dataset.
|
dummy/BORING/0.0.1/eval.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "S", "V", "-", "A", "UC", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120(", "C", ")", "\u0120y", "T", "BP", "\u0120The", "\u0120experimental", "\u0120data", "\u0120were", "\u0120analyzed", "\u0120using", "\u0120the", "\u0120Sed", "fit", "\u0120program", "\u0120and", "\u0120are", "\u0120presented", "\u0120above", "\u0120molecular", "\u0120weights", "\u0120calculated", "\u0120using", "\u0120standards", "\u0120(", "in", "\u0120brackets", ").", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 104, 846, 12, 250, 12945, 1966, 9, 36, 347, 43, 1423, 565, 21792, 20, 14073, 414, 58, 13773, 634, 5, 17134, 14307, 586, 8, 32, 2633, 1065, 22481, 23341, 9658, 634, 2820, 36, 179, 29617, 322, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/BORING/0.0.1/test.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "H", ")", "\u0120Representative", "\u0120western", "\u0120bl", "ots", "\u0120of", "\u0120HT", "T", "\u0120(", "ab", "-", "MA", "B", "5", "492", "),", "\u0120HT", "T", "\u0120p", "S", "13", "\u0120(", "ab", "-", "CH", "DI", "-", "900", "010", "39", "-", "1", ")", "\u0120in", "\u0120soluble", "\u0120fraction", "\u0120and", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120from", "\u0120HE", "K", "293", "T", "\u0120cells", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120first", "\u0120with", "\u0120HT", "Tex", "1", "\u012072", "Q", "\u0120e", "G", "FP", "\u0120and", "\u0120then", "\u0120after", "\u012048", "\u0120hour", "\u0120(", "to", "\u0120enable", "\u0120the", "\u0120formation", "\u0120of", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120before", "\u0120the", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", ");", "\u0120with", "\u0120TB", "K", "1", ";", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120l", "ys", "ed", "\u0120at", "\u0120the", "\u0120indicated", "\u0120time", "\u0120after", "\u0120kin", "ase", "\u0120trans", "fect", "ion", ".", "\u0120(", "I", ")", "\u0120Quant", "ification", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120percentage", "\u0120of", "\u0120cells", "\u0120presenting", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120and", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", "\u0120from", "\u0120the", "\u0120experiments", "\u0120in", "\u0120H", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 725, 43, 10308, 4669, 3089, 5992, 9, 31445, 565, 36, 873, 12, 5273, 387, 245, 38852, 238, 31445, 565, 181, 104, 1558, 36, 873, 12, 3764, 10063, 12, 7784, 30583, 3416, 12, 134, 43, 11, 45132, 13484, 8, 26683, 1626, 31, 12925, 530, 32329, 565, 4590, 6214, 17706, 196, 78, 19, 31445, 40175, 134, 4801, 1864, 364, 534, 9763, 8, 172, 71, 2929, 1946, 36, 560, 3155, 5, 9285, 9, 26683, 1626, 137, 5, 24438, 3175, 8151, 4397, 19, 19009, 530, 134, 131, 4590, 58, 784, 2459, 196, 23, 5, 4658, 86, 71, 24438, 3175, 6214, 17706, 1499, 4, 36, 100, 43, 28256, 5000, 9, 5, 3164, 9, 4590, 10864, 26683, 1626, 8, 24438, 3175, 8151, 31, 5, 15491, 11, 289, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/BORING/0.0.1/train.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "C", ")", "\u0120Adult", "\u0120TA", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120with", "\u0120DR", "P", "1", "\u0120and", "\u0120F", "is", "1", "\u0120together", "\u0120with", "\u0120d", ".", "n", ".", "AMP", "K", "\u0120or", "\u0120mock", "\u0120vector", ".", "\u0120Twelve", "\u0120days", "\u0120later", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120collected", "\u0120and", "\u0120cross", "\u00e2\u0122\u0132", "sectional", "\u0120area", "\u0120was", "\u0120quant", "ified", "\u0120(*", "P", "0", ".", "001", ")", "\u0120n", "=", "400", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 347, 43, 20395, 16667, 14357, 58, 6214, 17706, 196, 19, 10994, 510, 134, 8, 274, 354, 134, 561, 19, 385, 4, 282, 4, 20014, 530, 50, 16177, 37681, 4, 24252, 360, 423, 14357, 58, 4786, 8, 2116, 39497, 46523, 443, 21, 24934, 3786, 43305, 510, 288, 4, 19089, 43, 295, 5214, 4017, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/NER/0.0.1/eval.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "S", "V", "-", "A", "UC", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120(", "C", ")", "\u0120y", "T", "BP", "\u0120The", "\u0120experimental", "\u0120data", "\u0120were", "\u0120analyzed", "\u0120using", "\u0120the", "\u0120Sed", "fit", "\u0120program", "\u0120and", "\u0120are", "\u0120presented", "\u0120above", "\u0120molecular", "\u0120weights", "\u0120calculated", "\u0120using", "\u0120standards", "\u0120(", "in", "\u0120brackets", ").", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 104, 846, 12, 250, 12945, 1966, 9, 36, 347, 43, 1423, 565, 21792, 20, 14073, 414, 58, 13773, 634, 5, 17134, 14307, 586, 8, 32, 2633, 1065, 22481, 23341, 9658, 634, 2820, 36, 179, 29617, 322, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/NER/0.0.1/tes.jsonl
DELETED
@@ -1,2 +0,0 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "F", ".", "\u0120Immun", "of", "lu", "orescence", "\u0120analyses", "\u0120in", "\u0120O", "SC", "s", ".", "\u0120Y", "b", "\u0120bodies", "\u0120disappeared", "\u0120upon", "\u0120Y", "b", "\u0120depletion", ",", "\u0120which", "\u0120led", "\u0120Arm", "i", ",", "\u0120So", "Y", "b", "\u0120and", "\u0120V", "ret", "\u0120to", "\u0120be", "\u0120localized", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120cyt", "os", "ol", ".", "\u0120Y", "b", "\u0120bodies", "\u0120were", "\u0120detected", "\u0120in", "\u0120O", "SC", "s", "\u0120upon", "\u0120Arm", "i", "\u0120depletion", ",", "\u0120but", "\u0120So", "Y", "b", "\u0120and", "\u0120V", "ret", "\u0120localized", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120cyt", "os", "ol", ".", "\u0120Arm", "i", "\u0120was", "\u0120detected", "\u0120at", "\u0120Y", "b", "\u0120bodies", "\u0120upon", "\u0120So", "Y", "b", "\u0120or", "\u0120V", "ret", "\u0120depletion", ".", "\u0120Y", "b", "\u0120bodies", "\u0120are", "\u0120indicated", "\u0120by", "\u0120white", "\u0120arrows", ".", "\u0120N", "ucle", "i", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120in", "\u0120blue", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ":", "\u01202", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 597, 4, 29054, 1116, 6487, 45094, 20070, 11, 384, 3632, 29, 4, 854, 428, 3738, 9939, 2115, 854, 428, 39309, 6, 61, 669, 10617, 118, 6, 407, 975, 428, 8, 468, 4903, 7, 28, 35668, 11, 5, 44193, 366, 1168, 4, 854, 428, 3738, 58, 12333, 11, 384, 3632, 29, 2115, 10617, 118, 39309, 6, 53, 407, 975, 428, 8, 468, 4903, 35668, 11, 5, 44193, 366, 1168, 4, 10617, 118, 21, 12333, 23, 854, 428, 3738, 2115, 407, 975, 428, 50, 468, 4903, 39309, 4, 854, 428, 3738, 32, 4658, 30, 1104, 36486, 4, 234, 40143, 118, 32, 2343, 11, 2440, 4, 33256, 2003, 35, 132, 46911, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "H", ")", "\u0120Representative", "\u0120western", "\u0120bl", "ots", "\u0120of", "\u0120HT", "T", "\u0120(", "ab", "-", "MA", "B", "5", "492", "),", "\u0120HT", "T", "\u0120p", "S", "13", "\u0120(", "ab", "-", "CH", "DI", "-", "900", "010", "39", "-", "1", ")", "\u0120in", "\u0120soluble", "\u0120fraction", "\u0120and", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120from", "\u0120HE", "K", "293", "T", "\u0120cells", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120first", "\u0120with", "\u0120HT", "Tex", "1", "\u012072", "Q", "\u0120e", "G", "FP", "\u0120and", "\u0120then", "\u0120after", "\u012048", "\u0120hour", "\u0120(", "to", "\u0120enable", "\u0120the", "\u0120formation", "\u0120of", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120before", "\u0120the", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", ");", "\u0120with", "\u0120TB", "K", "1", ";", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120l", "ys", "ed", "\u0120at", "\u0120the", "\u0120indicated", "\u0120time", "\u0120after", "\u0120kin", "ase", "\u0120trans", "fect", "ion", ".", "\u0120(", "I", ")", "\u0120Quant", "ification", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120percentage", "\u0120of", "\u0120cells", "\u0120presenting", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120and", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", "\u0120from", "\u0120the", "\u0120experiments", "\u0120in", "\u0120H", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 725, 43, 10308, 4669, 3089, 5992, 9, 31445, 565, 36, 873, 12, 5273, 387, 245, 38852, 238, 31445, 565, 181, 104, 1558, 36, 873, 12, 3764, 10063, 12, 7784, 30583, 3416, 12, 134, 43, 11, 45132, 13484, 8, 26683, 1626, 31, 12925, 530, 32329, 565, 4590, 6214, 17706, 196, 78, 19, 31445, 40175, 134, 4801, 1864, 364, 534, 9763, 8, 172, 71, 2929, 1946, 36, 560, 3155, 5, 9285, 9, 26683, 1626, 137, 5, 24438, 3175, 8151, 4397, 19, 19009, 530, 134, 131, 4590, 58, 784, 2459, 196, 23, 5, 4658, 86, 71, 24438, 3175, 6214, 17706, 1499, 4, 36, 100, 43, 28256, 5000, 9, 5, 3164, 9, 4590, 10864, 26683, 1626, 8, 24438, 3175, 8151, 31, 5, 15491, 11, 289, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
|
|
|
dummy/NER/0.0.1/test.jsonl
ADDED
@@ -0,0 +1 @@
|
|
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
dummy/NER/0.0.1/train.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "C", ")", "\u0120Adult", "\u0120TA", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120with", "\u0120DR", "P", "1", "\u0120and", "\u0120F", "is", "1", "\u0120together", "\u0120with", "\u0120d", ".", "n", ".", "AMP", "K", "\u0120or", "\u0120mock", "\u0120vector", ".", "\u0120Twelve", "\u0120days", "\u0120later", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120collected", "\u0120and", "\u0120cross", "\u00e2\u0122\u0132", "sectional", "\u0120area", "\u0120was", "\u0120quant", "ified", "\u0120(*", "P", "0", ".", "001", ")", "\u0120n", "=", "400", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 347, 43, 20395, 16667, 14357, 58, 6214, 17706, 196, 19, 10994, 510, 134, 8, 274, 354, 134, 561, 19, 385, 4, 282, 4, 20014, 530, 50, 16177, 37681, 4, 24252, 360, 423, 14357, 58, 4786, 8, 2116, 39497, 46523, 443, 21, 24934, 3786, 43305, 510, 288, 4, 19089, 43, 295, 5214, 4017, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/PANELIZATION/0.1.1/eval.jsonl
ADDED
@@ -0,0 +1 @@
|
|
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01205", ".", "\u0120Figure", "\u01205", ".(", "B", "-", "D", ")", "\u0120Surface", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ation", "\u0120ass", "ays", "\u0120verified", "\u0120increased", "\u0120surface", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120\u00ce\u00b1", "V", "\u0120and", "\u0120\u00ce\u00b2", "3", "\u0120upon", "\u0120appl", "i", "\u00c2\u0143", "cation", "\u0120of", "\u0120E", "7", "\u0120but", "\u0120not", "\u0120Fn", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01203", ";", "\u0120one", "-", "way", "\u0120AN", "OVA", ")", "\u0120(", "E", "-", "G", ")", "\u0120Surface", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120\u00ce\u00b1", "5", "\u0120and", "\u0120\u00ce\u00b2", "1", "\u0120was", "\u0120found", "\u0120increased", "\u0120upon", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120E", "7", "\u0120or", "\u0120Fn", "\u0120and", "\u0120was", "\u0120further", "\u0120enhanced", "\u0120by", "\u0120combination", "\u0120of", "\u0120both", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01203", ";", "\u0120one", "-", "way", "\u0120AN", "OVA", ")", "\u0120(", "H", ")", "\u0120E", "ct", "opic", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120mur", "ine", "\u0120EG", "FL", "7", "\u0120(", "m", "E", "7", ")", "\u0120in", "\u0120GL", "261", "\u00c2\u0142", "mouse", "\u00c2\u0142", "g", "li", "oma", "\u0120cells", "\u0120followed", "\u0120by", "\u0120intr", "ac", "ran", "ial", "\u0120implant", "ation", "\u0120into", "\u0120the", "\u0120stri", "atum", "\u0120of", "\u0120immune", "-", "comp", "et", "ent", "\u0120mice", "\u0120reduced", "\u0120overall", "\u0120survival", "\u0120but", "\u0120was", "\u0120rescued", "\u0120upon", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120an", "\u0120integ", "rin", "\u0120\u00ce\u00b1", "5", "\u00ce\u00b2", "1", "-", "in", "hib", "iting", "\u0120antibody", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01206", ";", "\u0120log", "-", "rank", "\u0120test", ").", "\u0120Data", "\u0120presented", "\u0120as", "\u0120mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SEM", ".", "\u0120T", "CL", "-", "total", "\u0120cell", "\u0120l", "ys", "ate", ",", "\u0120AU", "-", "ar", "bit", "rary", "\u0120units", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 195, 4, 17965, 195, 21154, 387, 12, 495, 43, 17111, 4003, 1242, 47253, 1258, 8446, 4113, 13031, 1130, 4084, 8151, 9, 47188, 846, 8, 47743, 246, 2115, 45432, 118, 5514, 41684, 9, 381, 406, 53, 45, 47377, 36, 282, 5457, 155, 131, 65, 12, 1970, 5102, 44320, 43, 36, 717, 12, 534, 43, 17111, 8151, 9, 47188, 245, 8, 47743, 134, 21, 303, 1130, 2115, 1416, 19, 381, 406, 50, 47377, 8, 21, 617, 9094, 30, 4069, 9, 258, 36, 282, 5457, 155, 131, 65, 12, 1970, 5102, 44320, 43, 36, 725, 43, 381, 3894, 18137, 8151, 9, 22802, 833, 40999, 7613, 406, 36, 119, 717, 406, 43, 11, 12209, 32972, 50141, 45052, 50141, 571, 3572, 4982, 4590, 1432, 30, 19567, 1043, 3917, 2617, 26574, 1258, 88, 5, 28213, 15368, 9, 9161, 12, 11828, 594, 1342, 15540, 2906, 1374, 7967, 53, 21, 8262, 2115, 1416, 19, 41, 20590, 5719, 47188, 245, 47328, 134, 12, 179, 25068, 2838, 34517, 36, 282, 5457, 231, 131, 7425, 12, 40081, 1296, 322, 5423, 2633, 25, 1266, 46710, 39703, 4, 255, 7454, 12, 30033, 3551, 784, 2459, 877, 6, 16778, 12, 271, 5881, 35073, 2833, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
dummy/PANELIZATION/0.1.1/test.jsonl
ADDED
@@ -0,0 +1 @@
|
|
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01207", ".", "\u0120Figure", "\u01207", ".", "A", ".", "\u0120Expression", "\u0120of", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120V", "DA", "\u0120after", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120D", "MS", "O", "\u0120vehicle", "\u0120control", "\u0120(", "left", "),", "\u0120the", "\u0120PI", "3", "K", "/", "AK", "T", "\u0120inhibitor", "\u0120W", "ort", "mann", "in", "\u0120(", "WM", ",", "\u0120middle", ")", "\u0120and", "\u0120after", "\u0120joined", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120WM", "\u0120and", "\u0120enforced", "\u0120NIC", "D", "\u0120expression", "\u0120via", "\u0120HS", "\u0120at", "\u012014", "\u0120hp", "f", "\u0120in", "\u0120T", "g", "(", "5", "x", "U", "AS", "-", "E", "1", "b", ":", "6", "x", "MY", "C", "-", "not", "ch", "1", "a", ";", "-", "1", ".", "5", "h", "sp", "70", "l", ":", "Gal", "4", ")", "\u0120embryos", "\u0120(", "right", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120B", ".", "\u0120Expression", "\u0120of", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120after", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120D", "MS", "O", "\u0120vehicle", "\u0120control", "\u0120(", "left", ")", "\u0120or", "\u0120W", "ort", "mann", "in", "\u0120(", "WM", ",", "\u0120middle", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120C", ".", "\u0120W", "ISH", "\u0120for", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120in", "\u0120control", "\u0120injected", "\u0120embryos", "\u0120(", "upper", "\u0120left", "),", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120morph", "ants", "\u0120(", "upper", "\u0120right", ")", "\u0120or", "\u0120respectively", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120MO", "\u0120with", "\u0120my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120HS", "\u0120at", "\u012014", "\u0120hp", "f", "\u0120(", "lower", "\u0120right", ")", "\u0120and", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120MO", "\u0120with", "\u0120U", "AS", "-", "my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120trans", "genic", "\u0120T", "g", "(", "fl", "i", ".", "1", ":", "Gal", "4", "FF", "ubs", "3", ";", "\u0120U", "AS", ":", "R", "FP", ")", "r", "k", "\u0120embryos", ".", "D", ".", "\u0120Quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120E", ".", "\u0120W", "ISH", "\u0120for", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120in", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120Morph", "ol", "ino", "\u0120injected", "\u0120(", "left", ")", "\u0120and", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120plus", "\u0120U", "AS", ":", "my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120trans", "genic", "\u0120T", "g", "(", "fl", "i", ".", "1", ":", "Gal", "4", "FF", "ubs", "3", ";", "\u0120U", "AS", ":", "R", "FP", ")", "r", "k", "\u0120embryos", "\u0120(", "right", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 262, 4, 17965, 262, 4, 250, 4, 43819, 9, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 11, 5, 468, 3134, 71, 1416, 19, 211, 6222, 673, 1155, 797, 36, 6960, 238, 5, 32546, 246, 530, 73, 7140, 565, 34496, 305, 2723, 4621, 179, 36, 29395, 6, 1692, 43, 8, 71, 1770, 1416, 19, 30355, 8, 17910, 33420, 495, 8151, 1241, 21499, 23, 501, 29886, 506, 11, 255, 571, 1640, 245, 1178, 791, 2336, 12, 717, 134, 428, 35, 401, 1178, 25518, 347, 12, 3654, 611, 134, 102, 131, 12, 134, 4, 245, 298, 4182, 3083, 462, 35, 32302, 306, 43, 32293, 36, 4070, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 42819, 13, 349, 1881, 4, 163, 4, 43819, 9, 16046, 134, 428, 71, 1416, 19, 211, 6222, 673, 1155, 797, 36, 6960, 43, 50, 305, 2723, 4621, 179, 36, 29395, 6, 1692, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 16046, 134, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 230, 4, 305, 14849, 13, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 11, 797, 22993, 32293, 36, 34849, 314, 238, 7630, 118, 134, 38675, 3277, 36, 34849, 235, 43, 50, 4067, 7630, 118, 134, 11757, 19, 127, 338, 12, 7140, 565, 22993, 32293, 19, 21499, 23, 501, 29886, 506, 36, 29668, 235, 43, 8, 7630, 118, 134, 11757, 19, 121, 2336, 12, 4783, 338, 12, 7140, 565, 22993, 6214, 44131, 255, 571, 1640, 4825, 118, 4, 134, 35, 32302, 306, 7389, 19424, 246, 131, 121, 2336, 35, 500, 9763, 43, 338, 330, 32293, 4, 495, 4, 28256, 12257, 9, 775, 31, 36, 347, 322, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 381, 4, 305, 14849, 13, 16046, 134, 428, 11, 7630, 118, 134, 44550, 1168, 1696, 22993, 36, 6960, 43, 8, 7630, 118, 134, 2704, 121, 2336, 35, 4783, 338, 12, 7140, 565, 22993, 6214, 44131, 255, 571, 1640, 4825, 118, 4, 134, 35, 32302, 306, 7389, 19424, 246, 131, 121, 2336, 35, 500, 9763, 43, 338, 330, 32293, 36, 4070, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 16046, 134, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
dummy/PANELIZATION/0.1.1/train.jsonl
ADDED
@@ -0,0 +1 @@
|
|
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01203", ".", "\u0120Figure", "\u01203", ".", "B", ".", "\u0120Pl", "ots", "\u0120showing", "\u0120the", "\u0120distribution", "\u0120and", "\u0120relationship", "\u0120between", "\u0120the", "\u0120fractions", "\u0120of", "\u0120deposited", "\u0120or", "\u0120free", "\u0120U", "ra", "3", "p", ",", "\u0120its", "\u0120magnitude", "\u0120of", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120fitness", "\u0120(", "\u00ce\u00b1", "/", "\u00ce\u00b2", "/", "\u00ce\u00b3", ")", "\u0120and", "\u0120the", "\u0120selection", "\u0120coefficient", "\u0120(", "S", ")", "\u0120in", "\u0120different", "\u0120environments", ".", "\u0120C", ".", "\u0120Average", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120selection", "\u0120coefficient", "\u0120(", "left", ")", "\u0120and", "\u0120average", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120flu", "orescence", "\u0120(", "equ", "ivalent", "\u0120to", "\u0120the", "\u0120fraction", "al", "\u0120abundance", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120free", "\u0120protein", "\u0120in", "\u0120U", "RA", "3", "agg", ",", "\u0120right", ").", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 155, 4, 17965, 155, 4, 387, 4, 3037, 5992, 2018, 5, 3854, 8, 1291, 227, 5, 44807, 9, 24232, 50, 481, 121, 763, 246, 642, 6, 63, 11259, 9, 1683, 15, 5704, 36, 44721, 73, 47328, 73, 48381, 43, 8, 5, 4230, 45979, 36, 104, 43, 11, 430, 11534, 4, 230, 4, 8317, 9, 5, 4230, 45979, 36, 6960, 43, 8, 674, 9, 5, 44193, 366, 12589, 6626, 45094, 36, 8198, 32995, 7, 5, 13484, 337, 18225, 9, 5, 481, 8276, 11, 121, 4396, 246, 7165, 6, 235, 322, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
dummy/PANELIZATION/eval.jsonl
DELETED
@@ -1,2 +0,0 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01204", ".", "\u0120Fig", "\u01204", ":", "\u0120Pro", "te", "omics", "\u0120and", "\u0120metabol", "omics", "\u0120show", "\u0120enhanced", "\u0120rib", "os", "ome", "-", "\u0120and", "\u0120T", "CA", "/", "OX", "PH", "OS", "-", "\u0120activity", "\u0120in", "\u0120P", "ten", "Stat", "3", "pc", "-", "/-", "\u0120-", "m", "ice", "\u0120A", ".", "A", ".", "\u0120Different", "ially", "\u0120expressed", "\u0120proteins", "\u0120in", "\u0120P", "ten", "Stat", "3", "pc", "-", "/-", "\u0120vs", ".", "\u0120P", "ten", "pc", "-", "/-", "\u0120prote", "omic", "\u0120samples", ".", "\u0120Colors", "\u0120indicate", "\u0120adj", ".", "p", "-", "value", "\u0120and", "\u0120log", "2", "-", "FC", ".", "\u0120(", "Black", "\u0120=", "\u0120Log", "2", "-", "FC", "\u0120\u00e2\u012b\u00a4", "\u01201", "\u0120&", "\u0120adj", ".", "\u0120p", "-", "value", "\u0120\u00e2\u012b\u00a5", "\u01200", ".", "05", ",", "\u0120orange", "\u0120=", "\u0120Log", "2", "-", "FC", "\u0120>", "\u01201", "\u0120&", "\u0120adj", ".", "\u0120p", "-", "value", "\u0120\u00e2\u012b\u00a5", "\u01200", ".", "05", ",", "\u0120red", "\u0120=", "\u0120Log", "2", "-", "FC", "\u0120>", "\u01201", "\u0120&", "\u0120adj", ".", "\u0120p", "-", "value", "\u0120<", "\u01200", ".", "05", ").", "\u0120FC", "\u0120=", "\u0120fold", "\u0120change", ".", "\u0120B", ".", "\u0120STAT", "3", "\u0120immun", "oh", "ist", "ochemistry", "-", "\u0120st", "aining", "\u0120of", "\u0120wild", "\u0120type", ",", "\u0120P", "ten", "pc", "-", "/-", ",", "\u0120P", "ten", "Stat", "3", "pc", "-", "/-", "\u0120mouse", "\u0120prost", "ates", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", "\u0120=", "\u0120100", "\u00c2", "\u00b5", "m", ".", "\u0120E", ".", "\u0120Met", "abol", "ite", "\u0120concentrations", "\u0120in", "\u0120nm", "ol", "/", "\u00c2", "\u00b5", "g", "\u0120of", "\u01205", "\u0120metabolites", "\u0120in", "\u0120WT", ",", "\u0120P", "ten", "pc", "-", "/-", "\u0120and", "\u0120P", "ten", "Stat", "3", "pc", "-", "/-", "\u0120prost", "ates", ".", "\u0120Box", "-", "plot", "\u0120shows", "\u0120median", ",", "\u01201", "st", "\u0120and", "\u01203", "rd", "\u0120quart", "iles", ",", "\u0120and", "\u0120whisk", "ers", "\u0120extend", "\u0120to", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u01201", ".", "5", "\u0120inter", "quart", "ile", "\u0120range", ".", "\u0120J", "itter", "\u0120represents", "\u0120biological", "\u0120repl", "icates", ".", "\u0120AN", "OVA", "\u0120tests", "\u0120and", "\u0120Tu", "key", "\u0120multiple", "\u0120comparisons", "\u0120were", "\u0120applied", ".", "\u0120Red", "\u0120=", "\u0120P", "ten", "Stat", "3", "pc", "-", "/-", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01203", "),", "\u0120blue", "\u0120=", "\u0120P", "ten", "pc", "-", "/-", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01205", "),", "\u0120grey", "\u0120=", "\u0120wild", "\u0120type", "\u0120(", "WT", ",", "\u0120n", "=", "5", "),", "\u0120q", "\u0120=", "\u0120adj", ".", "\u0120p", ".-", "value", ",", "\u0120n", ".", "s", ".", "\u0120=", "\u0120not", "\u0120significant", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 204, 4, 20001, 204, 35, 1698, 859, 26382, 8, 41134, 26382, 311, 9094, 14966, 366, 4399, 12, 8, 255, 4054, 73, 37704, 7561, 3196, 12, 1940, 11, 221, 3869, 41706, 246, 17426, 12, 40398, 111, 119, 2463, 83, 4, 250, 4, 22248, 11416, 2327, 17792, 11, 221, 3869, 41706, 246, 17426, 12, 40398, 1954, 4, 221, 3869, 17426, 12, 40398, 27067, 30344, 7931, 4, 37780, 6364, 34703, 4, 642, 12, 19434, 8, 7425, 176, 12, 5268, 4, 36, 11368, 5457, 9359, 176, 12, 5268, 48623, 112, 359, 34703, 4, 181, 12, 19434, 46422, 321, 4, 2546, 6, 8978, 5457, 9359, 176, 12, 5268, 8061, 112, 359, 34703, 4, 181, 12, 19434, 46422, 321, 4, 2546, 6, 1275, 5457, 9359, 176, 12, 5268, 8061, 112, 359, 34703, 4, 181, 12, 19434, 28696, 321, 4, 2546, 322, 5429, 5457, 14789, 464, 4, 163, 4, 27023, 246, 13998, 2678, 661, 39917, 12, 1690, 8173, 9, 3418, 1907, 6, 221, 3869, 17426, 12, 40398, 6, 221, 3869, 41706, 246, 17426, 12, 40398, 18292, 22115, 1626, 4, 33256, 2003, 5457, 727, 4056, 8906, 119, 4, 381, 4, 4369, 34342, 1459, 26069, 11, 44834, 1168, 73, 4056, 8906, 571, 9, 195, 46380, 11, 19529, 6, 221, 3869, 17426, 12, 40398, 8, 221, 3869, 41706, 246, 17426, 12, 40398, 22115, 1626, 4, 7803, 12, 40776, 924, 9640, 6, 112, 620, 8, 155, 2586, 18284, 4755, 6, 8, 22879, 268, 4442, 7, 46710, 112, 4, 245, 3222, 45252, 1848, 1186, 4, 344, 7915, 3372, 12243, 19236, 23020, 4, 5102, 44320, 3457, 8, 9688, 5282, 1533, 17941, 58, 5049, 4, 1211, 5457, 221, 3869, 41706, 246, 17426, 12, 40398, 36, 282, 5457, 155, 238, 2440, 5457, 221, 3869, 17426, 12, 40398, 36, 282, 5457, 195, 238, 10521, 5457, 3418, 1907, 36, 25982, 6, 295, 5214, 245, 238, 2231, 5457, 34703, 4, 181, 3358, 19434, 6, 295, 4, 29, 4, 5457, 45, 1233, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01202", ".", "\u0120Figure", "\u01202", ".\"", "Far", "\u0120Western", "\"", "\u0120blot", "\u0120analyses", "\u0120of", "\u0120B", "ER", "\u0120protein", "\u0120interactions", ".", "\u0120Rec", "omb", "inant", "\u0120purified", "\u0120human", "\u0120TD", "G", "\u0120(", "10", "\u0120\u00c2\u00b5", "g", "),", "\u0120POL", "\u00c3\u0141", "\u0120(", "1", "\u0120\u00c2\u00b5", "g", "),", "\u0120AP", "E", "1", "\u0120(", "1", "\u0120\u00c2\u00b5", "g", "),", "\u0120and", "\u0120L", "IG", "III", "\u0120(", "1", "\u0120\u00c2\u00b5", "g", ")", "\u0120prob", "ed", "\u0120with", "\u0120X", "R", "CC", "1", "\u0120and", "\u0120X", "R", "CC", "1", "-", "S", "UM", "O", "\u0120(", "20", "\u0120\u00c2\u00b5", "g", ")", "\u0120and", "\u0120immune", "-", "stained", "\u0120for", "\u0120X", "R", "CC", "1", ".", "\u0120Immun", "ob", "lot", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120interactions", "\u0120of", "\u0120X", "R", "CC", "1", "\u0120and", "\u0120X", "R", "CC", "1", "-", "S", "UM", "O", "\u0120with", "\u0120endogenous", "\u0120TD", "G", ".", "\u0120Pur", "ified", "\u01206", "his", "X", "R", "CC", "1", "\u0120or", "\u0120in", "\u0120vitro", "\u0120modified", "\u0120and", "\u0120purified", "\u01206", "his", "X", "R", "CC", "1", "-", "S", "UM", "O", "\u0120was", "\u0120coupled", "\u0120to", "\u0120Ni", "-", "N", "TA", "\u0120ag", "ar", "ose", "\u0120and", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u0120m", "ES", "C", "\u0120extracts", ".", "\u0120Input", "\u0120(", "I", "),", "\u0120last", "\u0120wash", "\u0120(", "L", "W", ")", "\u0120and", "\u0120el", "ution", "\u0120(", "E", ")", "\u0120fractions", ".", "\u01200", ".", "5", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120TD", "G", "wt", ",", "\u0120were", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ated", "\u01205", "ca", "C", "\u0120substrate", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "5", "ca", "C", "\u0120DNA", ",", "\u01201", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", ")", "\u0120and", "\u0120hom", "od", "up", "lex", "\u0120competitor", "\u0120DNA", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "C", "\u0120DNA", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", ")", "\u0120and", "\u0120equ", "im", "olar", "\u0120amounts", "\u0120of", "\u0120X", "R", "CC", "1", ",", "\u0120POL", "\u00ce\u00b2", "\u0120and", "\u0120L", "IG", "III", "\u0120proteins", ".", "\u0120Sc", "hematic", "\u0120of", "\u0120bi", "otin", "-", "5", "ca", "C", "\u0120DNA", "\u0120substrate", "\u0120pull", "down", "\u0120experiment", ".", "\u01200", ".", "5", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120TD", "G", "wt", "\u0120or", "\u0120TD", "G", "cat", "\u0120(", "TD", "G", "(", "N", "140", "A", "))", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ated", "\u01205", "ca", "C", "\u0120substrate", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "5", "ca", "C", "\u0120DNA", ",", "\u01201", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", ")", "\u0120and", "\u0120hom", "od", "up", "lex", "\u0120competitor", "\u0120DNA", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "C", "\u0120DNA", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", ")", "\u0120as", "\u0120indicated", "\u0120and", "\u0120equ", "im", "olar", "\u0120amounts", "\u0120of", "\u0120X", "R", "CC", "1", "-", "S", "UM", "O", "\u0120(>", "50", "%", "\u0120SUM", "O", "yl", "ated", "),", "\u0120POL", "\u00ce\u00b2", "\u0120and", "\u0120L", "IG", "III", ".", "\u01201", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ated", "\u01205", "ca", "C", "\u0120substrate", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "5", "ca", "C", "\u0120DNA", ")", "\u0120and", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120hom", "od", "up", "lex", "\u0120competitor", "\u0120DNA", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "C", "\u0120DNA", ")", "\u0120were", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u0120X", "R", "CC", "1", "-", "S", "UM", "O", "\u0120(", "50", "%", "\u0120SUM", "O", "yl", "ated", ")", "\u0120and", "\u0120B", "ER", "\u0120proteins", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u01200", ".", "5", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120human", "\u0120TD", "G", "wt", "\u0120protein", "\u0120were", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u01201", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ated", "\u01205", "ca", "C", "\u0120substrate", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "5", "ca", "C", "\u0120DNA", "),", "\u01200", ".", "5", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120SUM", "O", "\u0120and", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "M", "\u0120hom", "od", "up", "lex", "\u0120competitor", "\u0120DNA", "\u0120(", "G", "\u00e2\u0122\u00a2", "C", "\u0120DNA", ")", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120is", "\u0120an", "\u0120immun", "ob", "lot", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TD", "G", "\u0120and", "\u0120free", "\u0120SUM", "O", ".", "\u0120\"", "Far", "\u0120Western", "\"", "\u0120blot", "\u0120analyses", "\u0120of", "\u0120TD", "G", "wt", "\u0120and", "\u0120TD", "GE", "310", "Q", "\u0120with", "\u01206", "his", "X", "R", "CC", "1", "\u0120and", "\u01206", "his", "X", "R", "CC", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 132, 4, 17965, 132, 72, 20680, 2027, 113, 39144, 20070, 9, 163, 2076, 8276, 11324, 4, 7382, 5223, 40542, 45238, 1050, 7463, 534, 36, 698, 44200, 571, 238, 22808, 7804, 36, 134, 44200, 571, 238, 1480, 717, 134, 36, 134, 44200, 571, 238, 8, 226, 5969, 24457, 36, 134, 44200, 571, 43, 16245, 196, 19, 1577, 500, 3376, 134, 8, 1577, 500, 3376, 134, 12, 104, 5725, 673, 36, 844, 44200, 571, 43, 8, 9161, 12, 42107, 13, 1577, 500, 3376, 134, 4, 29054, 2413, 17508, 1966, 9, 11324, 9, 1577, 500, 3376, 134, 8, 1577, 500, 3376, 134, 12, 104, 5725, 673, 19, 47670, 7463, 534, 4, 11834, 3786, 231, 12724, 1000, 500, 3376, 134, 50, 11, 42319, 10639, 8, 45238, 231, 12724, 1000, 500, 3376, 134, 12, 104, 5725, 673, 21, 11531, 7, 11568, 12, 487, 3847, 5951, 271, 3876, 8, 23125, 1070, 19, 475, 1723, 347, 36635, 4, 41327, 36, 100, 238, 94, 10397, 36, 574, 771, 43, 8, 1615, 15175, 36, 717, 43, 44807, 4, 321, 4, 245, 44200, 448, 7463, 534, 43192, 6, 58, 23125, 1070, 19, 4003, 1242, 47253, 1070, 195, 3245, 347, 44017, 36, 534, 21438, 245, 3245, 347, 5708, 6, 112, 44200, 448, 43, 8, 9486, 1630, 658, 14726, 11439, 5708, 36, 534, 21438, 347, 5708, 6, 158, 44200, 448, 43, 8, 4065, 757, 19231, 5353, 9, 1577, 500, 3376, 134, 6, 22808, 47328, 8, 226, 5969, 24457, 17792, 4, 2741, 47405, 9, 4003, 39467, 12, 245, 3245, 347, 5708, 44017, 2999, 3955, 9280, 4, 321, 4, 245, 44200, 448, 7463, 534, 43192, 50, 7463, 534, 8729, 36, 22615, 534, 1640, 487, 14753, 250, 35122, 23125, 1070, 19, 4003, 1242, 47253, 1070, 195, 3245, 347, 44017, 36, 534, 21438, 245, 3245, 347, 5708, 6, 112, 44200, 448, 43, 8, 9486, 1630, 658, 14726, 11439, 5708, 36, 534, 21438, 347, 5708, 6, 158, 44200, 448, 43, 25, 4658, 8, 4065, 757, 19231, 5353, 9, 1577, 500, 3376, 134, 12, 104, 5725, 673, 47529, 1096, 207, 29214, 673, 4360, 1070, 238, 22808, 47328, 8, 226, 5969, 24457, 4, 112, 44200, 448, 4003, 1242, 47253, 1070, 195, 3245, 347, 44017, 36, 534, 21438, 245, 3245, 347, 5708, 43, 8, 158, 44200, 448, 9486, 1630, 658, 14726, 11439, 5708, 36, 534, 21438, 347, 5708, 43, 58, 23125, 1070, 19, 1577, 500, 3376, 134, 12, 104, 5725, 673, 36, 1096, 207, 29214, 673, 4360, 1070, 43, 8, 163, 2076, 17792, 25, 4658, 4, 321, 4, 245, 44200, 448, 1050, 7463, 534, 43192, 8276, 58, 23125, 1070, 19, 112, 44200, 448, 4003, 1242, 47253, 1070, 195, 3245, 347, 44017, 36, 534, 21438, 245, 3245, 347, 5708, 238, 321, 4, 245, 44200, 448, 29214, 673, 8, 158, 44200, 448, 9486, 1630, 658, 14726, 11439, 5708, 36, 534, 21438, 347, 5708, 43, 25, 4658, 4, 840, 3355, 16, 41, 13998, 2413, 17508, 1966, 9, 7463, 534, 8, 481, 29214, 673, 4, 22, 20680, 2027, 113, 39144, 20070, 9, 7463, 534, 43192, 8, 7463, 8800, 23417, 1864, 19, 231, 12724, 1000, 500, 3376, 134, 8, 231, 12724, 1000, 500, 3376, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
|
|
|
dummy/PANELIZATION/test.jsonl
DELETED
@@ -1,2 +0,0 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01206", ".", "\u0120Figure", "\u01206", ":", "\u0120Comput", "ational", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120TC", "GA", "\u0120Provision", "al", "\u0120LI", "HC", "\u0120data", "\u0120set", "\u0120for", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120PID", "D", "os", "ome", "\u0120components", "\u0120reveals", "\u0120correlation", "\u0120with", "\u0120proliferation", "\u0120markers", ".(", "B", ")", "\u0120E", "2", "F", "\u0120target", "\u0120genes", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120analyzed", "\u0120for", "\u0120correlation", "\u0120with", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120CAS", "P", "2", ",", "\u0120RAID", "D", "\u0120and", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120using", "\u0120Spear", "man", "'s", "\u0120correlation", "\u0120coefficient", ".", "\u0120The", "\u0120central", "\u0120band", "\u0120represents", "\u0120the", "\u0120median", ",", "\u0120the", "\u0120boxes", "\u0120indicate", "\u0120the", "\u01202", "nd", "\u0120and", "\u01203", "rd", "\u0120quart", "ile", ",", "\u0120and", "\u0120the", "\u0120whisk", "ers", "\u0120are", "\u01201", ".", "5", "\u0120times", "\u0120the", "\u0120inter", "quart", "ile", "\u0120range", "\u0120(", "n", "=", "200", "\u0120genes", ").", "\u0120Cor", "relation", "\u0120(", "Pear", "son", ")", "\u0120of", "\u0120CAS", "P", "2", "\u0120mRNA", "\u0120with", "\u0120transcript", "\u0120levels", "\u0120of", "\u0120Ki", "67", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TC", "GA", "\u0120data", "\u0120set", ".", "\u0120Cor", "relation", "\u0120(", "Pear", "son", ")", "\u0120of", "\u0120RAID", "D", "\u0120and", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120mRNA", "\u0120with", "\u0120transcript", "\u0120levels", "\u0120of", "\u0120Ki", "67", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TC", "GA", "\u0120data", "\u0120set", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 231, 4, 17965, 231, 35, 34710, 5033, 1966, 9, 5, 21137, 4164, 36266, 337, 25709, 13459, 414, 278, 13, 8151, 9, 47102, 495, 366, 4399, 6411, 7441, 22792, 19, 24739, 22462, 21154, 387, 43, 381, 176, 597, 1002, 14819, 8151, 21, 13773, 13, 22792, 19, 8151, 9, 24775, 510, 176, 6, 44213, 495, 8, 47102, 495, 134, 634, 37828, 397, 18, 22792, 45979, 4, 20, 1353, 1971, 3372, 5, 9640, 6, 5, 7644, 6364, 5, 132, 1187, 8, 155, 2586, 18284, 1848, 6, 8, 5, 22879, 268, 32, 112, 4, 245, 498, 5, 3222, 45252, 1848, 1186, 36, 282, 5214, 2619, 14819, 322, 2812, 47114, 36, 42933, 1478, 43, 9, 24775, 510, 176, 47412, 19, 12348, 1389, 9, 11488, 4111, 11, 5, 21137, 4164, 414, 278, 4, 2812, 47114, 36, 42933, 1478, 43, 9, 44213, 495, 8, 47102, 495, 134, 47412, 19, 12348, 1389, 9, 11488, 4111, 11, 5, 21137, 4164, 414, 278, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01207", ".", "\u0120Figure", "\u01207", ".", "\u0120A", "\u0120Cort", "ical", "\u0120mouse", "\u0120neurons", "\u0120from", "\u0120t", "au", "\u0120knockout", "\u0120(", "KO", ")", "\u0120mice", "\u0120were", "\u0120serum", "-", "star", "ved", "\u0120in", "\u0120Hank", "'s", "\u0120balanced", "\u0120salt", "\u0120solution", "\u0120for", "\u01202", "\u0120hours", ".", "\u0120The", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120then", "\u0120im", "aged", "\u0120for", "\u0120Ni", "MA", ",", "\u0120after", "\u0120which", "\u0120insulin", "\u0120or", "\u0120amino", "\u0120acids", "\u0120were", "\u0120immediately", "\u0120added", ",", "\u0120and", "\u0120the", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120then", "\u0120im", "aged", "\u0120again", "\u012030", "\u0120minutes", "\u0120later", "\u0120Data", "\u0120information", ":", "\u0120Each", "\u0120colored", "\u0120lin", "\u0120refers", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120single", "\u0120field", "\u0120of", "\u0120view", "\u0120containing", "\u01202", "-", "15", "\u0120cells", ",", "\u0120and", "\u0120each", "\u0120pair", "\u0120of", "\u0120solid", "\u0120and", "\u0120dotted", "\u0120lines", "\u0120(", "same", "\u0120color", ")", "\u0120refers", "\u0120to", "\u0120the", "\u0120same", "\u0120field", "\u0120of", "\u0120view", ".", "\u0120Statistical", "\u0120analyses", "\u0120were", "\u0120performed", "\u0120using", "\u0120Student", "'s", "\u0120two", "-", "tailed", "\u0120unp", "aired", "\u0120t", "-", "test", "\u0120", "\u0120B", "\u0120Cort", "ical", "\u0120mouse", "\u0120neurons", "\u0120from", "\u0120t", "au", "\u0120KO", "\u0120mice", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120with", "\u0120A", "\u00ce\u00b2", "Os", "\u0120for", "\u012018", "\u0120hours", "\u0120before", "\u0120being", "\u0120serum", "-", "star", "ved", "\u0120in", "\u0120A", "\u00ce\u00b2", "O", "-", "containing", "\u0120Hank", "'s", "\u0120balanced", "\u0120salt", "\u0120solution", "\u0120for", "\u01202", "\u0120hours", ".", "\u0120The", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120then", "\u0120im", "aged", "\u0120for", "\u0120Ni", "MA", ",", "\u0120after", "\u0120which", "\u0120insulin", "\u0120was", "\u0120immediately", "\u0120added", ",", "\u0120and", "\u0120the", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120then", "\u0120im", "aged", "\u0120again", "\u012030", "\u0120minutes", "\u0120later", ".", "\u0120Note", "\u0120that", "\u0120Ni", "MA", "\u0120occurred", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120absence", "\u0120or", "\u0120presence", "\u0120of", "\u0120A", "\u00ce\u00b2", "Os", ",", "\u0120which", "\u0120inhibited", "\u0120Ni", "MA", "\u0120in", "\u0120wild", "\u0120type", "\u0120human", "\u0120neuron", "\u0120Data", "\u0120information", ":", "\u0120Each", "\u0120colored", "\u0120lin", "\u0120refers", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120single", "\u0120field", "\u0120of", "\u0120view", "\u0120containing", "\u01202", "-", "15", "\u0120cells", ",", "\u0120and", "\u0120each", "\u0120pair", "\u0120of", "\u0120solid", "\u0120and", "\u0120dotted", "\u0120lines", "\u0120(", "same", "\u0120color", ")", "\u0120refers", "\u0120to", "\u0120the", "\u0120same", "\u0120field", "\u0120of", "\u0120view", ".", "\u0120Statistical", "\u0120analyses", "\u0120were", "\u0120performed", "\u0120using", "\u0120Student", "'s", "\u0120two", "-", "tailed", "\u0120unp", "aired", "\u0120t", "-", "test", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 262, 4, 17965, 262, 4, 83, 16138, 3569, 18292, 28449, 31, 326, 1180, 14647, 36, 21738, 43, 15540, 58, 38994, 12, 3641, 5202, 11, 22216, 18, 9320, 6740, 2472, 13, 132, 722, 4, 20, 4590, 58, 172, 4356, 4628, 13, 11568, 5273, 6, 71, 61, 19391, 50, 37788, 27976, 58, 1320, 355, 6, 8, 5, 4590, 58, 172, 4356, 4628, 456, 389, 728, 423, 5423, 335, 35, 4028, 20585, 24248, 12859, 7, 10, 881, 882, 9, 1217, 8200, 132, 12, 996, 4590, 6, 8, 349, 1763, 9, 2705, 8, 30176, 2301, 36, 41690, 3195, 43, 12859, 7, 5, 276, 882, 9, 1217, 4, 41237, 20070, 58, 3744, 634, 9067, 18, 80, 12, 27970, 23089, 35016, 326, 12, 21959, 1437, 163, 16138, 3569, 18292, 28449, 31, 326, 1180, 24721, 15540, 58, 3032, 19, 83, 47328, 11078, 13, 504, 722, 137, 145, 38994, 12, 3641, 5202, 11, 83, 47328, 673, 12, 42480, 22216, 18, 9320, 6740, 2472, 13, 132, 722, 4, 20, 4590, 58, 172, 4356, 4628, 13, 11568, 5273, 6, 71, 61, 19391, 21, 1320, 355, 6, 8, 5, 4590, 58, 172, 4356, 4628, 456, 389, 728, 423, 4, 6068, 14, 11568, 5273, 2756, 11, 5, 5171, 50, 2621, 9, 83, 47328, 11078, 6, 61, 45427, 11568, 5273, 11, 3418, 1907, 1050, 44844, 5423, 335, 35, 4028, 20585, 24248, 12859, 7, 10, 881, 882, 9, 1217, 8200, 132, 12, 996, 4590, 6, 8, 349, 1763, 9, 2705, 8, 30176, 2301, 36, 41690, 3195, 43, 12859, 7, 5, 276, 882, 9, 1217, 4, 41237, 20070, 58, 3744, 634, 9067, 18, 80, 12, 27970, 23089, 35016, 326, 12, 21959, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-CELL", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "B-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-CELL", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "B-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
|
|
|
dummy/PANELIZATION/train.jsonl
DELETED
@@ -1,2 +0,0 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01203", ".", "\u0120Figure", "\u01203", ".", "In", "\u0120vitro", "\u0120pull", "-", "down", "\u0120of", "\u0120PH", "YA", "-", "C", "1", "\u0120(", "A", ")", "\u0120and", "\u0120PH", "Y", "B", "-", "C", "1", "\u0120(", "B", ")", "\u0120with", "\u0120CB", "F", "1", ".", "\u0120The", "\u0120His", "-", "tag", "ged", "\u0120PH", "YA", "/", "B", "-", "N", "\u0120(", "photos", "ens", "ory", "\u0120domain", "),", "\u0120PH", "YA", "/", "B", "-", "C", "1", "\u0120(", "P", "AS", "-", "related", "\u0120domain", "),", "\u0120and", "\u0120PH", "YA", "/", "B", "-", "C", "2", "\u0120(", "hist", "idine", "\u0120kin", "ase", "-", "related", "\u0120domain", ")", "\u0120proteins", "\u0120pulled", "\u0120down", "\u0120with", "\u0120GST", "-", "tag", "ged", "\u0120CB", "F", "1", "\u0120or", "\u0120GST", "\u0120were", "\u0120detected", "\u0120by", "\u0120anti", "-", "His", "\u0120antibody", ".", "\u0120Input", ",", "\u01206", "%", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120His", "-", "tag", "ged", "\u0120purified", "\u0120target", "\u0120proteins", "\u0120used", "\u0120in", "\u0120pull", "-", "down", "\u0120ass", "ays", ".", "\u0120LC", "I", "\u0120ass", "ays", "\u0120showing", "\u0120that", "\u0120CB", "F", "1", "\u0120interacted", "\u0120with", "\u0120ph", "y", "A", "\u0120in", "\u0120living", "\u0120plant", "\u0120cells", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", "\u0120=", "\u01201", "\u0120cm", ".", "\u0120D", ",", "\u0120E", "\u0120Co", "-", "IP", "\u0120ass", "ays", "\u0120showing", "\u0120that", "\u0120CB", "F", "1", "\u0120interacted", "\u0120with", "\u0120ph", "y", "A", "\u0120(", "D", ")", "\u0120and", "\u0120ph", "y", "B", "\u0120(", "E", ")", "\u0120in", "\u0120vivo", ".", "\u0120(", "D", ")", "\u0120hom", "ozyg", "ous", "\u0120CB", "F", "1", "-", "my", "c", "\u0120seed", "lings", "\u0120were", "\u0120first", "\u0120grown", "\u0120at", "\u012022", "\u00c2\u00b0", "C", "\u0120in", "\u0120continuous", "\u0120FR", "\u0120light", "\u0120for", "\u01204", "\u0120d", ",", "\u0120then", "\u0120the", "\u0120total", "\u0120proteins", "\u0120were", "\u0120extracted", "\u0120and", "\u0120subsequently", "\u0120treated", "\u0120with", "\u01205", "-", "min", "\u0120R", "\u0120light", ",", "\u0120or", "\u01205", "-", "min", "\u0120R", "\u0120light", "\u0120followed", "\u0120by", "\u01205", "-", "min", "\u0120FR", "\u0120light", "\u0120(", "R", "+", "FR", ")", "\u0120before", "\u0120immun", "op", "rec", "ip", "itation", ".", "\u0120(", "E", ")", "\u0120hom", "ozyg", "ous", "\u0120CB", "F", "1", "-", "my", "c", "\u0120seed", "lings", "\u0120were", "\u0120first", "\u0120grown", "\u0120at", "\u012022", "\u00c2\u00b0", "C", "\u0120in", "\u0120continuous", "\u0120R", "\u0120light", "\u0120for", "\u01204", "\u0120d", ",", "\u0120then", "\u0120the", "\u0120total", "\u0120proteins", "\u0120were", "\u0120extracted", "\u0120and", "\u0120subsequently", "\u0120treated", "\u0120with", "\u01205", "-", "min", "\u0120FR", "\u0120light", ",", "\u0120or", "\u01205", "-", "min", "\u0120FR", "\u0120light", "\u0120followed", "\u0120by", "\u01205", "-", "min", "\u0120R", "\u0120light", "\u0120(", "FR", "+", "R", ")", "\u0120before", "\u0120immun", "op", "rec", "ip", "itation", ".", "\u0120After", "\u0120light", "\u0120treatments", ",", "\u0120total", "\u0120proteins", "\u0120were", "\u0120incub", "ated", "\u0120with", "\u0120anti", "-", "c", "-", "my", "c", "\u0120Aff", "inity", "\u0120Gel", "\u0120(", "S", "igma", "-", "A", "ld", "rich", ").", "\u0120The", "\u0120total", "\u0120and", "\u0120precip", "itated", "\u0120proteins", "\u0120were", "\u0120examined", "\u0120by", "\u0120immun", "ob", "lot", "ting", "\u0120using", "\u0120antibodies", "\u0120against", "\u0120my", "c", ",", "\u0120ph", "y", "A", ",", "\u0120ph", "y", "B", ",", "\u0120and", "\u0120R", "PN", "6", ",", "\u0120respectively", ".", "\u0120The", "\u0120numbers", "\u0120below", "\u0120anti", "-", "phy", "A", "\u0120and", "\u0120anti", "-", "phy", "B", "\u0120bl", "ots", "\u0120indicate", "\u0120the", "\u0120relative", "\u0120band", "\u0120intens", "ities", "\u0120of", "\u0120co", "-", "pre", "c", "ip", "itated", "\u0120ph", "y", "A", "\u0120or", "\u0120ph", "y", "B", "\u0120normalized", "\u0120to", "\u0120those", "\u0120of", "\u0120precip", "itated", "\u0120CB", "F", "1", "-", "my", "c", ",", "\u0120respectively", ".", "\u0120The", "\u0120ratio", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120first", "\u0120clear", "\u0120band", "\u0120was", "\u0120set", "\u0120to", "\u0120100", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120blot", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 155, 4, 17965, 155, 4, 1121, 42319, 2999, 12, 3955, 9, 9715, 35205, 12, 347, 134, 36, 250, 43, 8, 9715, 975, 387, 12, 347, 134, 36, 387, 43, 19, 6933, 597, 134, 4, 20, 832, 12, 10058, 4462, 9715, 35205, 73, 387, 12, 487, 36, 40259, 1290, 4405, 11170, 238, 9715, 35205, 73, 387, 12, 347, 134, 36, 510, 2336, 12, 3368, 11170, 238, 8, 9715, 35205, 73, 387, 12, 347, 176, 36, 32001, 40314, 24438, 3175, 12, 3368, 11170, 43, 17792, 2468, 159, 19, 14162, 12, 10058, 4462, 6933, 597, 134, 50, 14162, 58, 12333, 30, 1475, 12, 9962, 34517, 4, 41327, 6, 231, 207, 9, 5, 832, 12, 10058, 4462, 45238, 1002, 17792, 341, 11, 2999, 12, 3955, 8446, 4113, 4, 24756, 100, 8446, 4113, 2018, 14, 6933, 597, 134, 34326, 19, 7843, 219, 250, 11, 1207, 2195, 4590, 4, 33256, 2003, 5457, 112, 25434, 4, 211, 6, 381, 944, 12, 3808, 8446, 4113, 2018, 14, 6933, 597, 134, 34326, 19, 7843, 219, 250, 36, 495, 43, 8, 7843, 219, 387, 36, 717, 43, 11, 43486, 4, 36, 495, 43, 9486, 48259, 1827, 6933, 597, 134, 12, 4783, 438, 5018, 16283, 58, 78, 3831, 23, 820, 12938, 347, 11, 11152, 7136, 1109, 13, 204, 385, 6, 172, 5, 746, 17792, 58, 27380, 8, 8960, 3032, 19, 195, 12, 4691, 248, 1109, 6, 50, 195, 12, 4691, 248, 1109, 1432, 30, 195, 12, 4691, 7136, 1109, 36, 500, 2744, 5499, 43, 137, 13998, 1517, 13139, 1588, 12257, 4, 36, 717, 43, 9486, 48259, 1827, 6933, 597, 134, 12, 4783, 438, 5018, 16283, 58, 78, 3831, 23, 820, 12938, 347, 11, 11152, 248, 1109, 13, 204, 385, 6, 172, 5, 746, 17792, 58, 27380, 8, 8960, 3032, 19, 195, 12, 4691, 7136, 1109, 6, 50, 195, 12, 4691, 7136, 1109, 1432, 30, 195, 12, 4691, 248, 1109, 36, 5499, 2744, 500, 43, 137, 13998, 1517, 13139, 1588, 12257, 4, 572, 1109, 8289, 6, 746, 17792, 58, 23125, 1070, 19, 1475, 12, 438, 12, 4783, 438, 11176, 16838, 23493, 36, 104, 34719, 12, 250, 4779, 5691, 322, 20, 746, 8, 20662, 15114, 17792, 58, 10543, 30, 13998, 2413, 17508, 2577, 634, 32648, 136, 127, 438, 6, 7843, 219, 250, 6, 7843, 219, 387, 6, 8, 248, 21824, 401, 6, 4067, 4, 20, 1530, 874, 1475, 12, 16628, 250, 8, 1475, 12, 16628, 387, 3089, 5992, 6364, 5, 5407, 1971, 18420, 2192, 9, 1029, 12, 5234, 438, 1588, 15114, 7843, 219, 250, 50, 7843, 219, 387, 35247, 7, 167, 9, 20662, 15114, 6933, 597, 134, 12, 4783, 438, 6, 4067, 4, 20, 1750, 9, 5, 78, 699, 1971, 21, 278, 7, 727, 13, 349, 39144, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-ORGANISM", "I-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-ORGANISM", "I-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01205", ".", "\u0120Figure", "\u01205", ":", "\u0120Human", "\u0120H", "CC", "\u0120tumors", "\u0120frequently", "\u0120up", "reg", "ulate", "\u0120CAS", "P", "2", "\u0120and", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120expression", "\u0120(", "A", ")", "\u0120Mat", "ched", "\u0120human", "\u0120patient", "\u0120non", "-", "t", "um", "or", "\u0120(", "NT", ")", "\u0120and", "\u0120tumor", "\u0120tissue", "\u0120(", "T", ")", "\u0120samples", "\u0120were", "\u0120analyzed", "\u0120by", "\u0120immun", "ob", "lot", "ting", "\u0120for", "\u0120CAS", "P", "2", ",", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120and", "\u0120RAID", "D", "\u0120on", "\u0120membranes", "\u0120a", "\u0120and", "\u0120b", ".(", "A", ")", "\u0120Mat", "ched", "\u0120human", "\u0120patient", "\u0120non", "-", "t", "um", "or", "\u0120(", "NT", ")", "\u0120and", "\u0120tumor", "\u0120tissue", "\u0120(", "T", ")", "\u0120samples", "\u0120were", "\u0120analyzed", "\u0120by", "\u0120immun", "ob", "lot", "ting", "\u0120for", "\u0120CAS", "P", "2", ",", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120and", "\u0120RAID", "D", "\u0120on", "\u0120membranes", "\u0120a", "\u0120and", "\u0120b", ".", "\u0120P", "once", "au", "S", "\u0120protein", "\u0120st", "aining", "\u0120serves", "\u0120as", "\u0120loading", "\u0120control", ".", "\u0120The", "\u0120aster", "isk", "\u0120refers", "\u0120to", "\u0120an", "\u0120un", "specific", "\u0120band", ",", "\u0120\"", "C", "\"", "\u0120and", "\u0120\"", "CC", "\"", "\u0120indicate", "\u0120the", "\u0120functionally", "\u0120active", "\u0120fragments", "\u0120of", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120generated", "\u0120by", "\u0120autop", "ro", "cess", "ing", ",", "\u0120PID", "D", "-", "C", "\u0120and", "\u0120PID", "D", "-", "CC", ".", "\u0120D", "ens", "it", "ometric", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120these", "\u0120bl", "ots", "\u0120is", "\u0120shown", "\u0120in", "\u0120Fig", ".", "\u0120EV", "4", "A", ".", "\u0120(", "B", ")", "\u0120mRNA", "\u0120expression", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120PID", "D", "os", "ome", "\u0120components", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TC", "GA", "\u0120Provision", "al", "\u0120LI", "HC", "\u0120data", "\u0120set", "\u0120across", "\u0120disease", "\u0120stages", ".", "\u0120Patients", "\u0120are", "\u0120divided", "\u0120based", "\u0120on", "\u0120the", "\u0120p", "53", "\u0120mutation", "/", "de", "let", "ion", "\u0120(", "mut", "/", "del", ")", "\u0120status", ".", "\u0120Statistical", "\u0120significance", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120using", "\u0120two", "-", "way", "\u0120AN", "OVA", "\u0120with", "\u0120Tu", "key", "'s", "\u0120post", "-", "h", "oc", "\u0120analysis", ".", "\u0120The", "\u0120central", "\u0120band", "\u0120represents", "\u0120the", "\u0120median", ",", "\u0120the", "\u0120boxes", "\u0120indicate", "\u0120the", "\u012025", "th", "\u0120and", "\u012075", "th", "\u0120percentile", ",", "\u0120the", "\u0120whisk", "ers", "\u0120are", "\u0120the", "\u01205", "th", "\u0120and", "\u012095", "th", "\u0120percent", "iles", ",", "\u0120statistical", "\u0120significance", "\u0120was", "\u0120defined", "\u0120as", "\u0120*", "\u0120p", "\u00e2\u012b", "\u00a4", "0", ".", "05", ",", "\u0120**", "\u0120p", "\u00e2\u012b", "\u00a4", "0", ".", "01", ".", "\u0120(", "C", ")", "\u0120The", "\u0120same", "\u0120data", "\u0120set", "\u0120was", "\u0120analyzed", "\u0120for", "\u0120rec", "urrence", "-", "free", "\u0120survival", "\u0120based", "\u0120on", "\u0120high", "\u0120or", "\u0120low", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120CAS", "P", "2", ",", "\u0120RAID", "D", "\u0120or", "\u0120PID", "D", "1", "\u0120divided", "\u0120at", "\u0120the", "\u0120median", ".", "\u0120Statistical", "\u0120significance", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120using", "\u0120a", "\u0120Log", "-", "rank", "\u0120test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 195, 4, 17965, 195, 35, 3861, 289, 3376, 23991, 5705, 62, 4950, 10246, 24775, 510, 176, 8, 47102, 495, 134, 8151, 36, 250, 43, 4101, 3804, 1050, 3186, 786, 12, 90, 783, 368, 36, 16966, 43, 8, 16570, 11576, 36, 565, 43, 7931, 58, 13773, 30, 13998, 2413, 17508, 2577, 13, 24775, 510, 176, 6, 47102, 495, 134, 8, 44213, 495, 15, 42037, 10, 8, 741, 21154, 250, 43, 4101, 3804, 1050, 3186, 786, 12, 90, 783, 368, 36, 16966, 43, 8, 16570, 11576, 36, 565, 43, 7931, 58, 13773, 30, 13998, 2413, 17508, 2577, 13, 24775, 510, 176, 6, 47102, 495, 134, 8, 44213, 495, 15, 42037, 10, 8, 741, 4, 221, 25252, 1180, 104, 8276, 1690, 8173, 4542, 25, 16761, 797, 4, 20, 44063, 6812, 12859, 7, 41, 542, 14175, 1971, 6, 22, 347, 113, 8, 22, 3376, 113, 6364, 5, 44659, 2171, 27958, 9, 47102, 495, 134, 5129, 30, 23434, 1001, 19348, 154, 6, 47102, 495, 12, 347, 8, 47102, 495, 12, 3376, 4, 211, 1290, 405, 22356, 24934, 5000, 9, 209, 3089, 5992, 16, 2343, 11, 20001, 4, 10210, 306, 250, 4, 36, 387, 43, 47412, 8151, 1966, 9, 5, 47102, 495, 366, 4399, 6411, 11, 5, 21137, 4164, 36266, 337, 25709, 13459, 414, 278, 420, 2199, 5612, 4, 21755, 32, 6408, 716, 15, 5, 181, 4540, 31425, 73, 2794, 2716, 1499, 36, 26121, 73, 10273, 43, 2194, 4, 41237, 11382, 21, 3030, 634, 80, 12, 1970, 5102, 44320, 19, 9688, 5282, 18, 618, 12, 298, 1975, 1966, 4, 20, 1353, 1971, 3372, 5, 9640, 6, 5, 7644, 6364, 5, 564, 212, 8, 3337, 212, 42097, 6, 5, 22879, 268, 32, 5, 195, 212, 8, 6164, 212, 135, 4755, 6, 17325, 11382, 21, 6533, 25, 1009, 181, 48054, 10470, 288, 4, 2546, 6, 13540, 181, 48054, 10470, 288, 4, 2663, 4, 36, 347, 43, 20, 276, 414, 278, 21, 13773, 13, 3872, 30904, 12, 3743, 7967, 716, 15, 239, 50, 614, 8151, 9, 24775, 510, 176, 6, 44213, 495, 50, 47102, 495, 134, 6408, 23, 5, 9640, 4, 41237, 11382, 21, 3030, 634, 10, 9359, 12, 40081, 1296, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
|
|
|
dummy/ROLES/0.0.1/eval.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "S", "V", "-", "A", "UC", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120(", "C", ")", "\u0120y", "T", "BP", "\u0120The", "\u0120experimental", "\u0120data", "\u0120were", "\u0120analyzed", "\u0120using", "\u0120the", "\u0120Sed", "fit", "\u0120program", "\u0120and", "\u0120are", "\u0120presented", "\u0120above", "\u0120molecular", "\u0120weights", "\u0120calculated", "\u0120using", "\u0120standards", "\u0120(", "in", "\u0120brackets", ").", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 104, 846, 12, 250, 12945, 1966, 9, 36, 347, 43, 1423, 565, 21792, 20, 14073, 414, 58, 13773, 634, 5, 17134, 14307, 586, 8, 32, 2633, 1065, 22481, 23341, 9658, 634, 2820, 36, 179, 29617, 322, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/ROLES/0.0.1/test.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "H", ")", "\u0120Representative", "\u0120western", "\u0120bl", "ots", "\u0120of", "\u0120HT", "T", "\u0120(", "ab", "-", "MA", "B", "5", "492", "),", "\u0120HT", "T", "\u0120p", "S", "13", "\u0120(", "ab", "-", "CH", "DI", "-", "900", "010", "39", "-", "1", ")", "\u0120in", "\u0120soluble", "\u0120fraction", "\u0120and", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120from", "\u0120HE", "K", "293", "T", "\u0120cells", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120first", "\u0120with", "\u0120HT", "Tex", "1", "\u012072", "Q", "\u0120e", "G", "FP", "\u0120and", "\u0120then", "\u0120after", "\u012048", "\u0120hour", "\u0120(", "to", "\u0120enable", "\u0120the", "\u0120formation", "\u0120of", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120before", "\u0120the", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", ");", "\u0120with", "\u0120TB", "K", "1", ";", "\u0120cells", "\u0120were", "\u0120l", "ys", "ed", "\u0120at", "\u0120the", "\u0120indicated", "\u0120time", "\u0120after", "\u0120kin", "ase", "\u0120trans", "fect", "ion", ".", "\u0120(", "I", ")", "\u0120Quant", "ification", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120percentage", "\u0120of", "\u0120cells", "\u0120presenting", "\u0120aggreg", "ates", "\u0120and", "\u0120kin", "ase", "\u0120expression", "\u0120from", "\u0120the", "\u0120experiments", "\u0120in", "\u0120H", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 725, 43, 10308, 4669, 3089, 5992, 9, 31445, 565, 36, 873, 12, 5273, 387, 245, 38852, 238, 31445, 565, 181, 104, 1558, 36, 873, 12, 3764, 10063, 12, 7784, 30583, 3416, 12, 134, 43, 11, 45132, 13484, 8, 26683, 1626, 31, 12925, 530, 32329, 565, 4590, 6214, 17706, 196, 78, 19, 31445, 40175, 134, 4801, 1864, 364, 534, 9763, 8, 172, 71, 2929, 1946, 36, 560, 3155, 5, 9285, 9, 26683, 1626, 137, 5, 24438, 3175, 8151, 4397, 19, 19009, 530, 134, 131, 4590, 58, 784, 2459, 196, 23, 5, 4658, 86, 71, 24438, 3175, 6214, 17706, 1499, 4, 36, 100, 43, 28256, 5000, 9, 5, 3164, 9, 4590, 10864, 26683, 1626, 8, 24438, 3175, 8151, 31, 5, 15491, 11, 289, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "I-CELL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
dummy/ROLES/0.0.1/train.jsonl
CHANGED
@@ -1,2 +1 @@
|
|
1 |
-
{"tokens": ["<s>", "
|
2 |
-
{"tokens": ["<s>", "(", "C", ")", "\u0120Adult", "\u0120TA", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120trans", "fect", "ed", "\u0120with", "\u0120DR", "P", "1", "\u0120and", "\u0120F", "is", "1", "\u0120together", "\u0120with", "\u0120d", ".", "n", ".", "AMP", "K", "\u0120or", "\u0120mock", "\u0120vector", ".", "\u0120Twelve", "\u0120days", "\u0120later", "\u0120muscles", "\u0120were", "\u0120collected", "\u0120and", "\u0120cross", "\u00e2\u0122\u0132", "sectional", "\u0120area", "\u0120was", "\u0120quant", "ified", "\u0120(*", "P", "0", ".", "001", ")", "\u0120n", "=", "400", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 347, 43, 20395, 16667, 14357, 58, 6214, 17706, 196, 19, 10994, 510, 134, 8, 274, 354, 134, 561, 19, 385, 4, 282, 4, 20014, 530, 50, 16177, 37681, 4, 24252, 360, 423, 14357, 58, 4786, 8, 2116, 39497, 46523, 443, 21, 24934, 3786, 43305, 510, 288, 4, 19089, 43, 295, 5214, 4017, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
|
1 |
+
{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}
|
|
sd_figs.zip
CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
-
oid sha256:
|
3 |
-
size
|
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:a2b41ac167b5a8f1408f2af577ccd86049dce0211c1f742fd61d6233bddb5631
|
3 |
+
size 16286918
|
sd_panels.zip
CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
-
oid sha256:
|
3 |
-
size
|
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:45e9b09acd2238d71b07fcf0f33428d8b51a2dcfd476aaa760acf41d6d21cf4b
|
3 |
+
size 22501489
|